| 摘要 | 第4-7页 |
| Abstract | 第7-10页 |
| 英文缩略语 | 第11-15页 |
| 第一部分：亚牛磺酸合成缺陷胶质瘤细胞的基因表达谱分析 | 第15-65页 |
| 1 前言 | 第15-16页 |
| 2 材料与方法 | 第16-36页 |
| 2.1 实验材料 | 第16-19页 |
| 2.1.1 细胞系 | 第16-17页 |
| 2.1.2 主要器材耗材 | 第17页 |
| 2.1.3 主要试剂 | 第17-18页 |
| 2.1.4 主要试剂配置 | 第18页 |
| 2.1.5 主要仪器 | 第18-19页 |
| 2.2 实验方法 | 第19-36页 |
| 2.2.1 Real-timePCR检测相关实验 | 第19-25页 |
| 2.2.2 RNAseq基因表达谱分析 | 第25-28页 |
| 2.2.3 测序数据质量评估 | 第28-30页 |
| 2.2.4 序列对比分析(ΔADO与VCT) | 第30页 |
| 2.2.5 基因表达水平分析 | 第30-31页 |
| 2.2.6 RNA-seq整体质量评估 | 第31-32页 |
| 2.2.7 基因差异表达分析 | 第32-35页 |
| 2.2.8 亚牛磺酸的检测 | 第35-36页 |
| 3 结果 | 第36-58页 |
| 3.1 细胞培养结果 | 第36-37页 |
| 3.2 RNA提取结果 | 第37-38页 |
| 3.3 RNAseq基因表达谱分析 | 第38-44页 |
| 3.3.1 原始序列数据结果 | 第38-39页 |
| 3.3.2 测序错误率分布检查 | 第39页 |
| 3.3.3 GC含量分布检查 | 第39-40页 |
| 3.3.4 测序数据过滤 | 第40-41页 |
| 3.3.5 测序数据质量情况汇总。见表(3.2) | 第41页 |
| 3.3.6 ΔADO与VCT序列比对分析 | 第41页 |
| 3.3.7 Reads在ΔADO与VCT基因比对情况统计 | 第41-42页 |
| 3.3.8 Reads在ΔADO与VCT序列区域的分布情况 | 第42-43页 |
| 3.3.9 Reads在ΔADO与VCT序列染色体上的密度分布情况 | 第43-44页 |
| 3.3.10 基因表达水平分析 | 第44页 |
| 3.4 RNA-seq整体质量评估 | 第44-47页 |
| 3.4.1 表达水平的饱和曲线检查 | 第44-46页 |
| 3.4.2 均一性分布 | 第46-47页 |
| 3.4.3 RNA-Seq相关性检查 | 第47页 |
| 3.5 基因差异表达分析 | 第47-50页 |
| 3.5.1 基因表达水平对比 | 第47-48页 |
| 3.5.2 差异表达基因列表 | 第48-49页 |
| 3.5.3 差异表达基因筛选 | 第49-50页 |
| 3.5.4 差异基因聚类分析 | 第50页 |
| 3.6 差异基因GO富集分析 | 第50-55页 |
| 3.6.1 差异基因GO富集列表 | 第50-52页 |
| 3.6.2 差异基因GO富集柱状图 | 第52-53页 |
| 3.6.3 差异基因GO富集DAG图 | 第53-55页 |
| 3.7 差异基因蛋白互作网络分析 | 第55-56页 |
| 3.8 差异基因KEGG富集分析 | 第56-58页 |
| 3.8.1 差异基因KEGG富集列表 | 第56-57页 |
| 3.8.2 富集KEGG通路图 | 第57页 |
| 3.8.3 差异基因KEGG富集散点图 | 第57-58页 |
| 4 讨论 | 第58-62页 |
| 5 结论 | 第62-63页 |
| 参考文献 | 第63-65页 |
| 第二部分：亚牛磺酸通过影响Wnt5a启动子甲基化水平影响胶质瘤细胞侵袭 | 第65-87页 |
| 1 前言 | 第65-67页 |
| 2 材料与方法 | 第67-76页 |
| 2.1 实验材料 | 第67-69页 |
| 2.1.1 主要试剂 | 第67-68页 |
| 2.1.2 主要仪器 | 第68-69页 |
| 2.2 实验方法 | 第69-76页 |
| 2.2.1 细胞培养 | 第69页 |
| 2.2.2 PCR | 第69-72页 |
| 2.2.3 cDNA合成 | 第72-73页 |
| 2.2.4 WB分析 | 第73-75页 |
| 2.2.5 亚牛磺酸检测 | 第75页 |
| 2.2.6 Transwell | 第75页 |
| 2.2.7 琼脂糖凝胶电泳 | 第75-76页 |
| 2.2.8 WST——细胞生长曲线的测定 | 第76页 |
| 2.2.9 统计分析 | 第76页 |
| 3 结果 | 第76-79页 |
| 3.1 ADO基因沉默能够促进WNT5A表达 | 第76-77页 |
| 3.2 增加亚牛磺酸可导致WNT5A低表达 | 第77页 |
| 3.3 亚牛磺酸增加WNT5A启动子甲基化水平 | 第77-79页 |
| 4 讨论 | 第79-82页 |
| 5 结论 | 第82-83页 |
| 本研究创新性自我评价 | 第83-84页 |
| 参考文献 | 第84-87页 |
| 综述 | 第87-104页 |
| 参考文献 | 第99-104页 |
| 攻读学位期间取得的研究成果 | 第104-105页 |
| 致谢 | 第105-107页 |
| 个人简历 | 第107-109页 |
| 附表 | 第109-145页 |
