| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-13页 |
| 1. 高通量测序技术及其在寄生虫转录组研究的应用 | 第9-10页 |
| ·转录组概念 | 第9页 |
| ·测序平台及优势 | 第9页 |
| ·转录组组装软件 | 第9-10页 |
| ·寄生虫转录组生物信息学分析 | 第10页 |
| ·寄生虫转录组测序 | 第10页 |
| 2. 犬恶丝虫转录本研究 | 第10-12页 |
| ·犬恶丝虫病 | 第10-11页 |
| ·犬恶丝虫转录本研究概况 | 第11-12页 |
| 3. 实验目的和意义 | 第12-13页 |
| 第二章 犬恶丝虫成虫转录组测序及生物信息学分析 | 第13-39页 |
| 摘要 | 第13-14页 |
| 1. 材料与方法 | 第14-20页 |
| ·试验材料 | 第14-15页 |
| ·试验样品 | 第14页 |
| ·主要试剂 | 第14页 |
| ·主要仪器设备 | 第14-15页 |
| ·常用溶液的配制 | 第15页 |
| ·主要生物信息学数据库和计算机软件 | 第15页 |
| ·试验方法 | 第15-20页 |
| ·RNA抽提、cDNA文库构建以及Illumina测序 | 第15-16页 |
| ·De novo重头合成 | 第16-17页 |
| ·宿主转录本污染评估 | 第17页 |
| ·unigene功能注释 | 第17-18页 |
| ·预测犬恶丝虫肠道转录组 | 第18-19页 |
| ·基于NEMBASE4数据库的比较分析 | 第19-20页 |
| 2. 试验结果 | 第20-32页 |
| ·Illumina高通量测序即De novo重头合成 | 第20-21页 |
| ·宿主转录本污染分析 | 第21-22页 |
| ·功能注释和COG分类 | 第22-26页 |
| ·GO功能分类 | 第26-27页 |
| ·KEGG pathway功能分类 | 第27-29页 |
| ·预测肠道表达基因 | 第29-30页 |
| ·基于NEMBASE4的比较分析 | 第30-32页 |
| 3. 讨论 | 第32-39页 |
| ·组装及注释效率 | 第32页 |
| ·与免疫相关的代谢通路分析 | 第32-33页 |
| ·与心血管疾病相关代谢通路分析 | 第33-36页 |
| ·犬恶丝虫肠道转录组 | 第36-37页 |
| ·与内源共生菌相关基因 | 第37-39页 |
| 第三章 结论与创新点 | 第39-40页 |
| 1 结论 | 第39页 |
| 2 创新点 | 第39-40页 |
| 参考文献 | 第40-48页 |
| 致谢 | 第48-49页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第49页 |