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苏云金芽胞杆菌Cry1Ac蛋白的结构与功能及其与20-kb DNA相互作用的研究

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-14页
第一章 绪论第14-37页
   ·苏云金芽胞杆菌的生物学特性第14-15页
   ·苏云金芽胞杆菌杀虫晶体蛋白第15-26页
     ·杀虫晶体蛋白基因第15-17页
     ·杀虫晶体蛋白的命名与分类研究第17-19页
     ·杀虫晶体蛋白的结构和功能第19-26页
   ·杀虫晶体蛋白与DNA分子的相互作用第26-29页
     ·伴胞晶体和原毒素中存在DNA分子的依据第26-27页
     ·DNA分子在激活原毒素中的作用第27-29页
   ·蛋白质结构预测的研究第29-31页
   ·蛋白质与DNA相互作用荧光光谱研究第31-33页
     ·荧光猝灭技术概述第31-32页
     ·猝灭类型第32-33页
   ·蛋白质-DNA分子对接第33-35页
   ·立题依据和意义第35-37页
第二章 Bt Cry1Ac5蛋白的三维结构与功能第37-55页
   ·材料和方法第37-39页
     ·目标蛋白序列第37-38页
     ·软件和数据库第38页
     ·序列联配和同源蛋白的确定第38页
     ·Cry1Ac5三维结构模建和分子力学能量优化第38-39页
   ·结果与分析第39-51页
     ·基本参数的比较第39-40页
     ·Blastp对Brookhaven PDB蛋白结构数据库搜索的结果第40-41页
     ·序列比对第41-42页
     ·三维结构特征第42-44页
     ·Cry1Ac5与几种毒素蛋白的结构与功能比较第44-49页
     ·模型的验证第49-51页
   ·讨论第51-53页
   ·小结第53-55页
第三章 20-kb DNA和Cry1Ac5蛋白的分离纯化第55-75页
   ·材料和方法第55-65页
     ·材料第55-59页
     ·试验方法第59-65页
   ·结果与分析第65-73页
     ·Bt4.0178菌株质粒的提取及cry1Ac5基因的鉴定第65-66页
     ·全长序列的cry1Ac5基因的PCR扩增第66页
     ·中间重组质粒pUAc19的构建第66-67页
     ·表达载体pHTAc35的构建第67-69页
     ·表达载体pHTAc35电转化无晶体突变株cry~-B和鉴定第69-70页
     ·Cry1Ac5的表达第70-71页
     ·晶体中20-kb DNA的分离和回收第71-72页
     ·Cry1Ac5蛋白的分子筛凝胶层析分离纯化第72页
     ·Cry1Ac5蛋白的阴离子交换层析纯化第72-73页
   ·讨论第73-74页
   ·小结第74-75页
第四章 Cry1Ac5蛋白与20-kb DNA结合特性研究第75-89页
   ·材料和方法第76-78页
     ·材料第76页
     ·试验方法第76-78页
   ·结果第78-85页
     ·20-kb DNA结合部位第78-80页
     ·20-kb DNA的酶切结果第80-81页
     ·中肠液对回收的20-kb DNA和Cry1Ac5晶体蛋白的降解第81页
     ·Cry1Ac5晶体蛋白溶液Zeta电位分析第81-83页
     ·纯化Cry1Ac5蛋白和体外重新结合物对胰蛋白酶的敏感性第83-84页
     ·纯化Cry1Ac5蛋白和体外重新结合物对UV的敏感性第84-85页
     ·室内生物测定第85页
   ·讨论第85-87页
     ·20-kb DNA在晶体蛋白中的存在第85-86页
     ·20-kb DNA对Cry1Ac5蛋白的稳定性影响第86-87页
     ·20-kb DNA对Cry1Ac5蛋白毒力的影响第87页
   ·小结第87-89页
第五章 Cry1Ac5与20-kb DNA结合的荧光光谱分析第89-101页
   ·材料与方法第89-92页
     ·材料第89-90页
     ·试验方法第90-92页
   ·结果与分析第92-98页
     ·Cry1Ac5活化蛋白的进一步纯化第92-93页
     ·Cry1Ac5活化蛋白内源性荧光光谱的测定第93-94页
     ·20-kb DNA和ct DNA对Cry1Ac5活化蛋白内源性的荧光猝灭光谱第94-96页
     ·20-kbDNA与Cry1Ac5活化蛋白作用的结合常数和结合位点数第96页
     ·溶液离子强度对20-kbDNA和Cry1Ac5活化蛋白体系荧光强度 的影响第96-97页
     ·Cry1Ac5活化蛋白对EB-20-kbDNA体系荧光光谱的影响第97-98页
   ·讨论第98-99页
   ·小结第99-101页
第六章 Cry1Ac5与DNA的结合模式第101-113页
   ·材料和方法第101-103页
     ·材料第101-102页
     ·试验方法第102-103页
   ·结果与分析第103-109页
     ·Cry1Ac5结合DNA的位点第103-104页
     ·模型的分子动力学优化第104-105页
     ·Cry1Ac5和20-bp DNA分子对接结果第105-109页
   ·讨论第109-112页
     ·Cry1Ac5蛋白上结合20-bp DNA位点第109-111页
     ·复合物中Cry1Ac5和20-bp DNA相互作用力第111页
     ·晶体蛋白与20-kbDNA结合的新模式第111-112页
   ·小结第112-113页
第七章 主要结论和今后的研究设想第113-116页
   ·本研究的主要结论第113-114页
   ·本研究的创新点和科学意义第114页
   ·今后的研究设想第114-116页
参考文献第116-130页
攻读博士学位期间撰写和发表的论文第130-132页
致谢第132-134页

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