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猪TIM1和TIM3基因的特征与功能分析

摘要第1-9页
ABSTRACT第9-11页
缩略词表(ABBREVIATIONS)第11-12页
1 前言第12-20页
   ·研究问题的由来第12页
   ·文献综述第12-19页
     ·猪抗病性状的相关候选基因研究第12-13页
       ·FUT1基因与抗病性第12页
       ·MHC与抗病性第12页
       ·IFN基因与抗病性第12-13页
       ·Hal和NRAMP1基因与抗病性第13页
       ·Mx基因与抗病性第13页
     ·拟分离基因的研究进展第13-19页
       ·TIM基因的定位第13-14页
       ·TIM基因的结构第14-16页
       ·TIM基因的功能第16页
       ·TIM1的功能第16-17页
       ·TIM3的功能第17-18页
       ·TIM2和TIM4的功能第18页
       ·TIM基因多态与疾病的关系第18-19页
   ·本研究的目的和意义第19-20页
2 材料与方法第20-32页
   ·材料第20-24页
     ·DNA样和组织样第20页
     ·载体和菌株第20-21页
     ·主要试剂第21-22页
     ·主要仪器第22页
     ·常规试剂的配置第22-23页
     ·主要分子生物学软件第23-24页
     ·主要数据库第24页
   ·方法第24-32页
     ·总RNA提取、完整性检测、DNase Ⅰ处理以及cDNA的合成第24-25页
       ·采用TRIZOL提取组织样RNA第24页
       ·试剂盒提取RNA第24-25页
       ·RNA的完整性检测第25页
       ·总RNA的DNase-Ⅰ处理及其纯化第25页
       ·RNA的反转录第25页
     ·猪TIM1和TIM3基因CDS的克隆、组织表达谱第25-29页
       ·引物设计第25-26页
       ·PCR扩增条件第26页
       ·PCR产物回收、克隆和测序第26-28页
       ·猪TIM1和TIM3的组织表达谱第28-29页
     ·猪TIM3蛋白的亚细胞定位第29-30页
       ·猪TIM3基因亚细胞定位载体的构建第29页
       ·细胞培养以及转染第29-30页
     ·猪TIM3基因SNP鉴定、分型和关联分析第30-31页
       ·引物设计第30页
       ·SNP检测鉴定第30页
       ·PCR-RFLP第30页
       ·试验资源猪群性状测定第30-31页
       ·数据统计分析第31页
     ·猪TIM3基因5′侧翼区的克隆和报告载体的构建第31-32页
3 结果第32-47页
   ·猪TIM1和TIM3基因的基本特征第32-36页
     ·猪TIM1和TIM3的mRNA序列第32页
     ·TIM1和TIM3基因的系统进化树第32-33页
     ·猪TIM1和TIM3蛋白信号肽的预测图第33-34页
     ·猪TIM1和TIM3蛋白的跨膜预测第34-35页
     ·猪TIM1和TIM3功能域分析第35-36页
     ·部分活性位点预测第36页
       ·猪TIM1蛋白部分活性位点预测第36页
       ·猪TIM3蛋白部分活性位点预测第36页
   ·猪TIM1和TIM3的组织表达谱第36-41页
     ·猪TIM1的组织表达谱第36-37页
     ·人TIM1的组织表达情况第37-38页
     ·猪TIM3的组织表达谱第38-40页
     ·人TIM3基因的组织表达情况第40-41页
   ·猪TIM3蛋白的亚细胞定位第41-42页
     ·空载体pEGFP-N1亚细胞定位第41页
     ·猪TIM3-GFP融合蛋白的亚细胞分布第41-42页
   ·猪TIM3的SNP检测和关联分析第42-45页
     ·猪TIM3外显子和启动子的多态位点检测结果第42页
     ·关联分析第42-45页
   ·猪TIM3基因5′侧翼区的序列和报告载体的酶切图谱第45-47页
     ·猪TIM3基因5′侧翼区的序列第45-46页
     ·猪TIM3基因5′侧翼区报告载体的酶切图第46-47页
4 讨论第47-50页
   ·猪TIM1和TIM3的基本特征第47页
   ·猪TIM1和TIM3基因的组织表达谱分析第47页
   ·猪TIM3蛋白的亚细胞定位第47-48页
   ·猪TIM3的多态位点与性状关联分析第48-50页
5 小结第50-52页
   ·本研究获得的主要结果第50页
   ·本研究的创新点与特色第50页
   ·本研究的不足之处第50-51页
   ·下一步研究的思路第51-52页
参考文献第52-61页
研究生期间发表的论文第61-62页
附录一第62-63页
致谢第63页

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