| 摘要 | 第1-16页 |
| 前言 | 第16-17页 |
| 第一章 文献综述 | 第17-51页 |
| 1 玉蜀黍属分类学 | 第17-22页 |
| ·玉蜀黍族分类 | 第17页 |
| ·玉蜀黍属分类 | 第17-19页 |
| ·栽培玉米的分类及起源研究 | 第19-22页 |
| 2 糯玉米研究现状 | 第22-30页 |
| ·糯玉米的分布与利用 | 第22-24页 |
| ·糯玉米地方品种资源分布及其特点 | 第24-25页 |
| ·西南糯玉米种质资源的遗传多样性 | 第25-28页 |
| ·糯玉米的起源与进化 | 第28-30页 |
| 3 分子系统学研究进展 | 第30-41页 |
| ·分子进化、分子钟与中性进化学说 | 第30-33页 |
| ·遗传多样性与系统发生推断 | 第33-36页 |
| ·分子系统学研究方法 | 第36-41页 |
| ·DNA序列测定 | 第41页 |
| 4 溯祖理论与群体遗传学研究 | 第41-47页 |
| 5 分子系统发育地理学方法在农作物起源进化研究中的应用 | 第47-51页 |
| 第二章 分子标记的选择及实验体系的建立与优化 | 第51-64页 |
| 1 实验材料 | 第52页 |
| 2 实验方法 | 第52-55页 |
| ·引物设计或选择 | 第52-53页 |
| ·DNA提取 | 第53页 |
| ·PCR体系 | 第53-54页 |
| ·测序方法 | 第54-55页 |
| ·片段序列比对 | 第55页 |
| 3 结果与分析 | 第55-60页 |
| ·各引物对最适PCR条件 | 第55-56页 |
| ·各引物PCR产物大小及退火温度 | 第56-57页 |
| ·PCR产物测序结果及比较 | 第57-60页 |
| 4 讨论 | 第60-64页 |
| ·DAN提取、PCR扩增及产物纯化 | 第60-61页 |
| ·PCR产物测序策略 | 第61-62页 |
| ·ITS区的PCR扩增及测序 | 第62页 |
| ·实验样本大小 | 第62-64页 |
| 第三章 叶绿体rpL16内含子序列分析探讨糯玉米的系统位置 | 第64-73页 |
| 1 材料与方法 | 第66-67页 |
| ·材料 | 第66-67页 |
| ·DNA提取、PCR扩增与DNA测序 | 第67页 |
| ·序列分析及系统树构建 | 第67页 |
| 2 结果与分析 | 第67-71页 |
| ·序列分析 | 第67-68页 |
| ·序列比对结果 | 第68-69页 |
| ·系统树构建 | 第69-71页 |
| 3 讨论 | 第71-73页 |
| ·糯玉米的系统学位置 | 第71页 |
| ·rpL16内含子在禾本科系统学研究中应用价值 | 第71-73页 |
| 第四章 线粒体nad1基因第2内含子序列分析 | 第73-81页 |
| 1 材料与方法 | 第75-76页 |
| ·材料 | 第75页 |
| ·PCR扩增与DNA测序 | 第75-76页 |
| ·序列分析及系统树构建 | 第76页 |
| 2 结果与分析 | 第76-79页 |
| ·序列分析 | 第76页 |
| ·序列比对结果 | 第76-77页 |
| ·系统树构建 | 第77-79页 |
| 3 讨论 | 第79-81页 |
| ·糯玉米的系统学位置 | 第79页 |
| ·线粒体基因内含子变异模式 | 第79页 |
| ·线粒体nad1基因第2内含子在禾本科系统学研究中的应用价值 | 第79-81页 |
| 第五章 nrDNA的ITS序列分析 | 第81-96页 |
| 1 材料和方法 | 第83-86页 |
| ·材料 | 第83-85页 |
| ·PCR扩增与DNA测序 | 第85页 |
| ·序列分析及系统树重建 | 第85-86页 |
| ·核苷酸多态性计算及模拟检验 | 第86页 |
| 2 结果与分析 | 第86-90页 |
| ·序列分析 | 第86页 |
| ·序列多态性估计及模拟检验 | 第86-88页 |
| ·系统树重建 | 第88-90页 |
| 3 讨论 | 第90-96页 |
| ·ITS区核苷酸多态性与系统树构建 | 第90-91页 |
| ·玉米属的系统学关系 | 第91-94页 |
| ·糯玉米的系统学位置 | 第94-96页 |
| 第六章 glb1基因序列分析 | 第96-112页 |
| 1 材料与方法 | 第98-102页 |
| ·材料 | 第98-100页 |
| ·方法 | 第100-102页 |
| 2 结果与分析 | 第102-111页 |
| ·glb1序列变异 | 第102-103页 |
| ·玉米各类群间的遗传差异及其检验 | 第103-105页 |
| ·各物种间的系统学关系 | 第105-109页 |
| ·溯祖模拟 | 第109-111页 |
| 3 讨论 | 第111-112页 |
| ·糯玉米的系统学位置 | 第111页 |
| ·糯玉米的驯化及其瓶颈 | 第111-112页 |
| 第七章 waxy基因部分序列分析 | 第112-131页 |
| 1 材料与方法 | 第114-116页 |
| ·材料 | 第114-115页 |
| ·扩增及测序方法 | 第115页 |
| ·数据统计 | 第115-116页 |
| 2 结果与分析 | 第116-128页 |
| ·waxy序列变异 | 第116-117页 |
| ·waxy序列在各种群间的核苷酸多态性 | 第117-119页 |
| ·不同地理来源的群体间的遗传分化 | 第119-120页 |
| ·平衡检验 | 第120页 |
| ·各物种间的系统学关系 | 第120-128页 |
| 3 讨论 | 第128-131页 |
| ·糯玉米的系统学位置 | 第128页 |
| ·选择在玉米waxy位点的作用 | 第128-129页 |
| ·生态环境对种群分化的作用 | 第129-131页 |
| 第八章 糯玉米的地理起源与种群进化 | 第131-149页 |
| 1 材料与方法 | 第132-133页 |
| ·样本抽取及分类 | 第132页 |
| ·DNA扩增及序列测定 | 第132-133页 |
| ·遗传多样性分析 | 第133页 |
| 2 结果与分析 | 第133-146页 |
| ·核苷酸变异 | 第133-143页 |
| ·中国糯玉米种群进化及其在waxy位点的选择 | 第143页 |
| ·waxy基因单倍型模式 | 第143-144页 |
| ·waxy基因的地理系统发育分析 | 第144-146页 |
| ·中国糯玉米地理起源的统计检验 | 第146页 |
| 3 讨论 | 第146-149页 |
| ·中国糯玉米的地理起源 | 第146-147页 |
| ·中国糯玉米系统位置与地理起源的关系 | 第147-148页 |
| ·糯质表现型的遗传学思考 | 第148-149页 |
| 结语 | 第149-153页 |
| 致谢 | 第153-154页 |
| 参考文献 | 第154-160页 |
| 附图 | 第160-161页 |
