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含细菌群体感应淬灭酶的菌种筛选和鉴定

第一章 文献综述第1-21页
 §1-1 引言第10-15页
  1-1-1 细菌群体感应系统第10页
  1-1-2 细菌群体感应信号分子第10-13页
   1-1-2-1 革兰氏阴性细菌中的群体感应信号分子第10-11页
   1-1-2-2 其他信号分子第11页
   1-1-2-3 革兰氏阳性细菌中的群体感应信号分子第11-12页
   1-1-2-4 常见的acyl-HSL分子及其生物学功能第12-13页
  1-1-3 细菌群体感应调控机制第13-14页
   1-1-3-1 革兰氏阴性细菌群体感应调控机制第13-14页
   1-1-3-2 革兰氏阳性细菌的群体感应调节机制第14页
  1-1-4 群体感应与植物病害第14-15页
  1-1-5 群体感应与抗生素耐药第15页
 §1-2 群体感应淬灭酶第15-19页
  1-2-1 原核生物中的群体感应淬灭酶第16页
  1-2-2 真核生物中的群体感应淬灭酶第16-17页
  1-2-3 群体感应淬灭酶的作用机制和特性第17-18页
  1-2-4 AHL降解酶的生物学功能第18页
  1-2-5 AHL降解酶在生防及药理学上的应用第18-19页
 §1-3 AHL信号分子的检测方法第19页
  1-3-1 物理学的检测手段第19页
  1-3-2 运用某些细菌的色素或者荧光检测信号分子第19页
  1-3-3 薄层层析第19页
 §1-4 本实验的研究内容第19-20页
  1-4-1 含群体感应淬灭酶的菌种的筛选和纯化第19-20页
  1-4-2 含群体感应淬灭酶的菌种的鉴定第20页
  1-4-3 含群体感应淬灭酶的菌种性质研究第20页
  1-4-4 含群体感应淬灭酶的菌种对致病菌的拮抗研究第20页
 §1-5 本实验的研究目的和意义第20-21页
第二章 实验材料和方法第21-32页
 §2-1 菌种和质粒第21页
  2-1-1 菌种第21页
  2-1-2 质粒第21页
 §2-2 实验试剂第21页
 §2-3 酶类及试剂盒第21页
 §2-4 培养基和培养条件第21-22页
  2-4-1 培养基第21-22页
  2-4-2 培养条件第22页
 §2-5 实验仪器第22页
 §2-6 实验方法和步骤第22-32页
  2-6-1 菌种的筛选和纯化第22-23页
   2-6-1-1 菌种的筛选第22页
   2-6-1-2 菌种的纯化第22页
   2-6-1-3 所筛得菌株降解AHL能力的进一步验证第22-23页
    2-6-1-3-1 实验原理第22-23页
    2-6-1-3-2 实验步骤第23页
  2-6-2 菌种的鉴定第23-29页
   2-6-2-1 细菌X1的鉴定第23-27页
    2-6-2-1-1 形态学观察第23页
    2-6-2-1-2 生理生化特征第23-24页
     2-6-2-1-2-1 氧化酶试验第23页
     2-6-2-1-2-2 接触酶试验第23页
     2-6-2-1-2-3 运动性观察第23页
     2-6-2-1-2-4 V.P试验第23-24页
     2-6-2-1-2-5 明胶液化第24页
     2-6-2-1-2-6 淀粉水解第24页
     2-6-2-1-2-7 耐盐性第24页
     2-6-2-1-2-8 葡萄糖氧化发酵第24页
     2-6-2-1-2-9 甲基红试验第24页
     2-6-2-1-2-10 反硝化第24页
     2-6-2-1-2-11 果胶水解第24页
     2-6-2-1-2-12 硝酸盐还原第24页
    2-6-2-1-3 分子水平16SrDNA序列分析第24-27页
     2-6-2-1-3-1 细菌X1基因组DNA的提取第24-25页
     2-6-2-1-3-2 16SrDNA扩增PCR第25页
     2-6-2-1-3-3 PCR产物的回收和T载体连接第25-26页
     2-6-2-1-3-4 大肠杆菌DH5α感受态细胞的制备第26页
     2-6-2-1-3-5 转化大肠杆菌第26页
     2-6-2-1-3-6 阳性克隆第26页
     2-6-2-1-3-7 克隆片段DNA的测序及序列分析第26页
     2-6-2-1-3-8 系统发育分析第26-27页
   2-6-2-2 酵母菌R1的鉴定第27-29页
    2-6-2-2-1 形态与培养特征第27页
    2-6-2-2-2 酵母假菌丝的观察第27页
    2-6-2-2-3 生理生化特征第27-28页
     2-6-2-2-3-1 糖发酵试验第27页
     2-6-2-2-3-2 碳源同化试验第27页
