摘要 | 第1-6页 |
ABSTRACT | 第6-10页 |
第1章 绪论 | 第10-13页 |
·蛋白质折叠问题 | 第10页 |
·研究蛋白质折叠的意义 | 第10-12页 |
·研究蛋白质折叠的理论意义 | 第10-11页 |
·研究蛋白质折叠的现实意义 | 第11-12页 |
·实验上研究蛋白质折叠的方法 | 第12-13页 |
第2章 体外小蛋白质的折叠现象和目前流行的蛋白质折叠模型 | 第13-18页 |
·体外小蛋白质 | 第13页 |
·体外小蛋白质的折叠现象 | 第13-16页 |
·序列唯一决定结构 | 第14页 |
·两态折叠现象 | 第14-15页 |
·快速折叠现象 | 第15页 |
·折叠速率与蛋白质的拓扑参数间的定量关系 | 第15-16页 |
·当前流行的蛋白质折叠模型 | 第16-17页 |
·流行的折叠模型存在的问题 | 第17-18页 |
第3章 基于接触数空间随机行走的蛋白质折叠模型 | 第18-21页 |
·随机行走模型的内容 | 第18-19页 |
·基于随机行走模型的两态蛋白质折叠理论公式推导 | 第19-21页 |
第4章 计算蛋白质的天然接触数并分析它与折叠速率之间的关系 | 第21-39页 |
·选取要分析的蛋白质及有关实验观测数据 | 第21-23页 |
·编写程序计算两态小蛋白质的天然接触数 | 第23页 |
·确定折叠速率的自然对数与天然接触数的最大相关性 | 第23-26页 |
·不同拓扑参数与折叠速率的自然对数的线性相关性的比较 | 第26-27页 |
·理论模型中参数的确定 | 第27-28页 |
·影响蛋白质折叠速率的其它可能因素的分析 | 第28-39页 |
·蛋白质中氨基酸的个数对折叠速率的影响 | 第28-30页 |
·接触的定义对线性相关性的影响 | 第30-35页 |
·含硫氨基酸、疏水氨基酸、极性氨基酸等对折叠速率的影响 | 第35-39页 |
第5章 总结分析 | 第39-40页 |
参考文献 | 第40-45页 |
附录 | 第45-52页 |
附表1 蛋白PDB编号和名称 | 第45-46页 |
附表2 蛋白的cbn,ch3,nopole,pole,pole2,s1bn等数据统计表 | 第46-48页 |
附表3 蛋白的glu,met,ala,ahelixh,bsheeth,bsheetl等数据统计表 | 第48-50页 |
附表4 蛋白的gev,gv等数据统计表 | 第50-52页 |
致谢 | 第52页 |