| 中文摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 1 概述 | 第11-16页 |
| 1.1 地下鼠及其生活环境概述 | 第11-12页 |
| 1.2 地下鼠视觉系统概述 | 第12-13页 |
| 1.3 棕色田鼠与布氏田鼠的研究进展 | 第13-15页 |
| 1.4 研究目的与意义 | 第15-16页 |
| 2 棕色田鼠与布氏田鼠视觉基因筛选与假基因化研究 | 第16-26页 |
| 2.1 引言 | 第16-17页 |
| 2.2 实验材料 | 第17-18页 |
| 2.2.1 研究对象 | 第17页 |
| 2.2.2 实验仪器及设备 | 第17页 |
| 2.2.3 实验试剂 | 第17页 |
| 2.2.4 实验耗材 | 第17-18页 |
| 2.3 研究方法 | 第18-19页 |
| 2.3.1 获取用于提取基因组DNA组织样本 | 第18页 |
| 2.3.2 试剂盒的方法提取基因组DNA | 第18页 |
| 2.3.3 DNA样品检验、文库构建及测序 | 第18页 |
| 2.3.4 基因组组装 | 第18页 |
| 2.3.5 基因组注释 | 第18-19页 |
| 2.4 数据分析 | 第19-20页 |
| 2.4.1 视觉基因数据的获取 | 第19页 |
| 2.4.2 视觉基因的序列处理 | 第19页 |
| 2.4.3 视觉基因突变外显子的扩增与测序 | 第19-20页 |
| 2.4.4 视觉基因假基因化的分析与处理 | 第20页 |
| 2.5 结果 | 第20-24页 |
| 2.5.1 视觉相关基因的功能分类 | 第20-21页 |
| 2.5.2 棕色田鼠与布氏田鼠中视觉突变基因统计 | 第21-22页 |
| 2.5.3 棕色田鼠与布氏田鼠视觉基因假基因情况研究 | 第22-24页 |
| 2.6 讨论 | 第24-26页 |
| 2.6.1 视觉相关基因的功能分类 | 第24页 |
| 2.6.2 棕色田鼠与布氏田鼠中视觉突变基因差异 | 第24-25页 |
| 2.6.3 棕色田鼠与布氏田鼠视觉基因假基因的研究 | 第25-26页 |
| 3 棕色田鼠与布氏田鼠视觉基因的适应性进化 | 第26-74页 |
| 3.1 前言 | 第26-27页 |
| 3.2 实验材料 | 第27-28页 |
| 3.2.1 研究对象 | 第27-28页 |
| 3.3 研究方法 | 第28-29页 |
| 3.3.1 系统发育关系分析 | 第28页 |
| 3.3.2 正选择压力分析 | 第28-29页 |
| 3.4 结果 | 第29-72页 |
| 3.4.1 眼发育基因 | 第29-36页 |
| 3.4.2 晶状体发育基因 | 第36-43页 |
| 3.4.3 视网膜发育基因 | 第43-49页 |
| 3.4.4 暗视觉基因 | 第49-61页 |
| 3.4.5 颜色视觉基因 | 第61-72页 |
| 3.5 讨论 | 第72-74页 |
| 3.5.1 眼结构发育相关视觉基因的适应性进化 | 第72页 |
| 3.5.2 感光视觉基因的适应性进化 | 第72-74页 |
| 4 全文总结 | 第74-76页 |
| 4.1 主要研究内容与结果 | 第74-75页 |
| 4.2 主要结论 | 第75页 |
| 4.3 创新点 | 第75-76页 |
| 5 文献综述 | 第76-80页 |
| 参考文献 | 第80-88页 |
| 附录 | 第88-93页 |
| 个人简历、在校期间发表的学术论文与研究成果 | 第93-94页 |
| 致谢 | 第94页 |