| 摘要 | 第6-8页 |
| abstract | 第8-9页 |
| 第一章 绪论 | 第11-17页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第11-12页 |
| 1.2 研究现状 | 第12-14页 |
| 1.3 完成工作和创新点 | 第14-15页 |
| 1.4 本文的组织结构 | 第15-17页 |
| 第二章 基因调控网络模型构建 | 第17-24页 |
| 2.1 数据集 | 第17-18页 |
| 2.2 基因调控网络常用构建模型 | 第18-22页 |
| 2.2.1 布尔网络 | 第18-19页 |
| 2.2.2 微分方程 | 第19-20页 |
| 2.2.3 神经网络 | 第20-21页 |
| 2.2.4 贝叶斯网络 | 第21页 |
| 2.2.5 信息论模型 | 第21-22页 |
| 2.3 多模型融合方法 | 第22-23页 |
| 2.4 本章小结 | 第23-24页 |
| 第三章 常微分方程和柔性神经树集成模型构建基因调控网络 | 第24-33页 |
| 3.1 常微分方程模型 | 第24页 |
| 3.2 柔性神经树模型 | 第24-26页 |
| 3.3 模型融合方法和评价函数 | 第26页 |
| 3.4 模型训练 | 第26-28页 |
| 3.4.1 概率增强式程序进化 | 第26-28页 |
| 3.4.2 粒子群优化 | 第28页 |
| 3.5 实验 | 第28-31页 |
| 3.5.1 实验数据 | 第28-29页 |
| 3.5.2 实验环境及参数设置 | 第29-30页 |
| 3.5.3 实验结果 | 第30-31页 |
| 3.5.4 总结 | 第31页 |
| 3.6 本章小结 | 第31-33页 |
| 第四章 基于部分互信息的贝叶斯网络模型构建基因调控网络 | 第33-41页 |
| 4.1 部分互信息模型 | 第33-34页 |
| 4.2 贝叶斯网络 | 第34页 |
| 4.3 K2算法 | 第34-35页 |
| 4.4 评价方法 | 第35-36页 |
| 4.5 实验一：模拟基因调控网络的重构 | 第36-38页 |
| 4.5.1 实验数据 | 第36页 |
| 4.5.2 实验环境及参数设置 | 第36-37页 |
| 4.5.3 实验结果 | 第37页 |
| 4.5.4 总结 | 第37-38页 |
| 4.6 实验二：大肠杆菌SOSDNA损伤修复网络的重构 | 第38-39页 |
| 4.6.1 实验数据 | 第38-39页 |
| 4.6.2 实验结果 | 第39页 |
| 4.6.3 总结 | 第39页 |
| 4.7 本章小结 | 第39-41页 |
| 第五章 总结与展望 | 第41-44页 |
| 5.1 本文总结 | 第41-42页 |
| 5.2 下一步研究 | 第42-44页 |
| 参考文献 | 第44-49页 |
| 致谢 | 第49-50页 |
| 附录 | 第50-51页 |
