玉米气生根早期发育的转录组和候选基因的功能分析
| 符号说明 | 第1-8页 |
| 中文摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 1 前言 | 第12-33页 |
| ·植物根的形态 | 第12-18页 |
| ·玉米根系 | 第12-13页 |
| ·模式植物拟南芥的根系 | 第13页 |
| ·玉米根系与模式植物拟南芥根系的差别 | 第13-15页 |
| ·侧根的形成过程 | 第15-17页 |
| ·茎生根的形成过程 | 第17-18页 |
| ·植物根系发育研究现状 | 第18-24页 |
| ·侧根发育的研究现状 | 第18-20页 |
| ·生长素对侧根发育的影响 | 第19-20页 |
| ·其他激素对侧根发育的影响 | 第20页 |
| ·不定根发育的研究现状 | 第20-21页 |
| ·玉米根系发育研究现状 | 第21-24页 |
| ·玉米根系发育的突变体 | 第22-24页 |
| ·大规模基因表达图谱研究 | 第24-26页 |
| ·基因表达系列分析（SAGE） | 第25-26页 |
| ·高通量测序技术 | 第26-31页 |
| ·高通量测序技术的产生 | 第26-27页 |
| ·罗氏公司454测序技术：焦磷酸测序 | 第27-28页 |
| ·Illumina公司的Solexa测序技术 | 第28-29页 |
| ·AB公司的SOLiD测序技术 | 第29-30页 |
| ·高通量测序技术的应用 | 第30-31页 |
| ·本研究的目的与意义 | 第31-33页 |
| 2 材料与方法 | 第33-44页 |
| ·实验材料 | 第33-35页 |
| ·植物材料 | 第33页 |
| ·菌株与质粒 | 第33页 |
| ·酶与各种生化试剂 | 第33页 |
| ·引物 | 第33-35页 |
| ·实验方法 | 第35-44页 |
| ·玉米植株的培养 | 第35页 |
| ·植物RNA 的提取 | 第35-36页 |
| ·RNA 中基因组DNA 的去除 | 第36页 |
| ·反转录合成一链cDNA | 第36-37页 |
| ·Real-Time PCR 体系及反应条件 | 第37页 |
| ·标签文库的建立和标签的测序 | 第37-38页 |
| ·标签-基因定位 | 第38-39页 |
| ·标签的差异表达分析 | 第39页 |
| ·基因功能聚类分析 | 第39页 |
| ·玉米基因的异源表达 | 第39-42页 |
| ·DNA片段与克隆载体的连接 | 第39页 |
| ·大肠杆菌感受态细胞的制备 | 第39-40页 |
| ·大肠杆菌细胞的转化 | 第40页 |
| ·克隆载体的酶切鉴定 | 第40页 |
| ·质粒DNA 的提取 | 第40-42页 |
| ·凝胶电泳中DNA 片段的回收 | 第42页 |
| ·拟南芥转化表达载体的构建 | 第42页 |
| ·植物表达载体的转化 | 第42-44页 |
| ·根癌农杆菌GV3101 感受态细胞的制备 | 第42页 |
| ·冻融法转化农杆菌 | 第42-43页 |
| ·农杆菌介导转化拟南芥 | 第43页 |
| ·转基因拟南芥的鉴定 | 第43页 |
| ·拟南芥基因组的小量提取 | 第43-44页 |
| 3 结果与分析 | 第44-69页 |
| ·Solexa 标签文库的分析 | 第44-45页 |
| ·Solexa 标签的表达丰度分析 | 第44页 |
| ·Solexa 标签的基因定位 | 第44-45页 |
| ·N 和NR 数据库基因差异表达分析 | 第45-47页 |
| ·玉米气生根早期发育过程的调控基因 | 第47-57页 |
| ·差异表达显著的基因功能分类 | 第47页 |
| ·细胞壁代谢途径基因 | 第47-48页 |
| ·生长素信号途径和其它激素信号途径基因 | 第48-49页 |
| ·细胞循环和表观遗传学修饰相关基因 | 第49页 |
| ·基因家族 | 第49-50页 |
| ·其它可能的调节基因 | 第50-56页 |
| ·功能未知的基因 | 第56-57页 |
| ·荧光定量PCR验证基因的表达模式 | 第57-60页 |
| ·Solexa 测序结果的可靠性 | 第57-59页 |
| ·基因在玉米气生根早期发育过程的表达模式 | 第59-60页 |
| ·玉米气生根与主根转录组的比较 | 第60-63页 |
| ·玉米基因在拟南芥中异源超表达 | 第63-69页 |
| ·基因启动子元件分析 | 第64-65页 |
| ·超表达拟南芥植株的表达量测定和表型鉴定 | 第65-69页 |
| 4 讨论 | 第69-72页 |
| 5 结论 | 第72-73页 |
| 参考文献 | 第73-83页 |
| 附录 | 第83-89页 |
| 致谢 | 第89-90页 |
| 攻读学位期间发表论文情况 | 第90页 |
