摘要 | 第1-5页 |
Abstract | 第5-9页 |
第一章 引言 | 第9-12页 |
·课题研究的背景和意义 | 第9-10页 |
·课题研究的国内外现状 | 第10页 |
·论文的结构安排 | 第10-12页 |
第二章 蛋白质复杂超二级结构βαβ模体的结构简介及其数据库的构建 | 第12-17页 |
·蛋白质结构介绍 | 第12-13页 |
·文中使用的蛋白质数据库及相关软件介绍 | 第13-15页 |
·蛋白质中βαβ模体数据库的构建 | 第15-16页 |
·本章小结 | 第16-17页 |
第三章 序列片段截取方法及氨基酸位点保守性分析 | 第17-27页 |
·序列片段统计分析 | 第17-20页 |
·二级结构单元长度进行统计 | 第17-18页 |
·核心结构 loop-α-loop 长度统计 | 第18-19页 |
·序列片段长统计 | 第19-20页 |
·序列片段截取方式 | 第20-21页 |
·位点保守性分析 | 第21-26页 |
·本章小结 | 第26-27页 |
第四章 基于优化特征参数的支持向量机方法预测βαβ模体 | 第27-36页 |
·特征参数选取 | 第27-29页 |
·方法和评价指标 | 第29-31页 |
·支持向量机 (SVM) 方法 | 第29-30页 |
·检验方法 | 第30页 |
·精度评价指标 | 第30-31页 |
·结果与讨论 | 第31-34页 |
·五交叉检验预测结果 | 第31-33页 |
·独立检验预测结果 | 第33-34页 |
·本章小结 | 第34-36页 |
第五章 基于随机森林算法预测βαβ模体 | 第36-42页 |
·特征参数的选取 | 第36-37页 |
·随机森林 (RF) 方法 | 第37-38页 |
·预测结果的比较与讨论 | 第38-41页 |
·SVM 算法与 RF 算法比较 | 第38-39页 |
·使用位点氨基酸亲疏水作为特征参数的预测结果 | 第39-41页 |
·本章小结 | 第41-42页 |
第六章 总结与展望 | 第42-44页 |
·总结 | 第42-43页 |
·展望 | 第43-44页 |
参考文献 | 第44-48页 |
附录 | 第48-53页 |
致谢 | 第53-54页 |
在读期间取得的科研成果 | 第54页 |