| 中文摘要 | 第1-7页 |
| 英文摘要 | 第7-9页 |
| 1 粗根组研究现状 | 第9-20页 |
| 1．1 细胞学研究简史 | 第10-11页 |
| 1．2 植物化学研究简史 | 第11-12页 |
| 1．3 孢粉学研究情况 | 第12-13页 |
| 1．4 种子表皮微形态学研究 | 第13-14页 |
| 1．5 分子系统学研究 | 第14-16页 |
| 1．6 本研究的目的及意义 | 第16-17页 |
| 参考文献 | 第17-20页 |
| 2 宽叶韭种内分化的随机扩增多态DNA分析 | 第20-33页 |
| 2．1 材料 | 第20页 |
| 2．2 方法 | 第20-24页 |
| 2．2．1 DNA提取 | 第20-22页 |
| 2．2．2 DNA扩增 | 第22-24页 |
| 2．2．3 电泳 | 第24页 |
| 2．3 数据处理 | 第24页 |
| 2．4 结果 | 第24-25页 |
| 2．4．1 电泳结果 | 第24-25页 |
| 2．4．2 数据分析结果 | 第25页 |
| 2．5 讨论 | 第25-32页 |
| 2．5．1 种内分化 | 第25-26页 |
| 2．5．2 宽叶韭生活型 | 第26页 |
| 2．5．3 倍性问题 | 第26页 |
| 2．5．4 宽叶韭进化趋势 | 第26-28页 |
| 2．5．5 宽叶韭与木里韭的关系 | 第28页 |
| 2．5．6 数据分析的一些问题 | 第28-32页 |
| 参考文献 | 第32-33页 |
| 3 粗根组分子系统学研究 | 第33-61页 |
| 3．1 材料 | 第33-34页 |
| 3．2 实验方法 | 第34-40页 |
| 3．2．1 植物总DNA的提取 | 第34页 |
| 3．2．2 植物总DNA的纯化 | 第34-35页 |
| 3．2．3 总DNA浓度的测定 | 第35页 |
| 3．2．4 nrDNA的PCR扩增 | 第35-36页 |
| 3．2．5 PCR产物纯化 | 第36-37页 |
| 3．2．6 核酸序列测定 | 第37-40页 |
| 3．3 数据处理 | 第40页 |
| 3．4 结果 | 第40-47页 |
| 3．4．1 电泳结果 | 第40页 |
| 3．4．2 ITS序列特点及分析结果 | 第40-47页 |
| 3．5 结果分析与讨论 | 第47-60页 |
| 3．5．1 杯花韭归属问题 | 第47-49页 |
| 3．5．2 三柱韭归属问题 | 第49-50页 |
| 3．5．3 染色体基数与基因聚类树的关系 | 第50-53页 |
| 3．5．4 外类群选取对结果的影响 | 第53-55页 |
| 3．5．5 分析软件与分析方法的选择问题 | 第55-58页 |
| 3．5．6 粗根组的划分 | 第58-59页 |
| 3．5．7 葱属欧亚种类的关系 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-61页 |
| 4 分子系统学研究进展综述 | 第61-96页 |
| 4．1 引言 | 第61-62页 |
| 4．2 实验方法的改进与提高 | 第62-64页 |
| 4．2．1 材料的保存方法 | 第62-63页 |
| 4．2．2 DNA制备 | 第63页 |
| 4．2．3 序列分析（sequencing） | 第63页 |
| 4．2．4 PCR在分子系统学研究中的应用 | 第63-64页 |
| 4．3 常用的分子生物学方法 | 第64-70页 |
| 4．3．1 RFLP／PCR-RFLP | 第65页 |
| 4．3．2 RAPD | 第65-67页 |
| 4．3．3 AFLP | 第67页 |
| 4．3．4 SSR | 第67-68页 |
| 4．3．5 ISSR | 第68页 |
| 4．3．6 SSCP | 第68-69页 |
| 4．3．7 DNA CHIP | 第69-70页 |
| 4．4 用于分子系统学研究的主要基因种类及其进化规律 | 第70-76页 |
| 4．4．1 叶绿体基因组 | 第70-73页 |
| 4．4．2 核基因组 | 第73-75页 |
| 4．4．3 线粒体基因组 | 第75-76页 |
| 4．5 分子系统学数据的处理与分析方法的发展 | 第76-93页 |
| 4．5．1 数据的获得 | 第76页 |
| 4．5．2 统计学处理 | 第76-79页 |
| 4．5．3 表征分析与系统发育分析 | 第79-80页 |
| 4．5．4 系统发育树的重建 | 第80-88页 |
| 4．5．5 常用分析软件 | 第88-93页 |
| 参考文献 | 第93-96页 |
| 致谢 | 第96页 |