| 中文摘要 | 第1-5页 |
| 英文摘要 | 第5-6页 |
| 目录 | 第6-8页 |
| 图和附表清单等 | 第8-9页 |
| 第一章 引言 | 第9-23页 |
| ·叶绿体介绍 | 第9-10页 |
| ·叶绿体的发现 | 第9页 |
| ·形态与结构 | 第9页 |
| ·叶绿体的半自主性 | 第9-10页 |
| ·叶绿体基因组 | 第10-11页 |
| ·叶绿体基因组的还原进化和叶绿体基因向核基因组的转移 | 第11-20页 |
| ·叶绿体基因组的还原进化和叶绿体基因向核基因组的转移 | 第11-14页 |
| ·编码蛋白如何回到原初细胞器行使功能 | 第14-17页 |
| ·转运肽编码序列的产生机制 | 第17-20页 |
| ·叶绿体起源 | 第20-22页 |
| ·非共生起源学说 | 第20-21页 |
| ·内共生起源学说 | 第21-22页 |
| ·本研究的立题依据和目的 | 第22-23页 |
| 第二章 数据和方法 | 第23-25页 |
| ·数据 | 第23-24页 |
| ·随即序列的产生 | 第24页 |
| ·cTP-like序列的预测 | 第24-25页 |
| ·统计学显著性分析 | 第25页 |
| 第三章 结果和讨论 | 第25-28页 |
| ·叶绿体转运肽(cTP)中的motif和cTP剪切位点附近的motif | 第25-26页 |
| ·cTP-like序列在三界生物系统中的分布 | 第26-28页 |
| ·蓝细菌(Cyanobacteria) | 第26页 |
| ·叶绿体基因组(Chloroplast genomes) | 第26-27页 |
| ·粘霉菌类(Slime molds) | 第27页 |
| ·植物线粒体基因组(Plant mitochondrion genomes) | 第27页 |
| ·阿尔法紫色变形球菌(Alpha purple proteobacteria) | 第27-28页 |
| ·古细菌(Archaea) | 第28页 |
| ·远古细菌(Ancient bacteria) | 第28页 |
| 第四章 结论 | 第28-30页 |
| 参考文献 | 第30-33页 |
| 致谢 | 第33-34页 |
| 附录 | 第34-54页 |
| 附件1.为本研究编写的主要PERL程序 | 第54-79页 |
| 0.pl:将一个dataset中的数据分开,使一条数据成为一个文件 | 第54-55页 |
| 1.pl:对MAST输出结果进行处理,找出motif | 第55-63页 |
| 2.pl:找出motif组合 | 第63-64页 |
| 3.pl:完善2.pl的结果 | 第64-65页 |
| 4.pl:在数据集中找出与已知motif组合相同的motif组合 | 第65页 |
| 5.pl:为运行三个预测软件做准备 | 第65-68页 |
| 6.pl:运行三个预测软 | 第68-69页 |
| 7.pl:简化chlorop结果 | 第69-70页 |
| 8.pl:简化targetp结果 | 第70-72页 |
| 9.pl:简化ipsort结果 | 第72-74页 |
| 10.pl:完善最后结果 | 第74-75页 |
| 11.pl:最后结果的完善 | 第75-76页 |
| 12.产生随机序列.pl | 第76-79页 |
