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水稻胚乳发育早期印迹基因的验证与OsFIE2印迹效应的探讨

本论文的创新点及意义第5-11页
中文摘要第11-14页
Abstract第14-17页
缩写符号的中英文全称第18-19页
第1章 文献综述第19-38页
    1.1 水稻胚乳的发育第19-21页
        1.1.1 水稻胚乳发育的过程第19-20页
        1.1.2 水稻胚乳发育的时间进程第20-21页
    1.2 水稻早期胚乳发育的研究方法第21-22页
        1.2.1 苯胺蓝与DAPI染色法第21页
        1.2.2 PI染色法第21-22页
        1.2.3 Eosin B染色法第22页
    1.3 水稻PcG基因研究进展第22-27页
        1.3.1 水稻OsFIE1和OsFIE2的研究现状第24-25页
        1.3.2 水稻OsEMF2a和OsEMF2b的研究现状第25-26页
        1.3.3 水稻OsCLF和OsiEZ1的研究现状第26-27页
    1.4 印迹基因研究进展第27-35页
        1.4.1 印迹基因的主要特点第28-29页
        1.4.2 印迹基因的研究方法第29-31页
        1.4.3 印迹基因的作用机理第31-34页
        1.4.4 印迹基因的发生原因——亲本冲突假说第34页
        1.4.5 印迹基因的生物学意义第34-35页
    1.5 水稻胚乳发育早期印迹基因研究现状第35-36页
    1.6 本文研究的目的与意义第36-38页
第2章 水稻早期胚乳的高效分离方法第38-52页
    2.1 材料与实验方法第39-42页
        2.1.1 材料第39页
        2.1.2 两个水稻品种的杂交第39-40页
        2.1.3 胚乳分离前的准备工作第40页
        2.1.4 早期胚乳分离后的DAPI染色第40页
        2.1.5 微量胚乳RNA的提取第40页
        2.1.6 胚乳mRNA反转录成cDNA第40-41页
        2.1.7 用RT-PCR和表达模式检测分离的胚乳和提取RNA的质量第41-42页
    2.2 实验结果第42-49页
        2.2.1 水稻早期胚乳的发育进程第42-44页
        2.2.2 胚乳的分离和观察程序第44-45页
        2.2.3 样品收集和游离胚乳核的观察第45-46页
        2.2.4 分离的微量胚乳的RNA提取第46页
        2.2.5 用于基因表达分析的RNA的质量评估第46-47页
        2.2.6 用特异表达基因检测分离胚乳的纯度第47-49页
    2.3 结论与讨论第49-51页
        2.3.1 现有分离方法的局限性第49页
        2.3.2 微吸管收集法的特点第49-50页
        2.3.3 施用微吸管收集法的注意事项第50-51页
    2.4 本章小结第51-52页
第3章 水稻PcG基因的表达模式分析第52-88页
    3.1 材料与方法第52-56页
        3.1.1 实验材料第52-53页
        3.1.2 六个PcG基因结构的生物信息学分析第53-54页
        3.1.3 水稻籼、粳两个亚种SNP位点的查找第54页
        3.1.4 转录本父母本等位基因表达模式的分析方法第54-55页
        3.1.5 子房授粉后的逆境处理方法第55-56页
    3.2 实验结果第56-84页
        3.2.1 PcG基因的生物信息学分析第56-64页
            3.2.1.1 OsFIE1的生物信息学分析及引物设计第56-58页
            3.2.1.2 OsFIE2的生物信息学分析及引物设计第58-59页
            3.2.1.3 OsEMF2a的生物信息学分析及引物设计第59-61页
            3.2.1.4 OsEMF2b的生物信息学分析及引物设计第61页
            3.2.1.5 OsCLF的生物信息学分析及引物设计第61-63页
            3.2.1.6 OsiEZ1的生物信息学分析及引物设计第63-64页
        3.2.2 父母本等位基因的表达在水稻胚乳发育早期呈显著的动态变化第64-71页
            3.2.2.1 OsFIE1的父母本等位基因表达变化情况第65-66页
            3.2.2.2 OsFIE2的父母本等位基因表达变化情况第66-67页
            3.2.2.3 OsEMF2a短转录本的父母本等位基因表达变化情况第67-68页
            3.2.2.4 OsEMF2a 长转录本的父母本等位基因表达变化情况第68-69页
            3.2.2.5 OsEMF2b的父母本等位基因表达变化情况第69页
            3.2.2.6 OsiEZ1短转录本的父母本等位基因表达变化情况第69-70页
            3.2.2.7 OsiEZ1长转录本的父母本等位基囚表达变化情况第70-71页
            3.2.2.8 OsCLF的父母本等位基因表达第71页
        3.2.3 正反交对胚乳中父母本等位基因表达的影响第71-75页
            3.2.3.1 正反交对OsFIE1和OsFIE2父母本等位基因表达的影响第72页
            3.2.3.2 正反交对OsEMF2a长短转录本父母本等位基因表达的影响第72-73页
            3.2.3.3 正反交对OsEMF2b父母本等位基因表达的影响第73-74页
            3.2.3.4 正反交对OsiEZ1长短转录本的父母本等位基因表达的影响第74-75页
