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基于芯片的嗜酸氧化亚铁硫杆菌的比较基因组学

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-8页
第一章 绪论第8-20页
   ·嗜酸氧化亚铁硫杆菌研究进展第8-15页
     ·嗜酸氧化亚铁硫杆菌对硫化矿浸出机理第8-11页
     ·嗜酸氧化亚铁硫杆菌呼吸链模型第11-13页
     ·嗜酸氧化亚铁硫杆菌碳代谢模型第13页
     ·嗜酸氧化亚铁硫杆菌的重金属抗性第13-15页
   ·基因芯片概述第15-17页
     ·基因芯片的产生和发展第15-16页
     ·基因芯片的应用第16-17页
   ·基于芯片的比较基因组学研究进展第17-19页
     ·比较基因组学对微生物进化的研究第17-18页
     ·比较基因组学对微生物基因组多样性与可塑性的研究第18-19页
   ·课题的研究目的与研究内容第19-20页
     ·依据和目的第19页
     ·论文课题受资助情况第19页
     ·论文的主要研究内容第19-20页
第二章 芯片的构建与评估第20-30页
   ·材料与方法第20-24页
     ·细菌的培养与基因组的提取第20-21页
     ·PCR引物设计与扩增第21-22页
     ·探针的设计第22页
     ·芯片的制作第22页
     ·DNA定浓第22-23页
     ·DNA的荧光标记与杂交第23-24页
     ·芯片扫描第24页
   ·结果第24-28页
     ·探针设计第24页
     ·杂交温度评估第24-25页
     ·灵敏度与定量性评估第25-27页
     ·芯片特异性评估第27-28页
   ·讨论第28-30页
第三章 嗜酸氧化亚铁硫杆菌比较基因组学研究第30-46页
   ·材料与方法第30-32页
     ·菌株与培养第30页
     ·酸性矿坑水全元素分析第30-31页
     ·摇瓶浸矿实验第31页
     ·细菌基因组提取、荧光标记、杂交第31页
     ·杂交信号数据分析第31-32页
   ·结果第32-39页
     ·酸性矿坑水元素组成与含量第32-33页
     ·浸矿活性第33页
     ·12株Acidithiobacillus ferrooxidans的全基因组杂交结果第33-34页
     ·各类功能基因杂交结果第34-37页
     ·杂交结果的聚类分析第37-38页
     ·杂交结果的主成分分析第38-39页
   ·讨论第39-46页
第四章 结论第46-47页
参考文献第47-54页
致谢第54-55页
研究成果第55页

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