摘要 | 第10-12页 |
Abstract | 第12-13页 |
1 Introduction | 第14-58页 |
1.1 Fruits | 第14-15页 |
1.2 Melon introduction and its classification | 第15-16页 |
1.3 Melon botany and its origin | 第16-17页 |
1.4 Physiological changes occur during ripening in melon | 第17-19页 |
1.5 Biochemical changes occur during ripening in melon | 第19-24页 |
1.5.1 Carbohydrate metabolism | 第19-21页 |
1.5.2 Organic acids | 第21-22页 |
1.5.3 Cell wall metabolism | 第22-24页 |
1.6 Molecular markers | 第24-32页 |
1.6.1 Categories of molecular markers | 第25页 |
1.6.2 Dominant DNA markers | 第25-26页 |
1.6.3 Co-dominant markers | 第26-32页 |
1.7 Sequencing technology | 第32-35页 |
1.7.1 High-throughput sequencing | 第32页 |
1.7.2 Application of High-throughput sequencing | 第32-35页 |
1.8 Quantitative trait loci (QTL) | 第35-40页 |
1.8.1 Mapping population | 第37-39页 |
1.8.2 Linkage map analysis | 第39页 |
1.8.3 Determination of genetic distance | 第39-40页 |
1.8.4 Statistical methods to detect QTL | 第40页 |
1.9 Various genetic basis studies for QTL detection in melon and other fruits | 第40-56页 |
1.10 Objectives of current research | 第56-57页 |
1.11 Technical route of research | 第57页 |
1.12 Annual research plan | 第57-58页 |
2 Materials and methods | 第58-70页 |
2.1 Field trials and methods | 第58-61页 |
2.1.1 Experimental material | 第58页 |
2.1.2 Greenhouse test design | 第58-59页 |
2.1.3 Seed treatment | 第59页 |
2.1.4 Raising of nursery seedlings | 第59-60页 |
2.1.5 Selfing of F2:3 plant population | 第60页 |
2.1.6 Phenotypic evaluation for fruit traits | 第60-61页 |
2.2 Molecular experiment reagents and instruments | 第61-65页 |
2.2.1 Required reagents | 第61-62页 |
2.2.2 Molecular experiment instruments | 第62页 |
2.2.3 Preparation of required reagents | 第62-65页 |
2.3 Molecular experiment procedures | 第65-68页 |
2.3.1 Sequencing library assembling | 第65-66页 |
2.3.2 Assembling of CAPS markers by High-throughput sequencing information | 第66页 |
2.3.3 CAPS markers designing | 第66-67页 |
2.3.4 PCR for CAPS markers verification and genotyping | 第67-68页 |
2.3.5 Restriction endonuclease (RE) digestion reaction | 第68页 |
2.4 Molecular markers data analysis method | 第68-70页 |
2.4.1 CAPS markers genotyping data analysis procedure and method | 第68页 |
2.4.2 Genetic map assembling and QTL analysis | 第68-69页 |
2.4.3 Statistical analysis | 第69-70页 |
3 Results and analysis | 第70-86页 |
3.1 Analysis of SNPs distribution on chromosomes of melon genome | 第70-71页 |
3.2 Analysis of CAPS polymorphism screening and DNA detection | 第71-72页 |
3.3 Analysis of linkage map construction through novel CAPSs | 第72-74页 |
3.4 Analysis of melon fruit traits | 第74-79页 |
3.4.1 Analysis of fruit weight | 第74页 |
3.4.2 Analysis of fruit firmness | 第74-75页 |
3.4.3 Analysis of fruit length and width | 第75页 |
3.4.4 Analysis of fruit shape | 第75页 |
3.4.5 Analysis of flesh firmness | 第75页 |
3.4.6 Analysis of Brix | 第75-76页 |
3.4.7 Analysis of p H | 第76页 |
3.4.8 Analysis of TA (titratable acidity) | 第76-79页 |
3.5 Anaysis of QTLs related to fruit traits | 第79-86页 |
3.5.1 Analysis of fruit weight QTLs | 第79页 |
3.5.2 Analysis of fruit firmness QTLs | 第79-80页 |
3.5.3 Analysis of flesh firmness QTLs | 第80页 |
3.5.4 Analysis of Brix QTLs | 第80-81页 |
3.5.5 Analysis of fruit length, width and shape QTLs | 第81-82页 |
3.5.6 Analysis of p H QTLs | 第82页 |
3.5.7 Analysis of TA (titratable acidity) QTLs | 第82-86页 |
4 Discussion | 第86-94页 |
4.1 Importance of molecular markers | 第86页 |
4.2 Linkage map assembling by CAPS markers | 第86-88页 |
4.3 Detection of melon fruit traits QTLs | 第88-92页 |
4.3.1 Fruit weight QTLs | 第88-89页 |
4.3.2 Fruit length, width and shape QTLs | 第89-90页 |
4.3.3 Fruit firmness and flesh firmness QTLs | 第90-91页 |
4.3.4 Fruit Brix QTLs | 第91-92页 |
4.3.5 Fruit pH and TA QTLs | 第92页 |
4.4 Innovative points | 第92-94页 |
5 Conclusion | 第94-95页 |
5.1 Fruit traits segregation | 第94页 |
5.2 SNP-CAPS markers assembling | 第94页 |
5.3 Linkage mapping and QTL analysis | 第94-95页 |
Acknowledgement | 第95-96页 |
References | 第96-115页 |
Appendix | 第115-119页 |
Papers published during the time period of Ph.D education | 第119页 |