药物设计的网格平台搭建
摘要 | 第1-5页 |
Abstraet | 第5-8页 |
1 绪论 | 第8-13页 |
2 网格计算技术 | 第13-25页 |
·网格的基本概念和分类 | 第13-14页 |
·网格的特征和基本要求 | 第14-15页 |
·网格的体系结构 | 第15-19页 |
·传统网格体系结构 | 第15-17页 |
·开放网格服务体系结构 | 第17-19页 |
·网格关键技术 | 第19-20页 |
·网格计算工具包及框架的组织 | 第20-25页 |
·SETI@Home项目 | 第20页 |
·Globus项目 | 第20-21页 |
·Legion项目 | 第21-22页 |
·AppLeS项目 | 第22-23页 |
·Nimrod项目 | 第23页 |
·Nimrod/G项目 | 第23页 |
·Harness项目 | 第23-25页 |
3 药物虚拟筛选中的分子对接原理及新药研发网格 | 第25-36页 |
·药物虚拟筛选中的分子对接原理 | 第25-33页 |
·互补匹配原则 | 第25-27页 |
·构象搜索算法 | 第27-30页 |
·典型分子对接软件 | 第30-33页 |
·新药研发网格 | 第33-34页 |
·搭建新药研发网格的分节点 | 第34-36页 |
4 测试平台的实现 | 第36-44页 |
·概述 | 第36页 |
·实现分子对接任务的一般流程 | 第36页 |
·平台的框架结构 | 第36-40页 |
·平台的后台实现 | 第40-42页 |
·实例与测试 | 第42-44页 |
5 基于网格计算的虚拟筛选程序 | 第44-49页 |
·新药研发网格分析 | 第44-45页 |
·虚拟筛选算法的改进 | 第45-49页 |
6 并行程序测试结果 | 第49-59页 |
·并行程序运行测试 | 第49-53页 |
·环氧合酶-2晶体结构 | 第49-50页 |
·使用 Dock小分子库测试结果 | 第50-53页 |
·并行程序和原网格实现方式的比较 | 第53-59页 |
结论与展望 | 第59-60页 |
参考文献 | 第60-62页 |
攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第62-63页 |
致谢 | 第63-64页 |
大连理工大学学位论文版权使用授权书 | 第64页 |