| 中文摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-43页 |
| 1. 图位克隆技术在水稻基因定位和克隆中的应用 | 第14-18页 |
| 2. 水稻抗褐飞虱基因研究进展 | 第18-20页 |
| 3. 水稻根系的研究进展 | 第20-25页 |
| ·水稻中影响根发育的突变体研究 | 第21-23页 |
| ·冠根起始和发育的基因调控 | 第23-25页 |
| 4. 水稻的分蘖 | 第25-28页 |
| ·水稻分蘖的分化生长 | 第25-26页 |
| ·水稻分蘖研究现状 | 第26-28页 |
| 5. 水稻茎及其伸长 | 第28-33页 |
| ·节间伸长模式 | 第28-29页 |
| ·水稻茎伸长的调控 | 第29-33页 |
| 6. 糖在植物生长发育中的作用 | 第33-42页 |
| ·淀粉与蔗糖的合成及分解 | 第33-35页 |
| ·同化物运输的形式 | 第35页 |
| ·糖控制的生长发育及其基因表达 | 第35-42页 |
| ·种子的发育和萌发 | 第35-37页 |
| ·在幼苗发育早期糖和激素信号 | 第37-38页 |
| ·营养生长和生殖发育 | 第38-40页 |
| ·衰老与胁迫 | 第40-41页 |
| ·糖饥饿 | 第41-42页 |
| 7. 本研究的目的与意义 | 第42-43页 |
| 第二章 水稻抗褐飞虱基因Bph14的精细定位 | 第43-70页 |
| 1. 材料 | 第43-44页 |
| ·亲本材料 | 第43-44页 |
| ·遗传分析群体 | 第44页 |
| ·褐飞虱虫源 | 第44页 |
| ·RFLP分子标记 | 第44页 |
| 2. 实验方法 | 第44-48页 |
| ·标准苗期集团法鉴定选系群体对褐飞虱的抗性 | 第44-45页 |
| ·分子标记辅助选择方法分析选系群体 | 第45-46页 |
| ·选系亲本RI35、RI113的遗传背景分析 | 第45页 |
| ·分离群体分组分析法分析 | 第45-46页 |
| ·携带单个Bph14位点的重组单株的筛选及目标区段的基因型分析 | 第46页 |
| ·分子标记的设计与分析 | 第46-48页 |
| ·SSR标记的设计 | 第46-47页 |
| ·已公布标记的利用 | 第46页 |
| ·新SSR标记的开发 | 第46-47页 |
| ·STS标记的设计 | 第47页 |
| ·InDel标记的设计 | 第47页 |
| ·SSR、STS、InDel标记分析 | 第47-48页 |
| 3. 结果与分析 | 第48-66页 |
| ·携带Bph14单个位点单株的筛选 | 第48-53页 |
| ·选系亲本RI35、RI113遗传背景分析 | 第48-52页 |
| ·携带Bph14单个位点的单株的筛选 | 第52-53页 |
| ·目标染色体区段遗传连锁图谱的构建 | 第53-56页 |
| ·分子标记的设计 | 第53-55页 |
| ·目标染色体区段的遗传连锁图谱的构建 | 第55-56页 |
| ·极端群体—隐性群法寻找与Bph14紧密连锁的分子标记 | 第56-62页 |
| ·用于构建B群体的选系亲本SA55、SA73的特点 | 第56页 |
| ·分离群体分组分析法分析 | 第56-60页 |
| ·隐性群法分析 | 第60-62页 |
| ·Bph14精细位置分析 | 第62-66页 |
| 4. 日本晴克隆OSJNBb0096M04的基因预测分析 | 第66-69页 |
| 5. 结论 | 第69-70页 |
| 第三章 水稻蔗糖饥饿敏感突变体的鉴定与分析 | 第70-100页 |
| 1. 材料 | 第70页 |
| 2. 方法 | 第70-75页 |
| ·突变体的表型鉴定 | 第70-71页 |
| ·用具的准备 | 第70-71页 |
| ·表型鉴定 | 第71页 |
| ·突变体性状考察 | 第71页 |
| ·遗传分析 | 第71-72页 |
| ·自交分析 | 第71页 |
| ·杂交分析 | 第71-72页 |
| ·基因的初步定位 | 第72页 |
| ·DNA的提取 | 第72页 |
| ·SSR分子标记的设计 | 第72页 |
| ·基因型分析 | 第72页 |
| ·胚后发育事件分析 | 第72-73页 |
| ·用具准备 | 第72-73页 |
| ·生长受抑制时间的确立 | 第73页 |
