| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 1 绪论 | 第11-18页 |
| 1.1 转录组学研究进展 | 第11-13页 |
| 1.1.1 转录组学的发展 | 第11页 |
| 1.1.2 RNA-Seq技术优势 | 第11-12页 |
| 1.1.3 非模式生物转录组研究进展 | 第12-13页 |
| 1.2 花色苷合成相关基因的研究进展 | 第13-15页 |
| 1.2.1 查尔酮合成酶(Chalcone synthase CHS)基因 | 第13页 |
| 1.2.2 查尔酮异构酶(chalcone isomerase CHI)基因 | 第13页 |
| 1.2.3 苯丙氨酸解氨酶(phenylalanine ammonialyase PAL)基因 | 第13-14页 |
| 1.2.4 黄烷酮3-羟化酶(flavanone 3-hydroxylase F3H)基因 | 第14页 |
| 1.2.5 黄烷酮3'-羟化酶(flavanone 3'-hydroxylase F3'H)基因 | 第14页 |
| 1.2.6 类黄酮3',5'-羟化酶(flavonoid 3',5'-hydroxylase F3'5'H) | 第14页 |
| 1.2.7 花色苷合成酶(anthocyanin-synthases ANS)基因 | 第14页 |
| 1.2.8 二氢黄酮醇还原酶(dihydroflavonol 4-reductase DFR)基因 | 第14页 |
| 1.2.9 类黄酮一糖基转移酶(flavonoid 3-0-glucosyltransferase UFGT) | 第14-15页 |
| 1.2.10 花色合成相关调节基因及转录因子的研究进展 | 第15页 |
| 1.3 花色相关生理指标的研究进展 | 第15页 |
| 1.4 溪荪的研究进展 | 第15-17页 |
| 1.4.1 溪荪形态学方面的研究进展 | 第16页 |
| 1.4.2 溪荪在开花生物学及杂交育种方面的研究进展 | 第16页 |
| 1.4.3 溪荪在抗逆性方面的研究进展 | 第16-17页 |
| 1.4.4 溪荪繁殖技术方面的研究进展 | 第17页 |
| 1.5 本研究的目的意义 | 第17-18页 |
| 2 基于转录组学的两种花色溪荪差异表达基因分析 | 第18-44页 |
| 2.1 实验材料 | 第18页 |
| 2.1.1 取材地概况 | 第18页 |
| 2.1.2 实验材料 | 第18页 |
| 2.2 实验方法 | 第18-24页 |
| 2.2.1 溪荪总RNA的提取 | 第18-19页 |
| 2.2.2 RNA的琼脂糖凝胶电泳检测及浓度纯度检测 | 第19页 |
| 2.2.3 反转录 | 第19-20页 |
| 2.2.4 转录组测序 | 第20-21页 |
| 2.2.5 转录组测序产量统计及De novo组装 | 第21-22页 |
| 2.2.6 数据产出 | 第22-23页 |
| 2.2.7 两种花色溪荪显著差异基因的分析 | 第23页 |
| 2.2.8 实时定量PCR验证转录组结果 | 第23-24页 |
| 2.3 实验结果与分析 | 第24-43页 |
| 2.3.1 RNA质量检测 | 第24-25页 |
| 2.3.2 测序产量和组装质量统计 | 第25-27页 |
| 2.3.3 基因功能注释 | 第27-33页 |
| 2.3.4 两种花色溪荪差异显著基因分析 | 第33-41页 |
| 2.3.5 实时定量PCR验证转录组结果 | 第41-43页 |
| 2.4 本章小结 | 第43-44页 |
| 3 两种花色溪荪不同开花时期与花色相关各项生理指标的变化 | 第44-50页 |
| 3.1 实验材料 | 第44页 |
| 3.1.1 取材地概况 | 第44页 |
| 3.1.2 实验材料 | 第44页 |
| 3.2 实验方法 | 第44-45页 |
| 3.2.1 花色的测定 | 第44页 |
| 3.2.2 花色苷含量的测定 | 第44页 |
| 3.2.3 苯丙氨酸解氨酶(PAL)酶活性的测定 | 第44-45页 |
| 3.2.4 查儿酮异构酶(CHI)酶活性的测定 | 第45页 |
| 3.2.5 可溶性糖含量的测定 | 第45页 |
| 3.2.6 可溶性蛋白质含量的测定 | 第45页 |
| 3.2.7 数据处理 | 第45页 |
| 3.3 实验结果与分析 | 第45-49页 |
| 3.3.1 两种花色溪荪花色测定结果 | 第45页 |
| 3.3.2 两种花色溪荪不同开花时期花色苷含量的变化 | 第45-46页 |
| 3.3.3 两种花色溪荪不同开花时期苯丙氨酸解氨酶PAL活性的变化 | 第46-47页 |
| 3.3.4 两种花色溪荪不同开花时期查耳酮异构酶(CHI)活性的变化 | 第47页 |
| 3.3.5 两种花色溪荪不同开花时期可溶性蛋白质含量变化 | 第47-48页 |
| 3.3.6 两种花色溪荪不同开花时期可溶性糖含量变化 | 第48页 |
| 3.3.7 两种花色溪荪不同开花时期各项花色相关生理指标相关性分析 | 第48-49页 |
| 3.4 花色相关酶活性与转录组结果关联分析 | 第49页 |
| 3.5 本章小结 | 第49-50页 |
| 4 讨论 | 第50-54页 |
| 4.1 基于转录组学的溪荪种内花色遗传变异研究 | 第50-51页 |
| 4.2 两种花色溪荪花色相关生理指标研究 | 第51-52页 |
| 4.3 两种花色溪荪花色相关酶的活性与差异转录组研究的关联分析 | 第52-54页 |
| 5 结论与建议 | 第54-58页 |
| 5.1 结论 | 第54-56页 |
| 5.2 建议 | 第56-58页 |
| 参考文献 | 第58-65页 |
| 附录 | 第65-73页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第73-74页 |
| 致谢 | 第74-75页 |
