| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-21页 |
| ·虾夷扇贝概述 | 第10-11页 |
| ·虾夷扇贝分类学地位 | 第10页 |
| ·虾夷扇贝的形态学特征 | 第10页 |
| ·虾夷扇贝的生活习性和繁殖方式 | 第10页 |
| ·虾夷扇贝线粒体结构及遗传特征分析 | 第10-11页 |
| ·虾夷扇贝的养殖现状 | 第11-12页 |
| ·虾夷扇贝养殖过程中出现的问题 | 第12-13页 |
| ·虾夷扇贝养殖业健康可持续发展的解决办法 | 第13-14页 |
| ·基因文库的构建及应用 | 第14-17页 |
| ·基因组文库类型及应用 | 第14-15页 |
| ·cDNA 文库类型及应用 | 第15-17页 |
| ·经典cDNA 文库 | 第15-16页 |
| ·标准化cDNA 文库 | 第16页 |
| ·消减cDNA 文库 | 第16页 |
| ·RACE cDNA 文库 | 第16-17页 |
| ·CDNA 文库中基因克隆与筛选的主要方法 | 第17页 |
| ·图位克隆技术（Map based cloning or positional cloning） | 第17页 |
| ·同源克隆技术（Homology based candidate gene method） | 第17页 |
| ·表达序列标签法（Expressed sequence tagging method, EST） | 第17页 |
| ·基于EST 的生物信息学分析 | 第17-21页 |
| 第二章 虾夷扇贝外套膜CDNA 文库的构建 | 第21-30页 |
| 1 引言 | 第21页 |
| 2 实验材料与方法 | 第21-27页 |
| ·实验样品来源 | 第21页 |
| ·实验主要试剂 | 第21页 |
| ·菌株与载体 | 第21页 |
| ·SOC 培养基 | 第21-22页 |
| ·虾夷扇贝总RNA 的提取 | 第22页 |
| ·MRNA 的纯化及纯度检测 | 第22页 |
| ·反转录合成CDNA | 第22-27页 |
| ·15t Stand cDNA 的合成 | 第23-24页 |
| ·211d Strand cDNA 的合成 | 第24页 |
| ·接头引物连接 | 第24页 |
| ·限制酶Not I 酶切反应 | 第24-25页 |
| ·使用Spin Column 除去短链cDNA | 第25-26页 |
| ·载体连接 | 第26页 |
| ·质粒转化（电刺激法） | 第26-27页 |
| ·引物序列 | 第27页 |
| ·CDNA 文库质量检测 | 第27页 |
| 3 实验结果 | 第27-29页 |
| ·总RNA 的提取 | 第27-28页 |
| ·MRNA 纯度检测 | 第28页 |
| ·CDNA 的合成 | 第28-29页 |
| ·CDNA 文库质量检测 | 第29页 |
| 4 讨论 | 第29-30页 |
| 第三章 虾夷扇贝CDNA 文库中EST 序列分析及EST-SSR 的筛选 | 第30-39页 |
| 1 引言 | 第30页 |
| 2 实验材料与方法 | 第30-31页 |
| ·实验材料 | 第30页 |
| ·CDNA 文库的构建 | 第30页 |
| ·CDNA 文库的克隆测序与比对分析 | 第30-31页 |
| ·EST-SSR 筛选与引物设计 | 第31页 |
| 3 结果 | 第31-36页 |
| ·CDNA 文库的克隆测序与序列分析 | 第31-32页 |
| ·免疫相关基因的EST 序列功能分析 | 第32-34页 |
| ·EST 序列中SSR 查找与分析 | 第34-35页 |
| ·CDNA 文库中微卫星引物设计 | 第35-36页 |
| 4 讨论 | 第36-39页 |
| ·EST 序列中免疫相关基因的筛选与分析 | 第36-38页 |
| ·EST-SSR 分析 | 第38-39页 |
| 第四章 虾夷扇贝线粒体非编码区多态性研究 | 第39-43页 |
| 1 引言 | 第39页 |
| 2 实验材料与方法 | 第39-40页 |
| ·实验样品 | 第39页 |
| ·DNA 提取 | 第39页 |
| ·引物设计 | 第39页 |
| ·PCR 扩增反应体系 | 第39-40页 |
| ·扩增产物琼脂糖电泳检测 | 第40页 |
| ·测序及序列分析 | 第40页 |
| 3 结果 | 第40-42页 |
| ·琼脂糖电泳检测结果 | 第40页 |
| ·测序结果分析 | 第40-41页 |
| ·单元型多态性分析 | 第41-42页 |
| ·单元型的群体分布 | 第42页 |
| 4 讨论 | 第42-43页 |
| 结论 | 第43-44页 |
| 参考文献 | 第44-51页 |
| 致谢 | 第51-52页 |
| 研究生期间论文发表情况 | 第52页 |
