| 致谢 | 第9-13页 |
| 缩略术语词表 | 第13-15页 |
| 摘要 | 第15-17页 |
| Abstract | 第17-18页 |
| 第一章 文献综述 | 第19-44页 |
| 引言 | 第19-20页 |
| 1.1 油菜种子的发育 | 第20-21页 |
| 1.2 油菜种子油脂的合成及其调控 | 第21-26页 |
| 1.2.1 油菜种子油脂的生物合成 | 第21-24页 |
| 1.2.2 种子油脂合成过程中的转录调控 | 第24-26页 |
| 1.3 油菜种子油脂的消减及其调控 | 第26-31页 |
| 1.3.1 油菜种子油脂的消减 | 第26-28页 |
| 1.3.2 种子油脂消减过程的调控 | 第28-31页 |
| 1.4. 种子的休眠与萌发 | 第31-38页 |
| 1.4.1 种子的休眠 | 第31页 |
| 1.4.2 植物种子的萌发 | 第31-32页 |
| 1.4.3 种子休眠与萌发的调控 | 第32-36页 |
| 1.4.4 油脂代谢与种子休眠 | 第36-38页 |
| 1.5 新一代测序技术在植物转录组中的应用 | 第38-43页 |
| 1.5.1 DNA测序技术的发展 | 第38-39页 |
| 1.5.2 转录组测序在植物研究中的应用 | 第39-43页 |
| 1.6 本实验研究的目的及意义 | 第43-44页 |
| 第二章 材料与方法 | 第44-49页 |
| 2.1 材料种植及取样方法 | 第44页 |
| 2.2 种子脂肪酸含量的测定 | 第44-45页 |
| 2.3 种子发芽速率的测定 | 第45页 |
| 2.4 中油511萌发时期取样 | 第45-46页 |
| 2.5 中油511萌发样品转录组测序流程 | 第46-49页 |
| 2.5.0 样品RNA提取 | 第46页 |
| 2.5.1 文库构建和测序 | 第46页 |
| 2.5.2 测序数据质量评估 | 第46-47页 |
| 2.5.3 与参考序列比对 | 第47页 |
| 2.5.4 基因表达分析 | 第47-48页 |
| 2.5.5 组间差异表达基因筛选 | 第48页 |
| 2.5.6 KEGG Pathway显著性富集分析 | 第48页 |
| 2.5.7 K-means聚类分析 | 第48-49页 |
| 第三章 结果与分析 | 第49-70页 |
| 3.1 不同油菜基因型在角果成熟阶段油脂积累变化趋势 | 第49-51页 |
| 3.2 不同油菜基因型发芽速率及休眠差异性分析 | 第51-54页 |
| 3.3 中油511萌发过程中油脂消减变化趋势 | 第54-55页 |
| 3.4 取样点Reads质量检测及组间相关性分析 | 第55-57页 |
| 3.4.1 取样点Reads质量检测 | 第55页 |
| 3.4.2 取样点生物学重复性分析 | 第55-57页 |
| 3.5 不同发育时期间基因表达分析 | 第57-58页 |
| 3.6 不同发育时期间种子差异表达基因的KEGG分析 | 第58-60页 |
| 3.7 油脂代谢相关途径基因的差异性表达分析 | 第60-67页 |
| 3.7.1 β-氧化途径相关基因表达差异性分析 | 第60-62页 |
| 3.7.2 乙醛酸循环途径相关基因表达差异性分析 | 第62-67页 |
| 3.8 与休眠相关基因的差异表达性分析 | 第67-68页 |
| 3.9 基因表达模式的聚类分析(K-means聚类分析) | 第68-70页 |
| 第四章 讨论 | 第70-73页 |
| 4.1 萌发时期转录组测序基因型的选取 | 第70页 |
| 4.2 油菜种子休眠的基因型差异性及取材时间的探究 | 第70页 |
| 4.3 油菜种子萌发过程中油脂消减的分子调控机制 | 第70-71页 |
| 4.4 种子休眠性相关候选基因 | 第71页 |
| 4.5 油脂代谢与种子休眠 | 第71-73页 |
| 第五章 总结 | 第73-74页 |
| 参考文献 | 第74-86页 |
