| 摘要 | 第4-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 第1章 绪论 | 第13-25页 |
| 1.1 耗散粒子动力学概述 | 第13-14页 |
| 1.2 静电相互作用计算的发展 | 第14-16页 |
| 1.3 Ewald加和方法 | 第16-19页 |
| 1.4 基于CUDA架构的高性能计算介绍 | 第19-22页 |
| 1.5 本论文研究目的和内容 | 第22-25页 |
| 第2章 基于格点的非均匀快速傅里叶变换的计算方法 | 第25-41页 |
| 2.1 引言 | 第25页 |
| 2.2 NFFT介绍 | 第25-28页 |
| 2.3 基于格点的NFFT算法推导 | 第28-37页 |
| 2.3.1 非均匀傅里叶正变换 | 第28-34页 |
| 2.3.2 非均匀傅里叶逆变换 | 第34-37页 |
| 2.4 近似误差和窗函数 | 第37-41页 |
| 第3章 基于格点的非均匀快速傅里叶变换的实现 | 第41-61页 |
| 3.1 引言 | 第41-42页 |
| 3.2 NFFT的实现（CPU版本） | 第42-45页 |
| 3.2.1 非均匀傅里叶正变换 | 第42-44页 |
| 3.2.2 非均匀傅里叶逆变换 | 第44-45页 |
| 3.3 CUNFFT的实现（GPU版本） | 第45-55页 |
| 3.3.1 非均匀傅里叶正变换 | 第45-52页 |
| 3.3.2 非均匀傅里叶逆变换 | 第52-55页 |
| 3.4 精度和性能测试 | 第55-59页 |
| 3.4.1 精度测试 | 第55-56页 |
| 3.4.2 性能测试 | 第56-59页 |
| 3.5 本章小结 | 第59-61页 |
| 第4章 基于ENUF的静电相互作用的GPU加速算法 | 第61-85页 |
| 4.1 引言 | 第61-62页 |
| 4.2 静电相互作用的实空间加速计算 | 第62-70页 |
| 4.3 静电相互作用的倒易空间加速计算 | 第70-73页 |
| 4.4 计算精度和性能测试 | 第73-82页 |
| 4.4.1 精度测试 | 第73-80页 |
| 4.4.2 性能测试 | 第80-82页 |
| 4.5 本章小结 | 第82-85页 |
| 第5章 聚电解质链和两性离子聚合物溶液行为的研究 | 第85-107页 |
| 5.1 引言 | 第85-86页 |
| 5.2 分子动力学模拟方法 | 第86-89页 |
| 5.2.1 传统的DPD模拟方法 | 第86-87页 |
| 5.2.2 含静电相互作用的DPD模拟方法 | 第87-89页 |
| 5.3 聚电解质溶液行为的研究 | 第89-92页 |
| 5.4 两性离子聚合物溶液行为的研究 | 第92-104页 |
| 5.4.1 研究内容介绍 | 第92-94页 |
| 5.4.2 PMPC和PMBP粗粒化模型的构建 | 第94-95页 |
| 5.4.3 模拟结果和讨论 | 第95-104页 |
| 5.5 本章小结 | 第104-107页 |
| 参考文献 | 第107-117页 |
| 作者简介和博士期间发表论文情况 | 第117-119页 |
| 致谢 | 第119-120页 |
| 基金 | 第120页 |