| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-20页 |
| ·课题的研究背景与意义 | 第12-16页 |
| ·课题的研究背景 | 第12-14页 |
| ·课题的研究意义 | 第14-16页 |
| ·课题相关领域的研究与进展 | 第16-17页 |
| ·神经网络技术的应用与发展 | 第16页 |
| ·基因表达式编程的研究与发展 | 第16-17页 |
| ·主要研究内容 | 第17-18页 |
| ·预期结果和创新点 | 第18-19页 |
| ·预期结果 | 第18-19页 |
| ·创新点 | 第19页 |
| ·论文结构安排 | 第19-20页 |
| 第二章 蛋白质二级结构预测方法 | 第20-38页 |
| ·蛋白质简介 | 第20-24页 |
| ·蛋白质分子的组成 | 第20-21页 |
| ·蛋白质的层次结构 | 第21-23页 |
| ·蛋白质二级结构分类 | 第23-24页 |
| ·蛋白质二级结构预测概述 | 第24-29页 |
| ·蛋白质二级结构预测的基本依据 | 第24页 |
| ·蛋白质二级结构预测的发展 | 第24-25页 |
| ·蛋白质二级结构预测的经典方法 | 第25-27页 |
| ·在线预测方法资源 | 第27-28页 |
| ·预测正确率的评价方法 | 第28页 |
| ·常用的数据集 | 第28-29页 |
| ·基于神经网络的蛋白质二级结构预测 | 第29-36页 |
| ·误差反传多层前馈网络（BP 网络） | 第29-33页 |
| ·基于神经网络的蛋白质序列编码 | 第33-34页 |
| ·常用技术 | 第34-35页 |
| ·存在问题分析 | 第35-36页 |
| ·蛋白质二级结构预测存在的问题及发展前景 | 第36-37页 |
| ·本章小结 | 第37-38页 |
| 第三章 基于基因表达式编程的神经网络优化设计 | 第38-65页 |
| ·基因表达式编程简介 | 第38-46页 |
| ·GEP 的个体组成 | 第38-39页 |
| ·GEP 的基因和染色体结构 | 第39-40页 |
| ·K-表达式及编解码规则 | 第40-41页 |
| ·适应度函数的设计 | 第41-42页 |
| ·遗传操作 | 第42-43页 |
| ·GEP 算法的基本结构 | 第43-44页 |
| ·GEP 的编码特点分析 | 第44-45页 |
| ·GEP 的工作特点及成因分析 | 第45-46页 |
| ·GEP 算法的改进 | 第46-55页 |
| ·相关工作 | 第46-47页 |
| ·影响GEP 性能的关键因素 | 第47-48页 |
| ·动态突变率 | 第48-49页 |
| ·局部搜索算子（Local Search Operator） | 第49-50页 |
| ·线性适应度计算LFC | 第50-51页 |
| ·改进GEP 算法复杂度分析 | 第51页 |
| ·算法验证 | 第51-55页 |
| ·基因表达式编程优化设计人工神经网络 | 第55-64页 |
| ·相关工作 | 第56页 |
| ·问题描述 | 第56-57页 |
| ·GEP-ANN 的染色体结构 | 第57-58页 |
| ·GEP-ANN 的表达式树 | 第58-59页 |
| ·GEP-ANN 的遗传算子 | 第59-60页 |
| ·GEP-ANN 的适应度函数 | 第60页 |
| ·GEP-ANN 算法 | 第60-61页 |
| ·算法验证与分析 | 第61-64页 |
| ·本章小结 | 第64-65页 |
| 第四章 基于GEP 和ANN 的蛋白质二级结构预测 | 第65-79页 |
| ·相关工作 | 第65-66页 |
| ·神经网络用于蛋白质二级结构预测的数学基础 | 第66-67页 |
| ·编码方法 | 第67-70页 |
| ·预测算法 | 第70-72页 |
| ·实验与分析 | 第72-77页 |
| ·数据准备 | 第72-73页 |
| ·序列编码对预测精度的影响 | 第73-75页 |
| ·网络结构对预测精度的影响 | 第75-77页 |
| ·预测修正 | 第77页 |
| ·本章小结 | 第77-79页 |
| 第五章 基于复合级联神经网络的蛋白质二级结构预测 | 第79-91页 |
| ·相关工作 | 第79-80页 |
| ·神经网络集成 | 第80-83页 |
| ·神经网络集成的原理 | 第80-82页 |
| ·神经网络集成的框架 | 第82-83页 |
| ·复合级联神经网络结构 | 第83-86页 |
| ·第一层网络结构 | 第84-85页 |
| ·第二层网络结构 | 第85-86页 |
| ·编码方法 | 第86-87页 |
| ·第一层网络的编码 | 第86页 |
| ·第二层网络的编码 | 第86-87页 |
| ·实验与分析 | 第87-90页 |
| ·数据准备 | 第87-88页 |
| ·仿真实验与分析 | 第88-90页 |
| ·本章小结 | 第90-91页 |
| 第六章 结论与展望 | 第91-93页 |
| ·结论 | 第91页 |
| ·今后工作展望 | 第91-93页 |
| 参考文献 | 第93-100页 |
| 致谢 | 第100-101页 |
| 作者简介 | 第101页 |