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酿酒酵母中TRAPP复合体的三个亚基在囊泡运输和细胞自噬中的功能研究

摘要第1-11页
ABSTRACT第11-14页
缩略语及中英文全称对照表第14-16页
前言第16-17页
第一章 文献综述第17-41页
 第一节 酿酒酵母胞内囊泡运输的研究进展第17-28页
  一 囊泡运输调控的分子机制第17-23页
  二 Golgi体为中心的囊泡系统与囊泡运输第23-24页
  三 囊泡运输的研究方法第24-25页
  四 囊泡运输障碍与生物疾病第25页
  五 胞内物质运输的其他模型第25-28页
 第二节 酿酒酵母中细胞自噬的研究进展第28-39页
  一 酿酒酵母中细胞自噬的分子机制第28-35页
  二 参与囊泡运输的因子在细胞自噬中的作用研究第35-36页
  三 酵母中研究细胞自噬的主要手段第36-37页
  四 细胞自噬与生物疾病第37-39页
 第三节 本研究的目的和内容第39-41页
第二章 TRAPP复合体中Trs65和Trs85亚基在囊泡运输和细胞自噬过程中的作用研究第41-83页
 摘要第41-43页
 第—节 酿酒酵母中Trs65和Trs85亚基对胞内物质运输的影响第43-54页
  1 材料与方法第43-46页
   ·试验材料第43页
   ·主要试剂和仪器第43-44页
   ·酵母交配和四分体分离第44页
   ·模板DNA的提取第44-45页
   ·质粒的提取第45页
   ·引物设计第45页
   ·扩增trs65::HYG和trs85::KAN目的片段第45页
   ·目的基因的敲除第45-46页
   ·外源基因转化第46页
   ·生长及液泡表型的检测第46页
  2 结果与分析第46-53页
   ·TRS85敲除影响Sncl在胞内的运输第46-47页
   ·TRS65和TRS85双敲除菌株表现强烈的高温敏感性第47-49页
   ·TRS65和TRS85敲除对Snc1运输的影响第49-51页
   ·TRS65和TRS85敲除对液泡形态的影响第51页
   ·TRS65和TRS85敲除菌株缺陷表型的抑制试验第51-53页
  3 小结第53-54页
 第二节 酿酒酵母Trs65和Trs85缺失突变体中物质运输受阻部位的研究第54-62页
  1 材料与方法第54-56页
   ·试验材料第54页
   ·主要试剂和仪器第54页
   ·GFP-SNC1-PEM菌株的获得第54-55页
   ·HTB1-CFP整合菌株的获得第55页
   ·pRS313-VPS10-GFP转化菌株的获得第55页
   ·SEC7-DsRed整合菌株的获得第55-56页
   ·电镜样品的制备及电镜观察第56页
   ·荧光显微镜观察第56页
  2 结果与分析第56-61页
   ·trs85Δts和trs65Δtrs85Δts突变体细胞中Snc1在反式高尔基体的堆积情况第56-57页
   ·trs85Δts和trs65Δtrs85Δts突变体细胞中GFP-Snc1-PEM的运输情况第57-58页
   ·trs85Δts和trs65Δtrs85Δts突变体细胞的内吞情况第58-60页
   ·trs85Δts和trs65Δtrs85Δts突变体细胞中ER处蛋白的堆积情况第60页
   ·电镜观察trs85Δts和trs65Δ trs85Δts突变体的胞内变化第60-61页
  3 小结第61-62页
 第三节 TRAPP复合体亚基与小G蛋白Ypts分组调控液泡的形态第62-70页
  1 材料与方法第62-63页
   ·试验材料第62页
   ·主要试剂和仪器第62-63页
   ·质粒的构建及转化第63页
   ·生长及液泡表型的检测第63页
  2 结果与分析第63-69页
   ·Trs130与Ypt31/32的作用关系第63-64页
   ·Trs85与Ypt1的作用关系第64-65页
   ·Trs85和Trs130的互作关系第65-67页
   ·Ypt1和Ypt31与Trs85和Trs130的作用关系第67-69页
  3 小结第69-70页
 第四节 酿酒酵母中Trs65和Trs85亚基在细胞自噬中的功能研究第70-81页
  1 材料与方法第70-72页
   ·试验材料第70页
