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基于二代测序的急性髓系白血病DNA甲基化及临床意义研究

英文缩略语表第6-8页
中文摘要第8-10页
ABSTRACT第10-11页
第一章 引言第12-31页
    第一节 概述第12-15页
    第二节 急性髓系白血病发生发展的DNA甲基化机制第15-21页
    第三节 DNA甲基化检测技术及其在AML中的应用第21-26页
    第四节 全基因组CpG位点甲基化捕获测序技术第26-30页
    第五节 选题依据及研究设计第30-31页
第二章 材料与方法第31-58页
    第一节 实验材料第31-37页
        2.1.1 研究对象第31-32页
        2.1.2 主要仪器第32-33页
        2.1.3 主要试剂第33-34页
        2.1.4 生物信息学分析工具第34-36页
        2.1.5 相关定义第36-37页
    第二节 实验方法第37-58页
        2.2.1 样本采集及临床资料收集第37页
        2.2.2 技术重复样本制备第37-38页
        2.2.3 浓度梯度样本制备第38-40页
        2.2.4 基因组DNA提取第40-41页
        2.2.5 全基因组CpG位点甲基化捕获测序第41-46页
        2.2.6 甲基化测序数据分析第46-56页
        2.2.7 统计学方法第56-58页
第三章 研究结果第58-95页
    第一节 患者及样本情况第58-66页
        3.1.1 MCC-Seq患者及样本信息第58页
        3.1.2 TCGA数据库患者信息第58-66页
    第二节 测序及质控结果第66-77页
        3.2.1 测序数据覆盖度结果第67-68页
        3.2.2 测序数据过滤结果第68页
        3.2.3 测序数据比对结果第68-73页
        3.2.4 技术重复样本结果第73-74页
        3.2.5 临床分析样本质控结果第74-77页
    第三节 AML患者DNA甲基化水平影响因素分析第77-79页
    第四节 不同基因区域DNA甲基化水平及其临床意义第79-84页
    第五节 差异甲基化基因筛选结果第84-87页
    第六节 差异甲基化基因临床意义验证结果第87-95页
第四章 讨论第95-100页
    一、DNA甲基化检测技术的选择第95-96页
    二、DNA甲基化水平不受临床因素影响第96-97页
    三、启动子区具有最重要的功能性差异甲基化区域第97页
    四、AML异质性大,整合遗传学和表观遗传学进行预后分层第97-98页
    五、问题与展望第98-100页
第五章 结论第100-101页
参考文献第101-110页
文献综述第110-130页
    References第122-130页
攻读学位期间发表论文情况第130-132页
致谢第132页

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