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家蚕部分变态发育过程中基因表达变化规律的分析

摘要第1-6页
Abstract第6-11页
缩略词第11-12页
第一章 引言第12-29页
   ·家蚕变态发育的激素调控第12-17页
     ·家蚕变态发育第12-13页
     ·变态发育相关激素第13-17页
   ·家蚕滞育的研究第17-19页
     ·滞育的发生第17页
     ·滞育的解除第17-18页
     ·家蚕滞育的调控第18页
     ·家蚕滞育的研究现状第18-19页
   ·家蚕眠性的研究第19-21页
     ·家蚕的眠性第19-20页
     ·家蚕三眠蚕的研究现状第20-21页
   ·家蚕翅的研究第21-23页
     ·翅的发育第21-22页
     ·家蚕无鳞翅突变体scaleless的研究现状第22-23页
   ·家蚕30K基因家族的研究第23-25页
     ·家蚕30K基因第23-24页
     ·家蚕30K基因的功能第24-25页
     ·家蚕30K基因家族的成员第25页
   ·第二代测序技术第25-27页
     ·第二代测序技术简述第25-26页
     ·第二代测序技术的应用第26-27页
   ·本研究的目的和意义第27-29页
     ·研究目的第27-28页
     ·研究意义第28-29页
第二章 材料与方法第29-39页
   ·实验材料第29-31页
     ·家蚕品种的选择第29-30页
     ·主要试剂及溶液的配制第30-31页
     ·本研究所用引物第31页
   ·实验方法第31-39页
     ·Solution D法抽提家蚕滞育卵胚子总RNA第31-32页
     ·家蚕组织的解剖第32页
     ·总RNA的提取第32-33页
     ·用于RNA-seq的RNA样品定量和质量评估第33页
     ·cDNA文库的构建和RNA-seq第33-34页
     ·差异基因的分析第34页
     ·cDNA第一链合成第34-35页
     ·RT-PCR检测第35页
     ·实时荧光定量PCR(Realtime Quantitative PCR,Q-PCR)第35-36页
     ·本地家蚕转录组数据库的构建第36页
     ·家蚕30K基因家族的鉴定和进化分析第36-37页
     ·家蚕血淋巴的SDS-PAGE第37页
     ·蛋白质的质谱鉴定第37-39页
第三章 家蚕维持滞育状态的分子机制探讨第39-51页
   ·结果第39-47页
     ·家蚕滞育卵胚子的Illumina RNA-seq第39-42页
     ·家蚕滞育卵胚子与活化组织的差异表达基因第42-43页
     ·差异表达基因的GO富集和KEGG pathway富集分析第43-45页
     ·滞育卵胚子中可变剪接事件分析第45-47页
   ·讨论第47-51页
     ·家蚕滞育期间基因表达第47页
     ·家蚕滞育期间发挥重要作用的基因第47-49页
     ·家蚕滞育期间发挥重要作用的Pathways第49-51页
第四章 家蚕幼虫发育提前进入化蛹变态发育的机制探讨第51-65页
   ·结果第51-62页
     ·三眠蚕和二眠蚕前胸腺的RNA-seq第51-53页
     ·同一蚕品种不同眠性间的熟蚕前胸腺的基因表达差异第53-54页
     ·三眠蚕幼虫化蛹变态发育时前胸腺的基因表达变化第54-57页
     ·三眠蚕早熟变态时前胸腺的基因表达差异第57-60页
     ·主要差异表达基因mRNA水平的Q-PCR分析第60-62页
   ·讨论第62-65页
     ·眠性改变对蚕的基因表达谱影响第62页
     ·三眠蚕化蛹过程的机制探讨第62页
     ·三眠蚕早熟变态的机制探讨第62-65页
第五章 家蚕化蛹期间鳞片的发育机制探讨第65-83页
   ·结果第65-79页
     ·质谱鉴定结果第65-66页
     ·家蚕WT翅原基发育过程中的蛋白变化模式第66页
     ·家蚕WT与SL翅原基蛋白质的差异分析第66-67页
     ·差异基因的Q-PCR验证第67-68页
     ·家蚕WT与SL翅原基RNA的DGE测序第68-70页
     ·家蚕WT与SL翅原基的基因表达差异第70-74页
     ·低温处理前后SL的翅原基基因表达变化第74-78页
     ·主要差异表达基因的Q-PCR验证第78-79页
   ·讨论第79-83页
     ·鳞片发育与表皮蛋白的关系第79-80页
     ·鳞片发育与气管分支的关系第80页
     ·鳞片发育与细胞过度凋亡的关系第80-81页
     ·SL中缺氧导致的应激反应第81页
     ·低温诱导使SL鳞片数目增多的可能机制第81-83页
第六章 基于家蚕转录组数据库鉴定家蚕30K基因家族第83-95页
   ·结果第83-92页
     ·检索到的30K蛋白基因家族第83页
     ·家蚕30K家族蛋白的多序列比对和进化分析第83-89页
     ·家蚕30K蛋白基因家族的表达时相第89-91页
     ·30K蛋白的质谱结果分析第91-92页
   ·讨论第92-95页
第七章 结论与展望第95-97页
   ·结论第95页
   ·展望第95-97页
参考文献第97-110页
附表1 本研究用到的所有引物序列第110-112页
附表2 家蚕翅原基蛋白的质谱鉴定第112-126页
致谢第126-128页
作者简介第128页

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