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西伯利亚鲟CXCR7基因cDNA全长的克隆及表达分析

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-12页
引言第12-18页
 1 西伯利亚鲟简介第12页
 2 侧线系统第12-14页
 3 趋化因子及 CXCR7第14-15页
 4 生物学研究方法第15-17页
   ·原位杂交技术第15-16页
   ·实时荧光定量 PCR(Quantitative Real-time PCR ,qPCR)第16页
   ·内参基因的选择第16-17页
 5 研究目的和意义第17-18页
第一章 西伯利亚鲟 CXCR7 基因 cDNA 全长的克隆及生物信息学分析第18-34页
 1 材料和试剂第18-20页
   ·实验材料第18页
   ·实验试剂第18-19页
     ·常用试剂第18页
     ·试剂盒第18-19页
   ·常用试剂配制及保存方法第19-20页
     ·LB 液体培养基第19页
     ·LB 固体培养基(抗性)第19页
     ·氨苄青霉素(Amp)储存液第19页
     ·IPTG 储存液第19页
     ·X-gal 储存液第19页
     ·0.1mol/L 的 CaCl2和 0.1mol/L 的 CaCl2-MgCl2溶液的配制第19页
     ·感受态细胞的制备第19-20页
     ·蓝白斑筛选用培养基制备第20页
     ·DEPC 处理水的制备第20页
 2 实验方法第20-25页
   ·RNA 的提取第20-21页
   ·引物设计与合成第21页
   ·CXCR7 基因 cDNA 扩增片段的回收、连接第21-22页
   ·转化第22页
   ·重组质粒鉴定第22页
   ·CXCR7 的 cDNA 的 5 RACE 和 3 RACE第22-23页
   ·生物信息学分析软件第23-24页
   ·西伯利亚鲟基因组 DNA 的提取及 CXCR7a 和 CXCR7b 的扩增第24-25页
 3 结果第25-32页
   ·总 RNA 的提取及 CXCR7 的 cDNA 片段的克隆第25页
   ·CXCR7 基因 5 端 cDNA 序列和 3 端 cDNA 序列的克隆第25-26页
   ·CXCR7a 和 CXCR7b 的 cDNA 序列的生物信息学分析第26-31页
   ·西伯利亚鲟 CXCR7a 和 CXCR7b 在基因组水平上的鉴定分析第31-32页
 4 讨论第32-34页
第二章 内参基因的筛选第34-40页
 1 材料和试剂第34页
   ·材料第34页
   ·试剂第34页
   ·主要仪器第34页
 2 实验方法第34-37页
   ·RNA 的提取第34页
   ·cDNA 第一链的合成第34-35页
   ·内参基因的选择和引物设计第35-36页
   ·引物的验证和标准曲线的制备第36页
   ·实时荧光定量第36页
   ·数据处理第36-37页
 3 结果第37-39页
   ·RNA 质量的评价第37页
   ·内参基因的引物的检验第37页
   ·实时荧光定量 PCR 的效率第37-38页
   ·各持家基因稳定性的比较第38-39页
 4 讨论第39-40页
第三章 CXCR7 基因在胚胎发育过程中的表达分析第40-47页
 1 材料和试剂第40页
   ·实验材料第40页
   ·试剂第40页
 2 实验方法第40-43页
   ·RNA 的提取第40页
   ·cDNA 第一链的合成第40-41页
   ·CXCR7a 和 CXCR7b 在各时期胚胎及仔鱼中表达的定性分析第41页
   ·标准曲线的制备第41页
   ·实时荧光定量 PCR(Real time quantitative PCR)第41-43页
   ·数据处理第43页
 3 结果第43-45页
   ·CXCR7a 和 CXCR7b 在各时期胚胎及仔鱼中表达的定性分析第43-44页
   ·CXCR7a 和 CXCR7b 的实时荧光定量引物的评价第44页
   ·CXCR7a 和 CXCR7b 在胚胎发育时期的定量结果第44-45页
 4 讨论第45-47页
第四章 CXCR7 基因表达的定位分析第47-56页
 1 原位杂交试剂及配制方法第47-49页
 2 实验步骤第49-52页
   ·探针的制备过程第49-50页
   ·探针的回收第50页
   ·整体原位杂交步骤第50-52页
     ·胚胎的采集、固定与保存第50页
     ·原位杂交第一天第50-51页
     ·原位杂交第二天第51-52页
     ·原位杂交第三天第52页
 3 结果第52-54页
   ·酶切位点的引入第52-53页
   ·体外转录和探针的回收第53页
   ·原位杂交结果第53-54页
   ·利用荧光素检测与碱性磷酸酶显色的方法比较第54页
 4 讨论第54-56页
结论第56-57页
参考文献第57-61页
附录第61-62页
致谢第62页

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