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打顶前后烟草miRNA表达谱的生物信息学分析及靶基因的电子克隆

致谢第1-7页
摘要第7-9页
1 文献综述第9-16页
   ·烟碱生物合成调控研究现状第9-10页
   ·miRNA 是植物中主要的调控因子第10-12页
     ·植物miRNA 的特点与调节功能第10-12页
       ·植物miRNA 的特点第10-11页
       ·植物miRNA 的功能第11-12页
     ·miRNA 在生物调控中的研究第12页
     ·miRNA 与植物机械(力学)胁迫第12页
   ·miRNA 的研究方法第12-15页
     ·生物信息学方法研究miRNA第12-14页
       ·miRNA 基因预测第13页
       ·miRNA 靶基因预测第13-14页
     ·生物化学实验方法研究miRNA第14页
     ·miRNA 的鉴定方法第14-15页
   ·电子克隆第15页
   ·本研究的目的与意义第15-16页
2 烟草打顶前后根尖组织miRNA 分析第16-30页
   ·技术路线第16页
   ·结果与分析第16-30页
     ·测序结果及样品间公共序列分析第16-18页
       ·测序结果第16-18页
       ·样品间公共序列分析第18页
     ·smallRNA 分类与注释结果第18-20页
     ·样品中已知miRNA 结果分析第20-22页
     ·miRNA 预测结果第22-30页
       ·预测结果与碱基位点分析第23-24页
       ·Novel miRNA 的二级结构折叠分析第24-30页
3 目的靶基因序列的全长电子克隆第30-35页
   ·方法与过程第30-31页
     ·寻找探针EST 序列第30-31页
     ·搜寻非冗余数据库第31页
     ·搜寻烟草EST 数据库找出部分重叠的EST 片段第31页
     ·序列拼接第31页
     ·全长基因判断及实验验证第31页
     ·RT-PCR 验证第31页
   ·结果与分析第31-35页
     ·全长cDNA 克隆结果第31-34页
     ·验证结果第34-35页
4 不同烟草中GS2 的生物信息学分析第35-38页
   ·分析方法与流程第35页
     ·研究GS2 的意义第35页
   ·结果与分析第35-38页
     ·构建不同植物GS2 的进化树第35-36页
     ·GS2 核酸序列及推导的氨基酸序列组成和理化性质第36页
     ·GS2 前导肽预测第36页
     ·GS2 成熟肽的理化性质第36-37页
     ·二级结构预测第37页
     ·磷酸化修饰位点和结构域预测第37-38页
     ·与GS1 的亲缘关系分析第38页
5 结论与讨论第38-40页
参考文献第40-46页
英文摘要第46-47页

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