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棉纤维发育早期的转录调控机制研究

摘要第1-9页
ABSTRACT第9-13页
目录第13-18页
缩略词表第18-20页
第一章 前言第20-46页
   ·引言第20-21页
   ·棉纤维发育的过程第21-24页
     ·纤维起始期第21-22页
       ·棉纤维原始细胞的分化第21-22页
       ·棉纤维的突起第22页
     ·棉纤维的伸长第22-23页
       ·纤维细胞的伸长第22-23页
       ·初生壁的合成第23页
     ·棉纤维的次生壁增厚第23-24页
       ·纤维素合成酶第23-24页
       ·蔗糖合成酶第24页
     ·棉纤维的成熟第24页
   ·MYB 转录因子家族在表皮发育中的作用第24-31页
     ·与拟南芥表皮细胞分化和发育相关的 MYB 转录因子第25-29页
       ·与叶表皮毛形态建成相关 MYB 转录因子第25-27页
       ·与叶表皮毛分叉相关 MYB 转录因子第27-28页
       ·与种皮细胞发育的相关 MYB 转录因子第28-29页
     ·与棉纤维发育相关的 MYB 转录因子第29-31页
   ·HD-Zip IV 家族在表皮发育中的作用第31-35页
     ·拟南芥中与表皮相关的 HD-Zip IV 转录因子第32-35页
     ·棉花中与纤维发育相关的 HD-Zip IV 转录因子第35页
   ·SANT/MYB 类转录因子在发育中的作用第35-37页
   ·BR 在早期纤维发育中的作用及 NAC 转录因子的功能研究第37-44页
     ·BR 在纤维发育中的作用第37页
     ·NAC 转录因子在发育中的功能第37-42页
       ·茎端分生组织发育相关的 NAC 转录因子第38-40页
       ·与维管组织发育相关的 NAC 转录因子第40-41页
       ·VND 亚家族第41页
       ·NST 亚家族第41-42页
       ·VND 基因和 NST 基因的共同靶标基因第42页
     ·与 BR 相关的 NAC 转录因子第42-44页
   ·本研究的目的及实验技术路线第44-46页
第二章 GBML1 的克隆和功能研究第46-98页
   ·引言第46-47页
   ·材料和方法第47-70页
     ·实验材料第47-50页
       ·植物材料第47页
       ·菌株和质粒第47-48页
       ·酶,试剂盒和引物第48页
       ·试剂的配制第48-50页
     ·实验方法第50-70页
       ·GbML1,GbMYB25,GbMYB2 等基因的克隆第50-54页
         ·海岛棉 RNA 的提取第50-51页
         ·海岛棉 5’及 3’ -RACE cDNA 文库的构建第51-52页
         ·海岛棉 GbML1 全长 cDNA 的获得第52-53页
         ·海岛棉 GbMYB25 和 GbMYB2 基因的克隆第53页
         ·海岛棉基因组 DNA 的提取第53页
         ·海岛棉 GbML1 基因组 DNA 的克隆第53-54页
       ·GbML1 启动子的克隆第54-56页
         ·棉花基因组步移文库的构建第54-55页
         ·巢式 PCR 扩增未知片段第55-56页
         ·GbML1 的生物信息学分析第56页
       ·GbML1 结合 L1 盒的凝胶阻滞实验第56-60页
         ·蛋白原核表达和纯化第56-57页
         ·Bradford 法测定蛋白含量第57-58页
         ·探针合成和标记第58页
         ·凝胶阻滞实验第58-60页
       ·GbML1 和 GbMYB25 的表达分析第60-61页
         ·cDNA 样品准备第60-61页
         ·海岛棉不同组织 RT-PCR 分析第61页
       ·GbML1 和 GbMYB25 的亚细胞定位第61-64页
         ·pA7 -CFP-GbML1 和 pA7-GbMYB25-YFP 载体的构建第61页
         ·无内毒素质粒的抽提第61-62页
         ·基因枪轰击洋葱表皮细胞第62-64页
         ·激光共聚焦显微镜观察荧光信号第64页
       ·GbML1,GbMYB25 和 GbMYB2 的自激活实验第64-65页
         ·载体构建第64页
         ·酵母转化方法第64-65页
         ·激活能力的评价第65页
       ·GbML1 和 GbMYB25 的酵母双杂交实验第65-66页
         ·载体构建第65页
         ·酵母转化第65-66页
       ·GbML1 和 GbMYB25 的体外 pull-down 实验第66-68页
         ·蛋白表达和固定第66页
         ·蛋白孵育第66-67页
         ·Western 检测第67-68页
       ·GbML1 在拟南芥中的过量表达第68-70页
         ·pHB-GbML1 载体的构建第68页
         ·农杆菌的转化第68-69页
         ·拟南芥的转化第69页
         ·拟南芥阳性植株的筛选第69-70页
         ·拟南芥 DNA 的简单提取第70页
         ·拟南芥 RNA 的提取第70页
         ·阳性转基因植株的验证及 RT-PCR 分析转基因植株中基因的表达情况第70页
   ·结果和讨论第70-98页
     ·GbML1 基因的序列特征第70-72页
     ·GbML1 是一个模块化的 HD-Zip IV 转录因子第72-75页
     ·GbMYB25 和 GbMYB2 分别是 GhMYB25 和 GaMYB2 的同源基因第75页
     ·GbML1 与 GbMYB25 可共同定位于细胞核第75-78页
     ·GbML1 为弱激活子而 GbMYB25 为强激活子第78-81页
     ·GbML1 启动子克隆和分析第81-83页
     ·GbML1 的蛋白表达第83页
     ·GbML1 的 HD- ZLZ 结构域特异性地结合 L1 盒第83-87页
     ·GbML1 和 GbMYB25 在发育的胚珠和纤维中强表达第87页
     ·GbML1 的 START-SAD 结构域结合 GbMYB25 的 C 端第87-93页
     ·GbML1 在拟南芥中过量表达促进了表皮毛的生长第93-95页
     ·小结和讨论第95-98页