   ·主要试剂和仪器第70页
   ·GFP-ATG8整合菌株的获得第70页
   ·细胞的培养和自噬的诱导第70-71页
   ·荧光观察第71页
   ·蛋白样品的制备第71页
   ·Western blot第71-72页
  2 结果与分析第72-80页
   ·trs65Δ trs85Δts突变体细胞中自噬受到了严重的影响第72-74页
   ·Trs65和Trs85参与饥饿等逆境处理将囊泡运输的货物运送到液泡中降解的过程第74-75页
   ·Trs85或Trs65和Trs85参与饥饿处理将细胞膜定位的蛋白运送到液泡中降解的过程第75-78页
   ·Trs85或Trs65和Trs85参与饥饿等胁迫处理细胞液泡的融合第78-80页
  3 小结第80-81页
 第五节 本章小结第81-83页
第三章 TRAPP复合体中Bet3亚基在细胞自噬中的功能初步研究第83-113页
 摘要第83-85页
 第一节 酿酒酵母Bet3亚基参与细胞自噬的研究第85-94页
  1 材料与方法第85-88页
   ·试验材料第85页
   ·主要试剂和仪器第85页
   ·细胞的培养和巨自噬的诱导第85-86页
   ·CPY-GFP整合菌株的培养及GFP荧光的诱导观察第86页
   ·GFP-ATG8或/和RFP-APE1整合菌株的获得第86-87页
   ·CPY-GFP整合菌株的获得第87页
   ·荧光观察第87页
   ·蛋白样品的制备第87页
   ·Western blot第87页
   ·BET3的克隆及bet3ts的基因回补验证第87-88页
  2 结果与分析第88-92页
   ·Bet3参与了酵母细胞羧肽酶向液泡的运输第88-89页
   ·Bet3参与了酵母细胞的巨自噬过程第89-90页
   ·Bet3参与了酵母细胞的Cvt途径第90-92页
   ·bet3ts的回补验证第92页
  3 小结第92-94页
 第二节 酿酒酵母Bet3亚基突变对自噬体形成相关蛋白Atg8和Atg9定位的影响研究第94-106页
  1 材料与方法第94-98页
   ·试验材料第94页
   ·主要试剂和仪器第94页
   ·GFP-ATG8或/和RFP-APE1整合菌株的获得第94页
   ·ATG9-3×GFP.PG5整合菌株的获得第94-95页
   ·ATG1敲除菌株的获得第95-96页
   ·TAKA分析第96页
   ·细胞的培养第96页
   ·Atg8或Atg9与Ape1共定位情况分析第96-97页
   ·荧光照片亮度及尺寸的测量第97页
   ·蛋白酶保护试验第97-98页
  2 结果与分析第98-105页
   ·ATG1敲除菌株的获得第98-99页
   ·Bet3突变影响Atg8向PAS的募集第99-102页
   ·Bet3突变影响Atg9的正常循环第102-104页
   ·Bet3突变影响自噬体的形成第104-105页
  3 小结第105-106页
 第三节 Rab/Ypt类小G蛋白对Bet3亚基突变引起自噬缺陷的抑制作用研究第106-112页
  1 材料与方法第106-107页
   ·试验材料第106页
   ·主要试剂和仪器第106页
   ·GFP-ATG8或/和RFP-APE1整合菌株的获得第106-107页
   ·细胞的培养第107页
   ·质粒转化第107页
   ·蛋白样品的制备第107页
   ·Western blot第107页
  2 结果与分析第107-111页
   ·营养丰富条件下Ypt1和Ypt31对bet3ts突变体Cvt途径缺陷没有明显改善第107-108页
   ·缺氮条件下Ypt1部分抑制bet3ts突变体巨自噬缺陷第108-109页
   ·GTP形态的Ypt31对bet3ts突变体的自噬缺陷没有抑制作用第109-110页
   ·Ypt1和Ypt31共同改善bet3ts突变体巨自噬缺陷第110-111页
  3 小结第111-112页
 第四节 本章小结第112-113页
第四章 全文讨论第113-117页
第五章 全文总结第117-119页
参考文献第119-137页
附录第137-151页
攻读学位期间发表与待发表的论文第151-153页
致谢第153页

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