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一个控制水稻分蘖角度主效QTL TAC8的精细定位及候选基因分析

摘要第5-6页
abstract第6-7页
英文缩略表第14-16页
第一章 文献综述第16-35页
    1.1 水稻理想株型的概念第16页
    1.2 理想株型的育种实践第16-17页
    1.3 水稻理想株型栽培和生理方面的研究第17-18页
    1.4 部分重要株型相关遗传学研究第18-34页
        1.4.1 水稻株高遗传学的研究第18-20页
            1.4.1.1 水稻株高QTL的研究第18页
            1.4.1.2 水稻株高基因的克隆第18-20页
        1.4.2 水稻穗型遗传学的研究第20-28页
            1.4.2.1 水稻穗型QTLs定位第20-24页
            1.4.2.2 水稻穗型基因的克隆第24-28页
        1.4.3 水稻分蘖数的遗传学研究第28-31页
            1.4.3.1 水稻分蘖数的QTL定位第28页
            1.4.3.2 水稻分蘖基因的定位和克隆第28-31页
        1.4.4 水稻分蘖角度遗传学的研究第31-34页
            1.4.4.1 水稻分蘖角度的定义第31页
            1.4.4.2 水稻植株分蘖角度的QTL分析第31-32页
            1.4.4.3 影响水稻分蘖角度的主基因研究第32-34页
    1.5 本研究的意义第34-35页
第二章 水稻分蘖角度相关QTL定位第35-44页
    2.1 材料与方法第35页
        2.1.1 实验材料第35页
    2.2 实验方法第35-37页
        2.2.1 种植方式第35页
        2.2.2 分蘖角度测定第35-36页
        2.2.3 DNA提取第36页
        2.2.4 PCR反应第36页
        2.2.5 非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)第36-37页
        2.2.6 数据分析第37页
        2.2.7 分蘖角度QTL分析第37页
    2.3 实验结果第37-42页
        2.3.1 RIL群体及亲本表型的分布情况第37-38页
        2.3.2 分蘖角度QTL分析第38-39页
        2.3.3 TAC8的初步定位第39-41页
        2.3.4 TAC8与TAC9的遗传关系研究第41-42页
    2.4 小结第42-44页
第三章 TAC8的表型分析第44-48页
    3.1 材料和方法第44页
        3.1.1 供试材料第44页
        3.1.2 田间种植第44页
        3.1.3 表型考察第44页
        3.1.4 统计与图表分析第44页
    3.2 实验结果第44-46页
        3.2.1 TAC8对分蘖角度以及一些相关产量性状的影响第44-46页
        3.2.2 不同密度下TAC8对分蘖角度以及一些相关产量性状的影响第46页
    3.3 小结第46-48页
第四章 TAC8精细定位,候选基因分析及相关载体的构建第48-59页
    4.1 材料和方法第48-52页
        4.1.1 供试材料第48页
        4.1.2 田间种植第48-49页
        4.1.3 DNA提取第49页
        4.1.4 分子标记检测第49页
        4.1.5 SSR标记的选择及引物设计第49页
        4.1.6 候选基因预测及测序分析第49-51页
        4.1.7 表达模式分析第51-52页
    4.2 结果与分析第52-56页
        4.2.1 TAC8的精细定位第52-54页
        4.2.2 TAC8基因候选第54-55页
        4.2.3 TAC8的表达分析第55-56页
    4.3 TAC8相关表达载体的构建第56-57页
        4.3.1 TAC8过表达载体的构建第56页
        4.3.2 TAC8基因互补载体的构建第56页
        4.3.3 TAC8基因干扰载体的构建第56-57页
    4.4 小结第57-59页
第五章 NIL(TAC8)和NIL(tac8)数字表达谱分析第59-68页
    5.1 材料和方法第59页
        5.1.1 实验材料第59页
        5.1.2 cDNA文库的构建以及测序第59页
        5.1.3 数据分析第59页
        5.1.4 荧光定量PCR验证第59页
    5.2 结果与分析第59-66页
        5.2.1 测序质量分析第59-60页
        5.2.2 NIL(TAC8)和NIL(tac8)中Unique reads的转录本表达量分析第60-61页
        5.2.3 NIL(TAC8)和NIL(tac8)的差异表达基因分析第61-62页
        5.2.4 差异基因GO富集性分析第62-63页
        5.2.5 差异表达基因的KEGG富集性分析第63-65页
        5.2.6 差异表达基因的Real-time qPCR验证第65-66页
    5.3 小结第66-68页
第六章 全文结论第68-71页
参考文献第71-83页
附录第83-85页
附图第85-87页
致谢第87-88页
作者简历第88页

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