第三章 海岛棉中两个 SANT/MYB 类转录因子的克隆和功能分析第98-126页
   ·引言第98-99页
   ·材料和方法第99-106页
     ·实验材料第99-100页
     ·实验方法第100-106页
       ·GbRL1 和 GbRL2 基因的克隆第100页
         ·全长 cDNA 的获得第100页
         ·GbRL1/GbRL2 的基因组 DNA 的获得第100页
       ·GbRL1 和 GbRL2 的启动子克隆第100页
       ·GbRL1 和 GbRL2 的生物信息学预测第100页
       ·Southern blot第100-104页
         ·基因组酶切和电泳第101页
         ·转膜,固定第101-102页
         ·探针制备第102页
         ·杂交第102-103页
         ·洗膜第103页
         ·检测第103-104页
       ·GbRL1 和 GbRL2 的 RT-PCR 分析第104页
       ·Real-time PCR 分析第104-105页
         ·cDNA 样品准备第104-105页
         ·标准曲线绘制第105页
       ·GbRL1 和 GbRL2 的转基因研究第105-106页
         ·载体构建第105-106页
         ·转化拟南芥第106页
   ·实验结果和讨论第106-126页
     ·GbRL1 基因的克隆和功能分析第106-116页
       ·GbRL1 基因的分离和鉴定第106-108页
       ·GbRL1 蛋白的序列分析第108-110页
       ·GbRL1 的表达模式第110-112页
       ·GbRL1 的启动子克隆和分析第112-113页
       ·过量表达 GbRL1 的发育表型第113-114页
       ·小结和讨论第114-116页
     ·GbRL2 基因的克隆和分析第116-126页
       ·GbRL2 的克隆第116页
       ·GbRL2 基因的序列特征第116-118页
       ·GbRL2 的进化分析第118-120页
       ·GbRL2 的表达分析第120-121页
       ·GbRL2 启动子的克隆和分析第121-124页
       ·GbRL2 转基因载体的构建第124页
       ·小结和讨论第124-126页
第四章 NAC 转录因子 SRN1 的功能研究第126-162页
   ·引言第126-127页
   ·材料和方法第127-133页
     ·实验材料第127-128页
       ·植物材料第127页
       ·菌株和质粒第127页
       ·酶、试剂盒和引物第127页
       ·试剂的配制第127-128页
     ·实验方法第128-133页
       ·SRN1 的生物信息学分析第128页
       ·SRN1 的表达分析第128-129页
         ·果荚 RNA 的提取第128-129页
         ·RT-PCR 检测 SRN1 的组织特异性表达第129页
       ·SRN1 的启动子活性分析第129页
         ·pSRN1::GUS 载体的构建第129页
         ·转基因植株的获得第129页
         ·GUS 染色第129页
       ·SRN1 蛋白的表达第129页
       ·SRN1 蛋白结合 DNA 实验第129页
       ·SRN1 蛋白的自激活实验第129-130页
       ·SRN1 蛋白的亚细胞定位第130页
         ·植物表达载体构建第130页
         ·转基因植株的获得及 YFP 观察第130页
       ·srn 突变体的鉴定第130页
       ·SRN1 的 RNAi 实验第130-131页
         ·RNA 干扰载体的构建第130-131页
         ·植物转基因及筛选第131页
       ·人工 miRNA 干扰 SRN1 表达实验第131-132页
         ·人工 miRNA 载体构建第131-132页
         ·植物转基因及筛选第132页
       ·过量表达 SRN1139第132页
         ·过量表达 SRN1 的载体构建第132页
         ·植物转基因及筛选第132页
         ·扫描电镜观察第132页
       ·转基因种子的相差显微镜观察第132-133页
   ·结果和讨论第133-162页
     ·SRN1 基因的生物信息学分析第133-135页
       ·SRN1 的基因结构第133页
       ·SRN1 的进化树分析第133-135页
     ·SRN1 基因的表达模式研究第135-139页
       ·RT-PCR 分析第135页
       ·启动子活性分析第135-139页
     ·SRN1 结合的顺式作用元件第139-140页
     ·SRN1 蛋白的 C 端具有转录激活功能第140-141页
     ·SRN1 蛋白可以形成同二聚体第141页
     ·SRN1 的亚细胞定位第141-142页
     ·srn1 突变体第142-143页
     ·RNA 干扰降低 SRN1 表达的表型第143-145页
     ·人工 miRNA 降低 SRN1 表达的表型第145-146页
     ·过量表达 SRN1 的表型第146-151页
       ·过量表达 SRN1 造成了严重的发育表型第146-147页
       ·过量表达 SRN1 对各个生长时期不同组织器官发育的影响第147-149页
       ·过量表达 SRN1 对于种子发育的影响第149-151页
     ·过量表达 SRN1-YFP 的新表型第151-154页
       ·SRN1-OE IV 植株的表型第151-153页
       ·SRN1-OE IV 种子的发育第153-154页
     ·SRN1 过量表达增加了生长素的合成第154-156页
     ·SRN1 基因调控纤维素合成酶基因和表皮发育相关基因的表达第156-157页
     ·SRN1 蛋白受到修饰加工第157-159页
     ·小结和讨论第159-162页
第五章 总结和展望第162-166页
   ·研究总结第162-164页
   ·创新点第164页
   ·后续工作展望第164-166页
参考文献第166-182页
攻读学位期间发表的学术论文目录第182-184页
致谢第184-186页
附录第186-194页

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