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水稻盐胁迫下组蛋白乙酰化修饰特征及HATs相关基因的功能研究

摘要第5-8页
Abstract第8-11页
符号说明第12-13页
第1章 文献综述第13-28页
    1.1 染色质的结构和组成第13页
    1.2 组蛋白修饰第13-16页
        1.2.1 组蛋白乙酰化修饰与去乙酰化修饰第14-15页
        1.2.2 组蛋白甲基化修饰第15-16页
        1.2.3 组蛋白的其他共价修饰第16页
    1.3 组蛋白乙酰转移酶的研究进展第16-21页
        1.3.1 组蛋白乙酰转移酶GCN5的研究进展第17-19页
        1.3.2 组蛋白乙酰转移酶p300/CBP发现与研究第19-21页
    1.4 组蛋白乙酰化在植物生长发育和环境应答中的作用第21-27页
        1.4.1 组蛋白修饰对植物生长发育相关基因功能的调控第21-22页
        1.4.2 植物中组蛋白乙酰转移酶的研究进展第22-24页
        1.4.3 植物中组蛋白去乙酰化酶的研究进展第24-27页
    1.5 研究的目的与意义第27-28页
第2章 水稻叶片全蛋白赖氨酸乙酰化修饰的定性分析第28-51页
    2.1 前言第28-29页
    2.2 材料与方法第29-33页
        2.2.1 叶片材料与生长条件第29页
        2.2.2 全蛋白提取第29-30页
        2.2.3 胰蛋白酶酶解第30页
        2.2.4 基于抗体的修饰富集第30页
        2.2.5 液相色谱-质谱联用分析第30-31页
        2.2.6 数据库的搜索第31页
        2.2.7 生物信息学分析第31-32页
        2.2.8 蛋白免疫荧光试验第32页
        2.2.9 Western blot试验第32页
        2.2.10 间接ELISA试验第32-33页
    2.3 结果与分析第33-49页
        2.3.1 水稻叶片中赖氨酸乙酰化修饰位点的鉴定第33-37页
        2.3.2 乙酰化修饰位点的Motif基序分析第37-38页
        2.3.3 乙酰化修饰蛋白的GO功能和亚细胞定位分析第38-39页
        2.3.4 乙酰化修饰蛋白的功能富集分析第39-44页
        2.3.5 水稻叶片中组蛋白乙酰化修饰第44-47页
        2.3.6 蛋白-蛋白的互作网络分析(PPI)第47-49页
    2.4 小结与讨论第49-51页
第3章 水稻盐胁迫下组蛋白H4K5ac和H4K8ac修饰的变化特征第51-75页
    3.1 前言第51-52页
    3.2 材料与方法第52-56页
        3.2.1 试验材料第52页
        3.2.2 试验方法第52-55页
        3.2.3 数据分析第55-56页
    3.3 结果与分析第56-73页
        3.3.1 水稻幼苗盐胁迫预处理后形态鉴定第56-57页
        3.3.2 Western blot检测水稻盐胁迫下H4K5ac和H4K8ac修饰变化第57-58页
        3.3.3 水稻基因组上H4K5ac和H4K8ac修饰的分布第58-64页
        3.3.4 水稻盐胁迫下基因表达水平分析第64-67页
        3.3.5 水稻盐胁迫下H4K5ac和H4K8ac修饰变化的特征分析第67-70页
        3.3.6 水稻盐胁迫下的H4K5ac和H4K8ac修饰与基因表达水平关系第70-73页
    3.4 小结与讨论第73-75页
        3.4.1 组蛋白H4K5ac和H4K8ac在水稻基因组上的分布第73页
        3.4.2 盐胁迫水稻组蛋白修饰与基因表达的变化特征第73-75页
第4章 水稻组蛋白乙酰转移酶GCN5和p300的功能研究第75-106页
    4.1 前言第75-77页
    4.2 材料与方法第77-83页
        4.2.1 试验材料第77-78页
        4.2.2 试验方法第78-83页
    4.3 结果分析第83-102页
        4.3.1 水稻组蛋白乙酰转移酶GCN5基因的功能研究第83-94页
        4.3.2 水稻p300同源基因功能研究第94-102页
    4.4 小结与讨论第102-106页
        4.4.1 水稻GCN5基因的生物学功能分析第102-103页
        4.4.2 水稻p300同源基因的生物学功能分析第103-104页
        4.4.3 OsGCN5和OsHACs对水稻组蛋白乙酰化修饰水平的功能分析第104-106页
参考文献第106-121页
附录第121-127页
    附录1 引物汇总第121-123页
    附录2 常用试剂配制方法第123-124页
    附录3 染色质免疫沉淀(ChIP)第124-125页
    附录4 ChIP-seq文库的构建(NEBNext MLtra Ⅱ试剂盒)第125-126页
    附录5 水稻农杆菌介导的遗传转化第126-127页
致谢第127-128页
攻读博士学位期间发表的学术论文目录第128-129页

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