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大豆新质核互作雄性不育系选育和NJCMS1A与NJCMS1B间差异转录组、蛋白质组研究

摘要第8-10页
ABSTRACT第10-12页
缩略词第13-14页
第一章 文献综述第14-34页
    1 植物雄性不育研究进展第14-23页
        1.1 植物雄性不育概述第14-15页
        1.2 植物雄性不育类型第15-17页
        1.3 植物雄性不育的细胞学基础第17-19页
        1.4 植物雄性不育的生理生化基础第19-21页
        1.5 植物雄性不育的分子生物学基础第21-23页
    2 大豆雄性不育研究进展第23-27页
        2.1 大豆雄性不育概述第23-25页
        2.2 大豆雄性不育的基础研究第25-27页
    3 转录组学研究进展第27-29页
        3.1 转录组学研究概况第27-28页
        3.2 转录组学在植物雄性不育中的应用第28-29页
    4 蛋白质组学研究进展第29-33页
        4.1 蛋白质组学研究概况第29-31页
        4.2 蛋白质组学在植物雄性不育中的应用第31-33页
    5 本研究的目的和意义第33-34页
第二章 大豆新质核互作雄性不育系选育及不育系NJCMS1A的保持源和恢复源鉴定第34-48页
    1 材料和方法第34-36页
        1.1 植物材料第34-35页
        1.2 试验地点第35页
        1.3 试验方法第35-36页
    2 结果与分析第36-45页
        2.1 以大豆质核互作雄性不育系NJCMS1A为母本转育新不育系第36-42页
        2.2 大豆质核互作雄性不育系NJCMS1A的保持源和恢复源鉴定第42-45页
    3 讨论第45-47页
    4 小结第47-48页
第三章 大豆质核互作雄性不育系NJCMS1A与保持系NJCMS1B间差异转录组研究第48-68页
    1 材料和方法第48-54页
        1.1 植物材料第48-49页
        1.2 总RNA提取、cDNA文库构建和Illumina深度测序第49页
        1.3 转录组测序整体质量评估第49-50页
        1.4 原始数据分析第50页
        1.5 表达差异分析第50-51页
        1.6 生物信息学分析第51-52页
        1.7 实时荧光定量PCR (qRT-PCR)分析第52-54页
    2 结果与分析第54-62页
        2.1 转录组测序和序列比对第54-55页
        2.2 测序饱和度和覆盖度分析第55页
        2.3 差异表达基因(DEGs)的筛选第55-56页
        2.4 差异表达基因(DEGs)的生物信息学分析第56-60页
        2.5 差异表达基因(DEGs)分析第60-61页
        2.6 qRT-PCR验证第61-62页
    3 讨论第62-66页
        3.1 能量代谢相关DEGs与大豆质核互作雄性不育的潜在关系第63页
        3.2 转录因子相关DEGs与大豆质核互作雄性不育的潜在关系第63-64页
        3.3 花粉发育调控相关DEGs与大豆质核互作雄性不育的潜在关系第64页
        3.4 活性氧清除相关DEGs与大豆质核互作雄性不育的潜在关系第64-65页
        3.5 细胞信号转导相关DEGs与大豆质核互作雄性不育的潜在关系第65页
        3.6 其他DEGs与大豆质核互作雄性不育的潜在关系第65-66页
    4 小结第66-68页
第四章 大豆质核互作雄性不育系NJCMS1A与保持系NJCMS1B间差异蛋白质组研究第68-94页
    1 材料和方法第69-74页
        1.1 植物材料第69页
        1.2 蛋白制备第69-70页
        1.3 iTRAQ标记和SCX分馏第70-71页
        1.4 基于Q EXACTIVE的液相串联质谱分析第71页
        1.5 原始数据分析第71-72页
        1.6 生物信息学分析第72-73页
        1.7 质谱多反应监测(Multiple reaction monitoring,MRM)分析第73页
        1.8 实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析第73-74页
    2 结果与分析第74-87页
        2.1 蛋白质的定量和检测第74-75页
        2.2 iTRAQ分析结果第75-77页
        2.3 差异表达蛋白(DEPs)的筛选第77-78页
        2.4 差异表达蛋白(DEPs)的生物信息学分析第78-85页
        2.5 质谱多反应检测(MRM)分析第85-86页
        2.6 qRT-PCR验证第86-87页
    3 讨论第87-93页
        3.1 能量代谢相关DEPs与大豆质核互作雄性不育的潜在关系第87-88页
        3.2 蛋白质合成与降解代谢相关DEPs与大豆质核互作雄性不育的潜在关系第88-89页
        3.3 花发育调控相关DEPs与大豆质核互作雄性不育的潜在关系第89-90页
        3.4 细胞程序性死亡相关DEPs与大豆质核互作雄性不育的潜在关系第90-91页
        3.5 物质/次级物质代谢相关DEPs与大豆质核互作雄性不育的潜在关系第91页
        3.6 育性恢复相关DEPs与大豆质核互作雄性不育的潜在关系第91-92页
        3.7 其他DEPs与大豆质核互作雄性不育的潜在关系第92-93页
    4 小结第93-94页
第五章 大豆质核互作雄性不育系NJCMS1A与保持系NJCMS1B间差异转录组和蛋白质组结果的联合分析第94-108页
    1 材料和方法第94-96页
        1.1 植物材料第94-95页
        1.2 NJCMS1A与NJCMS1B间差异转录组和蛋白质组结果的联合分析第95页
        1.3 共有DEGs/DEPs的生物信息学分析第95页
        1.4 实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析第95-96页
    2 结果与分析第96-103页
        2.1 NJCMS1A与NJCMS1B间差异表达基因和差异表达蛋白质分析第96-97页
        2.2 NJCMS1A与NJCMS1B间差异转录组和蛋白质组结果的联合分析第97-98页
        2.3 共有DEG/DEP的生物信息学分析第98-103页
        2.4 qRT-PCR验证第103页
    3 讨论第103-107页
        3.1 能量代谢相关DEGs/DEPs与大豆质核互作雄性不育的潜在关系第103-105页
        3.2 物质合成/代谢相关DEGs/DEPs与大豆质核互作雄性不育的潜在关系第105-106页
        3.3 胁迫响应相关DEGs/DEPs与大豆质核互作雄性不育的潜在关系第106-107页
        3.4 细胞程序性死亡相关DEGs/DEPs与大豆质核互作雄性不育的潜在关系第107页
        3.5 未知功能的DEGs/DEPs与大豆质核互作雄性不育的潜在关系第107页
    4 小结第107-108页
全文结论第108-110页
本研究创新之处第110-112页
参考文献第112-132页
附录第132-150页
攻读博士学位期间发表的论文第150-152页
致谢第152页

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