| 摘要 | 第1-11页 |
| ABSTRACT | 第11-14页 |
| 符号说明 | 第14-17页 |
| 第一章 文献综述 | 第17-61页 |
| ·链霉菌简介 | 第17-24页 |
| ·链霉菌及其形态分化 | 第17-19页 |
| ·链霉菌的遗传物质 | 第19-23页 |
| ·链霉菌的应用价值 | 第23-24页 |
| ·抗生素的生物合成 | 第24-34页 |
| ·抗生素的种类 | 第24-26页 |
| ·聚酮类化合物 | 第26-27页 |
| ·阿维菌素的生物合成 | 第27-34页 |
| ·聚酮合成酶的底物选择 | 第34-39页 |
| ·PKS 起始碳单元的选择 | 第34-35页 |
| ·PKS 延伸碳单元的选择 | 第35-36页 |
| ·生物信息学法分析 PKS 的模块结构和底物专一性 | 第36-39页 |
| ·链霉菌 A 因子调控系统 | 第39-45页 |
| ·A 因子简介 | 第39-42页 |
| ·A 因子依赖蛋白 AdpA | 第42-45页 |
| ·南昌链霉菌简介 | 第45-61页 |
| ·南昌链霉菌及其次生代谢产物 | 第45-49页 |
| ·南昌霉素生物合成基因簇 | 第49-54页 |
| ·南寡霉素生物合成基因簇 | 第54-57页 |
| ·梅岭霉素生物合成基因簇的前期克隆 | 第57-61页 |
| 第二章 材料与方法 | 第61-78页 |
| ·实验材料 | 第61-71页 |
| ·菌株 | 第61-63页 |
| ·质粒 | 第63-68页 |
| ·培养基和化学试剂 | 第68-71页 |
| ·试验方法 | 第71-78页 |
| 第三章 递缩法 PCR 调取抗生素生物合成基因簇 | 第78-86页 |
| ·前言 | 第78页 |
| ·结果与分析 | 第78-85页 |
| ·递缩法 PCR 简介 | 第78-80页 |
| ·以 aveBI 为目标基因的调取过程 | 第80-82页 |
| ·每板混合质粒为模板 | 第80页 |
| ·以每排混合质粒为模板 | 第80页 |
| ·菌落 PCR | 第80-82页 |
| ·调取其他阳性克隆 | 第82页 |
| ·根据 aveR 序列设计引物调取 | 第82页 |
| ·根据 aveC 序列设计的引物调取 | 第82页 |
| ·阳性科斯质粒的限制性内切酶酶谱分析 | 第82-85页 |
| ·小结与讨论 | 第85-86页 |
| 第四章 双功能质粒 pJTU1278 和 pJTU1289 的构建 | 第86-99页 |
| ·前言 | 第86-87页 |
| ·结果与分析 | 第87-97页 |
| ·pJTU1275 的构建 | 第90-91页 |
| ·pJTU1276 的构建 | 第91-92页 |
| ·pJTU1277 的构建 | 第92-93页 |
| ·pJTU1278 的构建 | 第93-94页 |
| ·pJTU1289 的构建 | 第94-95页 |
| ·pJTU1289 在阿维链霉菌中的应用 | 第95-97页 |
| ·小结与讨论 | 第97-99页 |
| 第五章 梅岭霉素的结构鉴定 | 第99-113页 |
| ·前言 | 第99页 |
| ·结果与分析 | 第99-112页 |
| ·梅岭霉素的 LC-MS 分析 | 第99-100页 |
| ·梅岭霉素的分离与纯化 | 第100-101页 |
| ·梅岭霉素的结构鉴定 | 第101-110页 |
| ·梅岭霉素的结构分析 | 第110-112页 |
| ·小结与讨论 | 第112-113页 |
| 第六章 梅岭霉素生物合成基因簇的克隆 | 第113-206页 |
| ·前言 | 第113页 |
| ·结果与分析 | 第113-205页 |
| ·已克隆基因簇的验证 | 第113-118页 |
| ·染色体步移法寻找梅岭霉素生物合成基因簇相关基因 | 第118-147页 |
| ·南昌链霉菌 3 号基因组文库的构建 | 第118-120页 |
| ·已测序区域的染色体步移验证 | 第120-129页 |
| ·向已测序区域左侧步移 | 第129-133页 |
| ·已测序区域左侧的大片段缺失验证 | 第133-138页 |