        3.2.4 更换杂交的亲本对胚乳中父母本等位基因表达的影响第75-77页
            3.2.4.1 更换杂交的亲本对OsEMF2a父母本等位基因表达的影响第75-76页
            3.2.4.2 更换杂交亲本对OsFIE2父母本等位基因表达的影响第76页
            3.2.4.3 更换杂交亲本对OsiEZ1父母本等位基因表达的影响第76-77页
        3.2.5 相同基因的不同转录本的父母本等位基因的表达模式不相同第77-80页
            3.2.5.1 OsEMF2a的长、短转录本父母本等位基因表达模式的差异第77-78页
            3.2.5.2 OsiEZ1的长、短转录本父母本等位基因表达模式的差异第78-80页
        3.2.6 环境因子改变对印迹基因的父母本等位基因表达模式的影响第80-84页
            3.2.6.1 处理条件以及处理后植株与子房形态的变化第80-81页
            3.2.6.2 物理胁迫处理后对等位基因表达模式的影响第81-83页
            3.2.6.3 化学胁迫处理后对等位基因表达模式的影响第83-84页
    3.3 结论与讨论第84-87页
        3.3.1 早期胚乳发育是印迹基因分析的关键阶段第84页
        3.3.2 动态变化(阶段性表达)是印迹基因的普遍特点第84-86页
        3.3.3 父母本等位基因表达会受特定亲本材料的影响第86-87页
    3.4 本章小结第87-88页
第4章 OsFIE2突变体的创制、筛选与鉴定第88-107页
    4.1 实验方法第88-93页
        4.1.1 OsFIE2的基因结构的生物信息学分析第88-89页
        4.1.2 突变体种子的萌发第89页
        4.1.3 突变体基因组DNA的提取第89-90页
        4.1.4 水稻幼穗总RNA的提取第90-91页
        4.1.5 引物设计第91页
        4.1.6 PCR扩增条件第91-92页
        4.1.7 末知突变的测序检测方法第92页
        4.1.8 已知突变的酶切检测方法第92页
        4.1.9 杂合突变体花粉败育率统计第92-93页
        4.1.10 Zh11杂合突变体自交子房的形态学统计第93页
    4.2 实验结果第93-104页
        4.2.1 水稻OsFIE2的基因结构的生物信息学分析第93-94页
        4.2.2 EMS点突变株的鉴定第94-95页
        4.2.3 中花C338点突变株的分析第95-96页
        4.2.4 中花C338杂合点突变株后代的酶切检测第96-97页
        4.2.5 杂合植株自交的籽粒成苗的基因型之比为0:2:1第97-98页
        4.2.6 Zh11的野生型和杂合突变体的花粉败育率比较第98-99页
        4.2.7 杂合体植株自交时子房(胚乳)发育程度不一致第99-104页
    4.3 结论与讨论第104-106页
        4.3.1 EMS诱导的水稻点突变也能获得理想的突变体材料第104-105页
        4.3.2 OsFIE2等位基因中的一条突变严重影响胚乳的发育进程第105页
        4.3.3 OsFIE2两条等位基因都突变得不到纯合植株第105-106页
    4.4 本章小结第106-107页
第5章 OsFIE2印迹效应的分析第107-137页
    5.1 实验方法第107-109页
        5.1.1 水稻子房透明PI染色观察法第107-108页
        5.1.2 比较FAA和卡诺两种固定液对水稻子房的固定效果第108页
        5.1.3 突变体的剪颖杂交方法与子房的形态学观察第108-109页
        5.1.4 突变体的点颖自交方法与子房的形态学观察第109页
    5.2 实验结果第109-132页
        5.2.1 FAA和卡诺的固定效果比较第109-110页
        5.2.2 日本晴、Zh11与9311三种野生型自交胚乳的发育进程分析第110-112页
        5.2.3 Zh11杂合突变体自交产生的三类子房的胚乳发育进程分析第112-116页
        5.2.4 Zh11野生型×Zh11杂合突变体,两类子房的胚乳发育进程分析第116-119页
        5.2.5 Zh11杂合突变体×Zh11野生型,两类子房的胚乳发育进程分析第119-121页
        5.2.6 9311野生型xZh11杂合突变体,两类子房的胚乳发育进程分析第121-125页
        5.2.7 Zh11杂合突变体x9311野生型,两类子房的胚乳发育进程分析第125-127页
        5.2.8 Zh11杂合突变体×日本晴过表达植株,两类子房的胚乳发育进程分析第127-130页
        5.2.9 日本晴过表达植株xZh11杂合突变体,两类子房的胚乳发育进程分析第130-132页
    5.3 结论与讨论第132-136页
        5.3.1 纯合突变致死的机制第132-133页
        5.3.2 OsFIE2单等位基因点突变引起子房发育滞后的机制第133-134页
        5.3.3 OsFIE2点突变推迟胚乳细胞化起始的原因第134-135页
        5.3.4 OsFIE2的印迹效应第135-136页
    5.4 本章小结第136-137页
附录第137-151页
    附录1第137-140页
    附录2:补充图片第140-151页
参考文献第151-167页
在读博士期间发表的论文第167-168页
致谢第168页

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