| ·孚尔根(Feulgen)染色分析 | 第73页 |
| ·溶液配制 | 第73页 |
| ·孚尔根染色 | 第73页 |
| ·生理分析 | 第73-75页 |
| ·茎背地性分析 | 第73-74页 |
| ·黑暗处理 | 第74页 |
| ·激素处理 | 第74页 |
| ·1/2 MS全营养培养基的配制 | 第74页 |
| ·1/2 MS营养缺陷培养基的配制 | 第74页 |
| ·培养材料的灭菌与接种 | 第74-75页 |
| 3. 结果与分析 | 第75-99页 |
| ·突变体的分离 | 第75页 |
| ·突变体的性状特征 | 第75-79页 |
| ·节间长度 | 第75-76页 |
| ·各性状特征 | 第76-79页 |
| ·株型性状 | 第76-77页 |
| ·主要经济性状 | 第77-79页 |
| ·遗传分析 | 第79-80页 |
| ·自交分析 | 第79页 |
| ·杂交分析 | 第79-80页 |
| ·基因的初步定位 | 第80-88页 |
| ·分离群体分组分析法分析 | 第80页 |
| ·分子标记的设计 | 第80-81页 |
| ·RM72邻侧区域遗传图谱的构建 | 第81-83页 |
| ·663株RT70-7自交后代在RM72邻侧区域的交换事件分析 | 第83-84页 |
| ·RM22763与RM22837之间的交换事件分析 | 第84-86页 |
| ·后代检测当代表型法进行遗传及基因定位验证 | 第86-88页 |
| ·胚后发育事件分析 | 第88-90页 |
| ·突变体根和幼苗在最初14天的生长 | 第88-89页 |
| ·孚尔根染色观察 | 第89-90页 |
| ·生理分析 | 第90-99页 |
| ·茎背地性分析 | 第90页 |
| ·黑暗处理 | 第90-91页 |
| ·激素处理 | 第91页 |
| ·1/2 MS培养基营养缺陷分析 | 第91-92页 |
| ·糖溶液对突变体根伸长的影响 | 第92-95页 |
| ·蔗糖、葡萄糖和果糖水溶液对突变体植株幼苗生长的影响 | 第95-96页 |
| ·1/2 MS培养基中糖对突变体生长的影响 | 第96-97页 |
| ·地上部分与根之间营养供给关系 | 第97-98页 |
| ·糖对分蘖的影响 | 第98-99页 |
| 4. 结论 | 第99-100页 |
| 第四章 总讨论 | 第100-112页 |
| 1. 生物信息学在水稻基因图位克隆中的应用 | 第100-101页 |
| 2. 分子标记在图位克隆中的应用 | 第101-102页 |
| 3. 基因纯合在图位克隆中的应用 | 第102-103页 |
| 4. 数量性状基因的基因克隆 | 第103页 |
| 5. 极端集团—隐性群法在图位克隆中的应用 | 第103-104页 |
| 6. Bph14精细位置的确定 | 第104-106页 |
| 7. Bph14精细定位群体的构建 | 第106-109页 |
| 8. 地上部分与地下部分营养供给之间的关系 | 第109页 |
| 9. 起实际效应作用的糖 | 第109-110页 |
| 10. 蔗糖对突变体根的伸长、株高及分蘖的影响 | 第110-111页 |
| 11. 基因的多效性 | 第111-112页 |
| 参考文献 | 第112-131页 |
| 附录I 实验室常用Protocol及所用溶液配方 | 第131-136页 |
| Protocol 1:CTAB法小量抽取水稻DNA(用于PCR分析) | 第131页 |
| Protocol 2:PAGE胶操作流程及试剂 | 第131-132页 |
| Protocol 3:CTAB法大量制备水稻总DNA(用于Southern分析) | 第132-133页 |
| Protocol 4:DNA的限制性消化,电泳与Southern转移 | 第133-134页 |
| Protocol 5:探针标记 | 第134页 |
| Protocol 6:Southern杂交 | 第134-135页 |
| Protocol 7:洗膜,压片及膜的再生 | 第135-136页 |
| 附录Ⅱ 实验室部分溶液配方 | 第136-137页 |
| 1. EDTA(0.5M,pH 8.0):1 Liter | 第136页 |
| 2. 1/2 MS培养基的成分用量及母液的配制换算 | 第136-137页 |
| 附录Ⅲ 博士在读期间发表的论文 | 第137-138页 |
| 致谢 | 第138页 |
