| 致谢 | 第1-5页 |
| 中文摘要 | 第5-8页 |
| Abstract | 第8-11页 |
| 目录 | 第11-15页 |
| 第一章 引言 | 第15-40页 |
| 第一节 海洋藻类和表面附着细菌的关系 | 第16-24页 |
| ·附着细菌对海藻生长、发育的影响 | 第16-19页 |
| ·附着细菌对海藻生长的影响 | 第16-17页 |
| ·附着细菌对海藻发育的影响 | 第17-19页 |
| ·表面附着细菌在海藻抗附着活性中的作用 | 第19-20页 |
| ·大型海藻表面的致病菌 | 第20-21页 |
| ·海藻对表面微环境的调控 | 第21-24页 |
| ·通过活性化合物调控微环境中的生物组成 | 第22页 |
| ·通过爆发性氧化调控微环境中的生物组成 | 第22页 |
| ·脱落外层细胞 | 第22-24页 |
| 第二节 大型海藻表面的附着细菌 | 第24-34页 |
| ·大型海藻表面附着细菌群落的多样性 | 第24-28页 |
| ·大型海藻表面附着细菌群落结构的种特异性和时空差异 | 第24-25页 |
| ·大型海藻表面附着细菌群落结构组成 | 第25-28页 |
| ·褐藻表面附着细菌群落组成 | 第25-26页 |
| ·红藻表面附着细菌群落组成 | 第26-27页 |
| ·绿藻表面附着细菌的群落组成 | 第27-28页 |
| ·大型海藻表面的附着细菌 | 第28-34页 |
| ·α-变形菌纲（α-Proteobacteria） | 第28页 |
| ·玫瑰杆菌属（Roseobacter） | 第28页 |
| ·γ-变形菌纲（γ-Proteobacteria） | 第28-32页 |
| ·假交替单胞菌属（Pseudoalteromonas） | 第29-30页 |
| ·弧菌属（Vibrio）和发光杆菌属（Photobacterium） | 第30页 |
| ·海单胞菌属（Marinomonas） | 第30-31页 |
| ·假单胞菌属（Pseudomonas）、交替单胞菌属（Alteromonas）和希瓦氏菌属（Shewanella） | 第31页 |
| ·Cobetia 属 | 第31-32页 |
| ·拟杆菌门（Bacteroidetes） | 第32-34页 |
| ·黄杆菌属（Flavobacterium） | 第32页 |
| ·噬纤维菌属（Cytophaga） | 第32-33页 |
| ·屈挠杆菌属（Flexibacter） | 第33-34页 |
| 第三节 海洋藻类表面附着细菌的研究方法 | 第34-39页 |
| ·大型海藻表面附着细菌的分离方法 | 第34页 |
| ·大型海藻表面附着细菌的培养 | 第34-35页 |
| ·分子生物学技术在附着细菌群落结构分析中的应用 | 第35-39页 |
| ·克隆文库分析技术 | 第35-36页 |
| ·分子杂交技术 | 第36-37页 |
| ·基于 PCR 的 DNA 指纹图谱技术 | 第37-39页 |
| 第四节 本论文的研究目的和意义 | 第39-40页 |
| 第二章 不同地区养殖海藻表面附着细菌的分离及多样性分析 | 第40-81页 |
| 第一节 材料与方法 | 第40-52页 |
| ·材料与设备 | 第40-45页 |
| ·样品 | 第40-41页 |
| ·采样站位 | 第40-41页 |
| ·样品的采集 | 第41页 |
| ·菌株和质粒 | 第41页 |
| ·主要试剂 | 第41-42页 |
| ·主要仪器 | 第42页 |
| ·引物与探针 | 第42页 |
| ·序列分析软件 | 第42-43页 |
| ·培养基 | 第43-44页 |
| ·溶液 | 第44-45页 |
| ·基本方法 | 第45-50页 |
| ·化学感受态细胞的制备 | 第45-46页 |
| ·DNA 提取 | 第46页 |
| ·PCR 反应 | 第46-47页 |
| ·DNA 片段的回收、纯化 | 第47-48页 |
| ·连接反应 | 第48页 |
| ·质粒的化学转化 | 第48-49页 |
| ·RFLP 分析 | 第49页 |
| ·核酸内切酶酶切反应 | 第49页 |
