摘要 | 第5-8页 |
Abstract | 第8-11页 |
符号说明 | 第12-13页 |
第1章 文献综述 | 第13-28页 |
1.1 染色质的结构和组成 | 第13页 |
1.2 组蛋白修饰 | 第13-16页 |
1.2.1 组蛋白乙酰化修饰与去乙酰化修饰 | 第14-15页 |
1.2.2 组蛋白甲基化修饰 | 第15-16页 |
1.2.3 组蛋白的其他共价修饰 | 第16页 |
1.3 组蛋白乙酰转移酶的研究进展 | 第16-21页 |
1.3.1 组蛋白乙酰转移酶GCN5的研究进展 | 第17-19页 |
1.3.2 组蛋白乙酰转移酶p300/CBP发现与研究 | 第19-21页 |
1.4 组蛋白乙酰化在植物生长发育和环境应答中的作用 | 第21-27页 |
1.4.1 组蛋白修饰对植物生长发育相关基因功能的调控 | 第21-22页 |
1.4.2 植物中组蛋白乙酰转移酶的研究进展 | 第22-24页 |
1.4.3 植物中组蛋白去乙酰化酶的研究进展 | 第24-27页 |
1.5 研究的目的与意义 | 第27-28页 |
第2章 水稻叶片全蛋白赖氨酸乙酰化修饰的定性分析 | 第28-51页 |
2.1 前言 | 第28-29页 |
2.2 材料与方法 | 第29-33页 |
2.2.1 叶片材料与生长条件 | 第29页 |
2.2.2 全蛋白提取 | 第29-30页 |
2.2.3 胰蛋白酶酶解 | 第30页 |
2.2.4 基于抗体的修饰富集 | 第30页 |
2.2.5 液相色谱-质谱联用分析 | 第30-31页 |
2.2.6 数据库的搜索 | 第31页 |
2.2.7 生物信息学分析 | 第31-32页 |
2.2.8 蛋白免疫荧光试验 | 第32页 |
2.2.9 Western blot试验 | 第32页 |
2.2.10 间接ELISA试验 | 第32-33页 |
2.3 结果与分析 | 第33-49页 |
2.3.1 水稻叶片中赖氨酸乙酰化修饰位点的鉴定 | 第33-37页 |
2.3.2 乙酰化修饰位点的Motif基序分析 | 第37-38页 |
2.3.3 乙酰化修饰蛋白的GO功能和亚细胞定位分析 | 第38-39页 |
2.3.4 乙酰化修饰蛋白的功能富集分析 | 第39-44页 |
2.3.5 水稻叶片中组蛋白乙酰化修饰 | 第44-47页 |
2.3.6 蛋白-蛋白的互作网络分析(PPI) | 第47-49页 |
2.4 小结与讨论 | 第49-51页 |
第3章 水稻盐胁迫下组蛋白H4K5ac和H4K8ac修饰的变化特征 | 第51-75页 |
3.1 前言 | 第51-52页 |
3.2 材料与方法 | 第52-56页 |
3.2.1 试验材料 | 第52页 |
3.2.2 试验方法 | 第52-55页 |
3.2.3 数据分析 | 第55-56页 |
3.3 结果与分析 | 第56-73页 |
3.3.1 水稻幼苗盐胁迫预处理后形态鉴定 | 第56-57页 |
3.3.2 Western blot检测水稻盐胁迫下H4K5ac和H4K8ac修饰变化 | 第57-58页 |
3.3.3 水稻基因组上H4K5ac和H4K8ac修饰的分布 | 第58-64页 |
3.3.4 水稻盐胁迫下基因表达水平分析 | 第64-67页 |
3.3.5 水稻盐胁迫下H4K5ac和H4K8ac修饰变化的特征分析 | 第67-70页 |
3.3.6 水稻盐胁迫下的H4K5ac和H4K8ac修饰与基因表达水平关系 | 第70-73页 |
3.4 小结与讨论 | 第73-75页 |
3.4.1 组蛋白H4K5ac和H4K8ac在水稻基因组上的分布 | 第73页 |
3.4.2 盐胁迫水稻组蛋白修饰与基因表达的变化特征 | 第73-75页 |
第4章 水稻组蛋白乙酰转移酶GCN5和p300的功能研究 | 第75-106页 |
4.1 前言 | 第75-77页 |
4.2 材料与方法 | 第77-83页 |
4.2.1 试验材料 | 第77-78页 |
4.2.2 试验方法 | 第78-83页 |
4.3 结果分析 | 第83-102页 |
4.3.1 水稻组蛋白乙酰转移酶GCN5基因的功能研究 | 第83-94页 |
4.3.2 水稻p300同源基因功能研究 | 第94-102页 |
4.4 小结与讨论 | 第102-106页 |
4.4.1 水稻GCN5基因的生物学功能分析 | 第102-103页 |
4.4.2 水稻p300同源基因的生物学功能分析 | 第103-104页 |
4.4.3 OsGCN5和OsHACs对水稻组蛋白乙酰化修饰水平的功能分析 | 第104-106页 |
参考文献 | 第106-121页 |
附录 | 第121-127页 |
附录1 引物汇总 | 第121-123页 |
附录2 常用试剂配制方法 | 第123-124页 |
附录3 染色质免疫沉淀(ChIP) | 第124-125页 |
附录4 ChIP-seq文库的构建(NEBNext MLtra Ⅱ试剂盒) | 第125-126页 |
附录5 水稻农杆菌介导的遗传转化 | 第126-127页 |
致谢 | 第127-128页 |
攻读博士学位期间发表的学术论文目录 | 第128-129页 |