| 摘要 | 第1-11页 |
| Abstract | 第11-13页 |
| 第1章 绪论 | 第13-35页 |
| ·同步辐射圆二色(SRCD)光谱学 | 第14-16页 |
| ·同步辐射真空紫外圆二色技术 | 第14-15页 |
| ·SRCD在结构与功能基因组学领域的应用及未来发展前景 | 第15-16页 |
| ·蛋白质构象及折叠/解折叠的研究方法 | 第16-18页 |
| ·荧光方法 | 第16-17页 |
| ·近紫外、傅里叶变换红外和拉曼光谱 | 第17页 |
| ·流体动力学 | 第17页 |
| ·构象稳定性 | 第17页 |
| ·X-ray晶体学与NMR | 第17-18页 |
| ·圆二色方法 | 第18页 |
| ·磷酸核糖焦磷酸合成酶(PRS) | 第18-22页 |
| ·嘌呤代谢异常疾病——痛风 | 第18-19页 |
| ·PRS家族在生物系统中的分布 | 第19-20页 |
| ·人源PRS1(Human PRS1,hPRS1) | 第20-22页 |
| ·溶菌酶形成淀粉样纤维 | 第22-24页 |
| ·蛋白质淀粉样病变 | 第22-23页 |
| ·溶菌酶与淀粉样病变 | 第23-24页 |
| ·蚕丝素蛋白氮端结构域 | 第24-28页 |
| ·家蚕丝 | 第24-25页 |
| ·丝素蛋白重链的构象转变 | 第25-28页 |
| 参考文献 | 第28-35页 |
| 第2章 SRCD光谱学原理、方法和数据分析过程 | 第35-59页 |
| ·基本原理 | 第35-37页 |
| ·圆二色效应的起源 | 第35页 |
| ·圆二色原理 | 第35-37页 |
| ·圆二色信号包含的信息量 | 第37-41页 |
| ·二级结构组成 | 第37-39页 |
| ·三级结构指纹 | 第39页 |
| ·辅因子结合位点的完整性 | 第39-40页 |
| ·蛋白质构象变化 | 第40页 |
| ·蛋白质折叠 | 第40-41页 |
| ·实验方法 | 第41-46页 |
| ·样品准备 | 第41页 |
| ·缓冲体系的选择 | 第41-43页 |
| ·蛋白浓度的最优化和确定方法 | 第43-44页 |
| ·样品池选择、校正与清洗 | 第44-45页 |
| ·SRCD装置校正 | 第45页 |
| ·SRCD光谱的采集 | 第45-46页 |
| ·数据分析 | 第46-54页 |
| ·SRCD数据的单位 | 第46-47页 |
| ·数据处理及处理软件 | 第47-48页 |
| ·各种二级结构计算方法与计算软件的比较 | 第48-52页 |
| ·二级结构分析的可靠性评估 | 第52-54页 |
| 参考文献 | 第54-59页 |
| 第3章 SRCD方法鉴别与疾病相关的蛋白突变体:hPRS1突变体致病机理研究 | 第59-77页 |
| ·引言 | 第59-60页 |
| ·材料与方法 | 第60-62页 |
| ·蛋白样品制备 | 第60-61页 |
| ·缓冲液制备与蛋白透析 | 第61页 |
| ·蛋白纯度、浓度与酶活测试 | 第61页 |
| ·聚集状态测定 | 第61-62页 |
| ·同步辐射圆二色实验 | 第62页 |
| ·hPRS1晶体结构分析 | 第62页 |
| ·结果与讨论 | 第62-72页 |
| ·PRS1的表达纯化以及催化活性 | 第62-63页 |
| ·点突变体对PRS1聚集效应的影响 | 第63-65页 |
| ·wt-PRS1的SRCD光谱分析 | 第65-66页 |
| ·N114S突变体的致病机理 | 第66-69页 |
| ·点突变对PRS1稳定性的影响 | 第69-70页 |
| ·其他突变体可能的致病机理 | 第70-72页 |
| ·总结 | 第72-73页 |
| 参考文献 | 第73-77页 |
| 第4章 SRCD方法分析蛋白质与配体的相互作用:ATP对溶菌酶解折叠的影响 | 第77-97页 |
| ·引言 | 第77页 |
| ·材料与方法 | 第77-80页 |
| ·材料 | 第77页 |
| ·样品制备 | 第77-78页 |
| ·蛋白浓度测定 | 第78页 |
| ·同步辐射圆二色实验 | 第78页 |
| ·超灵敏差式扫描量热测定 | 第78-79页 |
| ·内源色氨酸荧光光谱实验 | 第79页 |
| ·动态光散射实验 | 第79页 |
| ·原子力显微镜(AFM)实验 | 第79-80页 |
| ·结果 | 第80-90页 |
| ·ATP促进溶菌酶淀粉样纤维的形成 | 第80-82页 |
| ·ATP对溶菌酶溶液构象的影响 | 第82-83页 |
| ·ATP对溶菌酶热稳定的影响 | 第83-84页 |
| ·溶菌酶的非协同性解折叠 | 第84-88页 |
| ·部分展开中间态 | 第88-90页 |
| ·讨论 | 第90-94页 |
| 参考文献 | 第94-97页 |
| 第5章 SRCD方法研究β-sheet蛋白:丝素蛋白重链N端亲水区的结构与功能 | 第97-115页 |
| ·引言 | 第97-98页 |
| ·材料与方法 | 第98-100页 |
| ·蛋白样品制备 | 第98-99页 |
| ·同步辐射圆二色实验 | 第99页 |
| ·分子自组装形貌观察 | 第99-100页 |
| ·结果与讨论 | 第100-110页 |
| ·不同片段长度的FN | 第100-101页 |
| ·浓度效应 | 第101-102页 |
| ·pH效应 | 第102-106页 |
| ·甲醇效应 | 第106页 |
| ·PEO效应 | 第106-108页 |
| ·剪切力效应 | 第108-109页 |
| ·温度效应 | 第109-110页 |
| ·总结 | 第110-112页 |
| 参考文献 | 第112-115页 |
| 在读期间发表的学术论文 | 第115-117页 |
| 致谢 | 第117-118页 |