| ·向已测序区域右侧步移 | 第138-142页 |
| ·已测序区域右侧的大片段缺失验证 | 第142-147页 |
| ·AT-KR 双结构域 PCR 法克隆梅岭霉素生物合成基因簇 | 第147-168页 |
| ·AT-KR 双结构域 PCR 法的理论依据 | 第147-149页 |
| ·引物设计及 PCR 产物的序列分析 | 第149-156页 |
| ·设计特异性引物对南昌链霉菌基因组文库进行筛选 | 第156-160页 |
| ·新克隆区域的遗传学验证 | 第160-166页 |
| ·新克隆区域的染色体定位 | 第166-168页 |
| ·梅岭霉素生物合成基因簇的序列分析 | 第168-185页 |
| ·新克隆区域的序列测定 | 第168-172页 |
| ·梅岭霉素生物合成基因簇的序列分析 | 第172-181页 |
| ·梅岭霉素生物合成途径模型 | 第181-185页 |
| ·梅岭霉素生物合成基因簇的边界确定 | 第185-201页 |
| ·梅岭霉素生物合成基因簇的左边界确定 | 第185-188页 |
| ·梅岭霉素生物合成基因簇的右边界确定 | 第188-191页 |
| ·梅岭霉素生物合成基因簇的 55-kb 中间区域的研究 | 第191-201页 |
| ·梅岭霉素生物合成基因簇中甲基转移酶 NanM 的功能验证 | 第201-205页 |
| ·小结与讨论 | 第205-206页 |
| 第七章 AdpAn对梅岭霉素生物合成的调节作用 | 第206-218页 |
| ·前言 | 第206页 |
| ·结果与分析 | 第206-217页 |
| ·meiR 的缺失与回补 | 第206-210页 |
| ·adpAn的克隆 | 第210-215页 |
| ·adpAn的缺失 | 第215-217页 |
| ·小结与讨论 | 第217-218页 |
| 第八章 梅岭霉素与阿维菌素之间的组合生物学研究 | 第218-226页 |
| ·前言 | 第218页 |
| ·结果与分析 | 第218-224页 |
| ·梅岭霉素生物合成基因簇中的 DH7 结构域的定点突变 | 第219-222页 |
| ·齐墩果糖合成酶基因的克隆 | 第222-224页 |
| ·小结与讨论 | 第224-226页 |
| 第九章 南昌霉素生物合成基因簇中糖基转移酶 NanG5 的功能研究 | 第226-235页 |
| ·前言 | 第226页 |
| ·结果与分析 | 第226-233页 |
| ·糖基转移酶基因 nanG5 中断突变株 HYL6 的构建 | 第226-229页 |
| ·nanG5 突变的回补菌株 HYL7 的构建 | 第229页 |
| ·去糖基南昌霉素的分离纯化 | 第229-230页 |
| ·去糖基南昌霉素的结构鉴定 | 第230-232页 |
| ·去糖基南昌霉素的活性测定 | 第232-233页 |
| ·小结与讨论 | 第233-235页 |
| 第十章 南昌霉素生物合成基因簇中甲基转移酶 NanM 的功能研究 | 第235-246页 |
| ·前言 | 第235页 |
| ·结果与分析 | 第235-244页 |
| ·甲基转移酶基因 nanM 缺失突变株 HYL14 的构建 | 第235-238页 |
| ·nanM 突变的回补菌株 HYL14 (pJTU1279)的构建 | 第238页 |
| ·去甲基南昌霉素的分离纯化 | 第238-239页 |
| ·去甲基南昌霉素的结构鉴定 | 第239-242页 |
| ·去甲基南昌霉素的活性测定 | 第242页 |
| ·甲基转移酶 NanM 的蛋白表达 | 第242-244页 |
| ·小结与讨论 | 第244-246页 |
| 第十一章 总结与展望 | 第246-248页 |
| ·本研究的主要创新点 | 第246页 |
| ·对进一步工作的展望 | 第246-248页 |
| 参考文献 | 第248-259页 |
| 致谢 | 第259-261页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文和申请的专利 | 第261-264页 |
| 附件 | 第264页 |
