基于DEA理论的新陈代谢网络中调控结构的代谢物浓度预测
中文摘要 | 第1-4页 |
ABSTRACT | 第4-7页 |
第一章 绪论 | 第7-11页 |
·代谢工程简介 | 第7页 |
·代谢工程的进展 | 第7-8页 |
·代谢工程中的路径分析和优化问题 | 第8-9页 |
·本文主要工作 | 第9-11页 |
第二章 生化系统中的数学模型 | 第11-20页 |
·数学模型的目的 | 第11-15页 |
·把不同的信息组合成为一致的整体 | 第11-12页 |
·在逻辑上考虑复杂系统中成分和反应的重要性 | 第12-13页 |
·发现新策略 | 第13-14页 |
·对传统观点进行重要修正 | 第14页 |
·理解定性特征 | 第14-15页 |
·新陈代谢系统分析 | 第15-17页 |
·集成动力学模型概述 | 第15-16页 |
·代谢通路分析的新模式 | 第16-17页 |
·大规模网络建模的策略 | 第17-20页 |
第三章 优化方法在代谢工程中的应用 | 第20-26页 |
·算法简介 | 第20-22页 |
·FBA | 第20-21页 |
·MOMA | 第21页 |
·ROOM | 第21-22页 |
·算例 | 第22-26页 |
·算例1 | 第22-23页 |
·算例2 | 第23-24页 |
·算例3 | 第24-26页 |
第四章 DEA 理论(基本模型及其他模型) | 第26-39页 |
·基本DEA 模型 | 第26-32页 |
·C~2R 模型 | 第26-28页 |
·具有非阿基米德无穷小的C~2R 模型 | 第28-30页 |
·C~2R 模型的生产可能集 | 第30-32页 |
·其他DEA 模型 | 第32-37页 |
·C~2GS~2 模型 | 第32-33页 |
·具有锥结构的C~2WH 模型 | 第33-34页 |
·加性DEA 模型 | 第34-35页 |
·C-D 型DEA 模型 | 第35-37页 |
·DEA 中的效率概念及其延伸 | 第37-39页 |
第五章 应用DEA 预测代谢物浓度 | 第39-51页 |
·引言 | 第39页 |
·DEA 预测模型 | 第39-41页 |
·代谢网络模型 | 第41-43页 |
·具有不同调控结构的代谢网络 | 第43-49页 |
·基于同一调控结构的预测 | 第43-48页 |
·基于表5-1 的预测(酶的变化比较大) | 第43-45页 |
·基于表5-2 的预测(酶的变化比较小) | 第45-47页 |
·基于表5-1 和表5-2 的预测 | 第47-48页 |
·基于修正后的调控结构的预测 | 第48-49页 |
·讨论 | 第49页 |
·具有相同调控结构的代谢网络 | 第49-50页 |
·结论 | 第50-51页 |
参考文献 | 第51-55页 |
发表论文和科研情况说明 | 第55-56页 |
致谢 | 第56页 |