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苍耳倍半萜内酯合成基因的分离与功能分析

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
缩略词第14-15页
第一章 引言第15-29页
    1.1 研究背景第15-26页
        1.1.1 植物次级代谢产物和萜类物质第15-16页
        1.1.2 倍半萜内酯第16-17页
        1.1.3 倍半萜内酯的合成途径第17-19页
        1.1.4 倍半萜内酯合成途径关键酶第19-22页
        1.1.5 苍耳简介第22-23页
        1.1.6 苍耳化学成分和功效第23-24页
        1.1.7 苍耳中倍半萜内酯合成部位第24-25页
        1.1.8 次级代谢产物合成途径上基因挖掘的方法第25-26页
    1.2 研究内容和意义第26-29页
        1.2.1 研究意义第26页
        1.2.2 研究内容第26-29页
第二章 苍耳腺体细胞及其叶片转录组文库的建立第29-65页
    2.1 前言第29-30页
    2.2 实验材料第30-31页
        2.2.1 植物材料第30页
        2.2.2 本章所用的引物第30-31页
        2.2.3 分离腺毛的缓冲液第31页
    2.3 实验方法第31-37页
        2.3.1 倍半萜内酯的提取及检测第31-32页
        2.3.2 扫描电镜观察腺毛细胞方法第32页
        2.3.3 腺毛细胞提取方法第32-33页
        2.3.4 植物总RNA的提取第33-35页
            2.3.4.1 艾德莱EASYspin plus植物RNA快速提取试剂盒第33-34页
            2.3.4.2 TRIzol法提植物总RNA第34-35页
        2.3.5 cDNA第一链的合成第35页
        2.3.6 实时荧光定量PCR第35-36页
        2.3.7 测序流程第36-37页
    2.4 实验结果第37-55页
        2.4.1 苍耳中倍半萜内酯化合物的测定第37页
        2.4.2 叶片和腺毛中倍半萜内酯含量比较第37-39页
        2.4.3 苍耳叶片表面腺毛细胞的观察和分离第39-40页
        2.4.4 苍耳叶片和腺毛总RNA质量分析第40-42页
        2.4.5 苍耳叶片和腺毛的转录组测序结果第42-55页
            2.4.5.1 测序产量概况第42-43页
            2.4.5.2 测序产量概况第43-45页
            2.4.5.3 基因注释和分类第45-47页
            2.4.5.4 GO分类第47-48页
            2.4.5.5 COG分类第48-49页
            2.4.5.6 KEGG分析第49页
            2.4.5.7 编码蛋白框预测第49-51页
            2.4.5.8 差异表达基因分析第51-53页
            2.4.5.9 测序深度分析第53-55页
    2.5 基于苍耳转录组数据库倍半萜内酯合成基因的筛选第55-60页
        2.5.1 MVA和MEP途径第55页
        2.5.2 倍半萜类化合物过渡阶段中间体的合成第55页
        2.5.3 倍半萜合酶基因挖掘第55-57页
        2.5.4 CYP450基因挖掘第57页
        2.5.5 乙酰转移酶基因挖掘第57页
        2.5.6 过氧化物水解酶/氧环化酶第57-58页
        2.5.7 醇/醛脱氢酶第58页
        2.5.8 转录因子第58页
        2.5.9 SSR分析第58-59页
        2.5.10 差异基因的表达模式分析第59-60页
    2.6 讨论第60-62页
    2.7 结论与展望第62-65页
        2.7.1 结论第62-63页
        2.7.2 展望第63-65页
第三章 苍耳倍半萜合酶基因功能分析第65-103页
    3.1 前言第65页
    3.2 材料与方法第65-69页
        3.2.1 材料第65-66页
        3.2.2 菌株和质粒第66页
        3.2.3 主要试剂第66-67页
        3.2.4 本研究所用的引物第67-68页
        3.2.5 本研究所用的仪器第68-69页
        3.2.6 引物和测序第69页
    3.3 培养基和缓冲液配制第69-71页
        3.3.1 LB培养基第69页
