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棉花线粒体基因组测序及其细胞质雄性不育机理的初步研究

缩略词第3-4页
摘要第4-5页
abstract第5-6页
第一章 文献综述第9-19页
    1.1 引言第9页
    1.2 植物细胞器遗传物质第9-10页
    1.3 植物线粒体基因组第10-13页
        1.3.1 基因组结构与组成第10页
        1.3.2 基因第10-12页
        1.3.3 外源迁移序列第12页
        1.3.4 重复序列第12-13页
    1.4 线粒体基因的RNA编辑第13-14页
    1.5 植物线粒体与细胞质雄性不育第14-16页
        1.5.1 细胞质雄性不育第14页
        1.5.2 细胞质雄性不育基因的特点第14-15页
        1.5.3 细胞质雄性不育基因的克隆第15-16页
    1.6 棉花CMS和线粒体基因组的研究第16-18页
        1.6.1 陆地棉胞质不育系第16页
        1.6.2 陆地棉胞质不育性研究进展第16-17页
        1.6.3 棉花线粒体基因组研究进展第17-18页
    1.7 本研究的目的和意义第18-19页
第二章 棉花线粒体DNA的提取和Fosmid文库构建第19-36页
    2.1 材料与方法第19-20页
        2.1.1 植物材料与种植第19页
        2.1.2 试剂与药品第19-20页
    2.2 实验方法第20-25页
        2.2.1 分离线粒体第20页
        2.2.2 Fosmid文库构建第20-23页
        2.2.3 Fosmid质粒DNA的提取第23-25页
        2.2.4 线粒体Fosmid克隆的筛选引物第25页
        2.2.5 线粒体Fosmid克隆的筛选第25页
    2.3 结果与分析第25-33页
        2.3.1 文库构建第25-29页
        2.3.2 Fosmid文库的筛选第29-33页
    2.4 讨论第33-36页
        2.4.1 线粒体提取第33-35页
        2.4.2 Fosmid文库构建和利用第35-36页
第三章 4个陆地棉线粒体基因组测序第36-74页
    3.1 材料与方法第36-37页
        3.1.1 材料第36页
        3.1.2 线粒体DNA和RNA的提取第36页
        3.1.3 mtDNA高通量测序第36页
        3.1.4 序列测序与生物信息学分析第36-37页
    3.2 结果与分析第37-71页
        3.2.1 基因组测序第37-40页
        3.2.2 拼接验证第40-45页
        3.2.3 基因注释和RNA编辑第45-51页
        3.2.4 重复序列第51-56页
        3.2.5 序列共线性第56-58页
        3.2.6 外源迁移序列分析第58-59页
        3.2.7 进化分析第59-61页
        3.2.8 未知功能orf分析第61-71页
    3.3 讨论第71-74页
        3.3.1 棉花线粒体基因组成第71-72页
        3.3.2 基因组测序第72页
        3.3.3 陆地棉细胞质雄性不育第72-74页
第四章 ORFs和atp4的功能验证第74-96页
    4.1 材料与方法第74-84页
        4.1.1 材料第74页
        4.1.2 试验方法第74-79页
        4.1.3 不育相关orf和功能基因的克隆第79-80页
        4.1.4 表达载体和干涉载体的构建与转化第80-82页
        4.1.5 转基因后代阳性植株检测与育性分析第82-84页
    4.2 结果与分析第84-94页
        4.2.1 orf160转基因结果与分析第84-91页
        4.2.2 功能基因干涉载体转化第91-94页
    4.3 讨论第94-96页
        4.3.1 orf160转基因分析第94-95页
        4.3.2 功能基因干涉载体转基因分析第95-96页
第五章 结论第96-97页
参考文献第97-108页
附录第108-115页
致谢第115-116页
个人简介第116页

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