     2-6-2-2-3-3 氮源同化试验第27页
     2-6-2-2-3-4 无维生素生长测试第27-28页
     2-6-2-2-3-5 生成类淀粉化合物试验第28页
    2-6-2-2-4 分子水平18SrDNA序列分析第28-29页
     2-6-2-2-4-1 酵母菌R1基因组DNA的提取第28页
     2-6-2-2-4-2 18SrDNA扩增PCR第28-29页
     2-6-2-2-4-3 PCR产物的回收、连接、转化、阳性克隆第29页
     2-6-2-2-4-4 系统发育分析第29页
  2-6-3 菌的性质研究第29-30页
   2-6-3-1 菌株X1和R1生长曲线测定第29页
   2-6-3-2 菌株X1和R1最适生长温度第29页
   2-6-3-3 菌株X1和R1最适生长初始pH值第29页
   2-6-3-4 菌株X1和R1对不同信号分子的降解第29-30页
    2-6-3-4-1 不同信号分子标准曲线的测定第29页
    2-6-3-4-2 菌株X1和R1对不同信号分子降解曲线的测定第29页
    2-6-3-4-3 菌株X1和R1对不同碳源的利用第29-30页
   2-6-3-5 降解酶的性质研究第30页
    2-6-3-5-1 菌株X1和R1粗酶液酶活的测定第30页
     2-6-3-5-1-1 粗酶液的制备第30页
     2-6-3-5-1-2 粗酶液酶活的测试第30页
    2-6-3-5-2 菌株X1和R1是否含水解酶的研究第30页
     2-6-3-5-2-1 菌株X1和R1基因组DNA的提取第30页
     2-6-3-5-2-2 水解酶基因的PCR扩增第30页
  2-6-4 菌株X1和R1对胡萝卜软腐病的拮抗第30-32页
   2-6-4-1 菌株X1和R1对胡萝卜软腐病的拮抗第30-31页
   2-6-4-2 菌株X1和R1粗酶液对胡萝卜软腐病的拮抗第31-32页
第三章 实验结果第32-48页
 3-1 菌种的筛选和纯化第32页
  3-1-1 菌种的筛选第32页
  3-1-2 菌种的纯化第32页
  3-1-3 所筛得菌株降解AHL能力的进一步验证第32页
 3-2 菌种的鉴定第32-41页
  3-2-1 细菌X1的鉴定第32-34页
   3-2-1-1 形态学观察第32-33页
   3-2-1-2 生理生化特征第33-34页
   3-2-1-3 分子水平16SrDNA鉴定第34页
    3-2-1-3-1 菌株X1基因组DNA的提取第34页
    3-2-1-3-2 16SrDNA的PCR扩增第34页
    3-2-1-3-3 16SrDNA序列测定第34页
  3-2-2 酵母菌R1的鉴定第34-41页
   3-2-2-1 形态学观察第34-35页
   3-2-2-2 生理生化特征第35-36页
    3-2-2-2-1 糖发酵试验第35页
    3-2-2-2-2 碳源同化试验第35-36页
    3-2-2-2-3 其他生理生化试验第36页
   3-2-2-3 分子水平18SrDNA鉴定结第36-41页
    3-2-2-3-1 菌落18SrDNA的PCR扩增结果第36-37页
    3-2-2-3-2 18SrDNA序列测定第37页
    3-2-2-3-3 序列比对结果第37-41页
    3-2-2-3-4 菌株R1的系统发育分析第41页
 3-3 菌的性质研究第41-46页
  3-3-1 菌株X1和R1生长曲线测定第41-42页
  3-3-2 菌株X1和R1最适生长温度第42-43页
  3-3-3 菌株X1和R1最适生长初始pH值第43页
  3-3-4 菌株X1和R1对不同信号分子的降解第43-45页
   3-3-4-1 不同信号分子标准曲线的测定第43-44页
   3-3-4-2 菌株X1和R1对不同信号分子降解曲线的测定第44-45页
   3-3-4-3 菌株X1和R1对不同碳源的利用第45页
  3-3-5 降解酶的性质研究第45页
   3-3-5-1 粗酶液酶活的测试第45页
  3-3-6 菌株X1和R1是否含水解酶的初步检验第45-46页
 3-4 菌株对致病菌拮抗初步研究第46-48页
  3-4-1 菌株X1和R1对胡萝卜软腐病的拮抗第46页
  3-4-2 菌株X1和R1粗酶液对胡萝卜软腐病的拮抗第46-48页
第四章 讨论第48-50页
 4-1 菌种的筛选和纯化第48页
 4-2 菌种的鉴定第48页
 4-3 菌的性质研究第48-49页
 4-4 菌株对致病菌拮抗初步研究第49-50页
第五章 结论第50-51页
参考文献第51-54页
致谢第54-55页
攻读学位期间所取得的相关科研成果第55页

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