        3.3.2 YPDA培养基第69页
        3.3.3 酵母缺陷型培养基第69-70页
        3.3.4 TAE缓冲液第70页
        3.3.5 SDS/PAGE相关缓冲液与凝胶第70页
        3.3.6 蛋白质提取纯化相关缓冲液配方第70-71页
        3.3.7 纯化蛋白反应缓冲液第71页
    3.4 实验方法第71-79页
        3.4.1 PCR反应第71页
            3.4.1.1 引物设计第71页
            3.4.1.2 PCR反应第71页
            3.4.1.3 PCR产物进行电泳第71页
        3.4.2 PCR产物或限制性内切酶酶切片段的回收第71-72页
        3.4.3 DNA酶切反应第72页
        3.4.4 DNA连接反应第72-73页
        3.4.5 大肠杆菌(DH5α和BL21(DE3)感受态细胞的制备及转化第73-74页
        3.4.6 菌落PCR第74页
        3.4.7 质粒提取(艾德莱质粒小量快速提取试剂盒)第74-75页
        3.4.8 酵母感受细胞制备及转化第75页
        3.4.9 酵母菌液PCR鉴定第75-76页
        3.4.10 酵母诱导第76页
        3.4.11 产物提取第76页
        3.4.12 倍半萜合酶的系统发育分析第76页
        3.4.13 倍半萜合酶基因的原核表达第76-78页
            3.4.13.1 原核表达载体的构建和转化第76-77页
            3.4.13.2 目的蛋白的诱导表达第77页
            3.4.13.3 蛋白提取和纯化第77-78页
            3.4.13.4 体外酶促反应及产物分析第78页
        3.4.14 倍半萜烯的GC-MS检测第78-79页
    3.5 实验结果第79-98页
        3.5.1 叶片挥发油成分分析第79-82页
        3.5.2 苍耳倍半萜合酶基因的克隆第82-86页
        3.5.3 苍耳倍半萜合酶XsTPSs的体内功能验证第86-92页
            3.5.3.1 苍耳倍半萜合酶XsTPSs酵母表达载体构建第86页
            3.5.3.2 苍耳倍半萜合酶XsTPSs功能分析第86-92页
        3.5.4 苍耳倍半萜合酶XsTPSs的体外功能验证第92-95页
            3.5.4.1 苍耳倍半萜合酶XsTPSs原核表达载体构建第92-93页
            3.5.4.2 苍耳倍半萜合酶XsTPSs蛋白诱导表达与纯化第93页
            3.5.4.3 苍耳倍半萜合酶XsTPSs体外功能验证第93-95页
        3.5.5 苍耳倍半萜合酶XsTPSs基因表达模式和产物积累模式分析第95-98页
    3.6 讨论第98-101页
    3.7 结果与展望第101-103页
        3.7.1 实验结果第101页
        3.7.2 展望第101-103页
第四章 苍耳腺体特异性表达CYP450基因功能分析第103-125页
    4.1 前言第103-105页
    4.2 材料和方法第105-110页
        4.2.1 菌株和载体第105-106页
        4.2.2 本章所用引物第106-107页
        4.2.3 苍耳倍半萜内酯生物合成途径下游候选CYP基因的克隆第107-109页
        4.2.4 CYP450诱导表达第109页
        4.2.5 诱导产物提取及检测第109页
        4.2.6 XsCYP3催化产物的纯化第109-110页
    4.3 实验结果第110-122页
        4.3.1 苍耳CYP450基因的克隆及酵母表达载体的构建第110-113页
        4.3.2 苍耳CYP450基因的功能分析第113-121页
            4.3.2.1 功能基因筛选及分析第113-117页
            4.3.2.2 体外功能验证第117-118页
            4.3.2.3 底物特异性分析第118-121页
        4.3.3 苍耳CYP基因的表达特性分析第121-122页
    4.4 讨论第122-123页
    4.5 结论第123-124页
    4.6 展望第124-125页
参考文献第125-133页
附录第133-149页
致谢第149-151页
作者简介及在学期间发表的学术论文与研究成果第151页

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