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基于天然接触数空间中的随机行走模型研究两态蛋白质的折叠动力学

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-10页
第1章 绪论第10-13页
   ·蛋白质折叠问题第10页
   ·研究蛋白质折叠的意义第10-12页
     ·研究蛋白质折叠的理论意义第10-11页
     ·研究蛋白质折叠的现实意义第11-12页
   ·实验上研究蛋白质折叠的方法第12-13页
第2章 体外小蛋白质的折叠现象和目前流行的蛋白质折叠模型第13-18页
   ·体外小蛋白质第13页
   ·体外小蛋白质的折叠现象第13-16页
     ·序列唯一决定结构第14页
     ·两态折叠现象第14-15页
     ·快速折叠现象第15页
     ·折叠速率与蛋白质的拓扑参数间的定量关系第15-16页
   ·当前流行的蛋白质折叠模型第16-17页
   ·流行的折叠模型存在的问题第17-18页
第3章 基于接触数空间随机行走的蛋白质折叠模型第18-21页
   ·随机行走模型的内容第18-19页
   ·基于随机行走模型的两态蛋白质折叠理论公式推导第19-21页
第4章 计算蛋白质的天然接触数并分析它与折叠速率之间的关系第21-39页
   ·选取要分析的蛋白质及有关实验观测数据第21-23页
   ·编写程序计算两态小蛋白质的天然接触数第23页
   ·确定折叠速率的自然对数与天然接触数的最大相关性第23-26页
   ·不同拓扑参数与折叠速率的自然对数的线性相关性的比较第26-27页
   ·理论模型中参数的确定第27-28页
   ·影响蛋白质折叠速率的其它可能因素的分析第28-39页
     ·蛋白质中氨基酸的个数对折叠速率的影响第28-30页
     ·接触的定义对线性相关性的影响第30-35页
     ·含硫氨基酸、疏水氨基酸、极性氨基酸等对折叠速率的影响第35-39页
第5章 总结分析第39-40页
参考文献第40-45页
附录第45-52页
 附表1 蛋白PDB编号和名称第45-46页
 附表2 蛋白的cbn,ch3,nopole,pole,pole2,s1bn等数据统计表第46-48页
 附表3 蛋白的glu,met,ala,ahelixh,bsheeth,bsheetl等数据统计表第48-50页
 附表4 蛋白的gev,gv等数据统计表第50-52页
致谢第52页

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