| ·DNA 序列测定 | 第49页 |
| ·16S rDNA 序列分析 | 第49-50页 |
| ·海藻表面附着细菌的分离、鉴定和保存 | 第50-52页 |
| ·海藻表面附着细菌的分离 | 第50页 |
| ·海藻表面附着细菌分离菌株的鉴定 | 第50页 |
| ·海藻表面附着细菌分离菌株系统发育树的构建 | 第50-51页 |
| ·海藻表面附着细菌分离菌株组成的比较 | 第51页 |
| ·海藻表面附着细菌分离菌株的保存 | 第51-52页 |
| 第二节 结果与分析 | 第52-79页 |
| ·养殖海藻表面附着细菌的分离培养 | 第52页 |
| ·养殖海藻表面附着细菌分离菌株的鉴定及系统发育分析 | 第52-64页 |
| ·γ-变形菌纲 | 第52-60页 |
| ·拟杆菌门 | 第60-62页 |
| ·厚壁菌门 | 第62-63页 |
| ·α-变形菌纲 | 第63页 |
| ·放线菌门 | 第63-64页 |
| ·不同养殖海藻表面分离菌株的组成 | 第64-71页 |
| ·条斑紫菜 | 第64-66页 |
| ·坛紫菜 | 第66-67页 |
| ·龙须菜 | 第67-69页 |
| ·细基江篱 | 第69-70页 |
| ·异枝麒麟菜 | 第70-71页 |
| ·蜈蚣藻 | 第71页 |
| ·浒苔 | 第71页 |
| ·不同海藻样品分离菌株组成的比较 | 第71-79页 |
| ·不同种类海藻分离菌株组成的比较 | 第71-75页 |
| ·不同海藻样品的聚类分析和非线性多维标度分析 | 第75-79页 |
| 第三节 小结 | 第79-81页 |
| 第三章 不同养殖海藻表面附着细菌群落结构分析 | 第81-113页 |
| 第一节 材料与方法 | 第81-85页 |
| ·材料与设备 | 第81-82页 |
| ·样品的采集 | 第81页 |
| ·菌株和质粒 | 第81页 |
| ·主要试剂 | 第81页 |
| ·主要仪器 | 第81页 |
| ·引物与探针 | 第81页 |
| ·序列分析软件 | 第81页 |
| ·培养基 | 第81-82页 |
| ·溶液 | 第82页 |
| ·基本方法 | 第82页 |
| ·克隆文库多样性分析 | 第82页 |
| ·不同养殖海藻表面附着细菌群落结构分析 | 第82-85页 |
| ·海藻表面附着细菌的分离 | 第82-83页 |
| ·海藻表面附着细菌 16S rDNA 全长克隆文库构建 | 第83-84页 |
| ·海藻表面附着细菌 16S rDNA 的序列测定和系统发育分析 | 第84-85页 |
| 第二节 结果与分析 | 第85-111页 |
| ·不同海藻表面附着细菌 16S rDNA 文库多样性指数分析 | 第85-87页 |
| ·不同海藻表面附着细菌 16S rDNA 文库系统发育分析 | 第87-108页 |
| ·条斑紫菜表面附着细菌群落 16S rDNA 系统发育分析 | 第87-92页 |
| ·马泽藻表面附着细菌群落 16S rDNA 系统发育分析 | 第92-95页 |
| ·海萝表面附着细菌群落 16S rDNA 系统发育分析 | 第95-97页 |
| ·龙须菜表面附着细菌群落 16S rDNA 系统发育分析 | 第97-100页 |
| ·孔石莼附着细菌群落 16S rDNA 系统发育分析 | 第100-103页 |
| ·裙带菜附着细菌群落 16S rDNA 系统发育分析 | 第103-106页 |
| ·海带表面附着细菌群落 16S rDNA 系统发育分析 | 第106-108页 |
| ·不同海藻表面附着细菌群落结构之间的比较 | 第108-111页 |
| ·不同海藻表面附着细菌克隆文库组成的比较 | 第108-109页 |
| ·不同海藻表面附着细菌克隆文库的聚类分析和非线性多维标度分析 | 第109-111页 |
| 第三节 小结 | 第111-113页 |
| 结论 | 第113-114页 |
| 参考文献 | 第114-122页 |
| 附录Ⅰ | 第122-123页 |
| 附录Ⅱ | 第123-128页 |
| 附录Ⅲ | 第128-138页 |
| 个人简历 | 第138页 |
| 发表文章目录 | 第138页 |
