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三七病毒病病原种类鉴定及其相关病毒分子变异分析

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
1 引言第11-22页
    1.1 三七病毒病病原鉴定的研究概况第11-12页
    1.2 PnVY 的发现及其基因组结构第12-13页
    1.3 马铃薯 Y 病毒属病毒简介及部分基因功能第13-15页
    1.4 双生病毒的研究概况第15-17页
        1.4.1 双生病毒的分类、寄主范围及介体传播第15-17页
        1.4.2 双生病毒的危害第17页
    1.5 TYLCCNV 和 TYLCCNB 的研究概况第17-21页
        1.5.1 TYLCCNV 和 TYLCCNB 的生物学特性及其基因组结构第17-18页
        1.5.2 TYLCCNV 和 TYLCCNB 在中国的研究现状第18-20页
        1.5.3 TYLCCNV 在云南的发生分布及其遗传多样性第20-21页
    1.6 研究目的及意义第21-22页
2 材料与方法第22-43页
    2.1 材料第22页
        2.1.1 常用分子生物学试剂和仪器第22页
        2.1.2 常用缓冲液及培养基配方第22页
        2.1.3 菌种及载体第22页
    2.2 侵染三七的病毒种类鉴定第22-39页
        2.2.1 三七病叶 dsRNA 的提取第22-23页
        2.2.2 cDNA 文库构建第23-28页
        2.2.3 三七病叶的病毒提纯第28页
        2.2.4 提纯病毒的负染、SDS-PAGE 电泳及质谱分析第28-31页
        2.2.5 三七病样总核酸的提取第31页
        2.2.6 PnVY 寄主范围的测定第31-32页
        2.2.7 检测引物的序列第32-33页
        2.2.8 RT-PCR 及 PCR 检测第33-34页
        2.2.9 PCR 产物的纯化回收、克隆及序列拼接、确认及提交第34-37页
        2.2.10 TYLCCNV 及 TYLCCNB 对三七的侵染第37-39页
    2.3 三七病毒病田间调查及 PnVY、TYLCCNV 双重 PCR 检测方法建立第39-40页
        2.3.1 三七病毒病田间调查时间与地点第39-40页
        2.3.2 CTAB 法提取总核酸第40页
        2.3.3 双重 PCR 检测方法的建立第40页
        2.3.4 田间样品分子检测统计第40页
    2.4 侵染三七的 PnVY 及 TYLCCNV 不同分离物间全基因组分子变异第40-43页
        2.4.1 实验材料第40页
        2.4.2 CTAB 法提取总核酸第40页
        2.4.3 引物的设计与序列第40-41页
        2.4.4 RT-PCR 检测、纯化回收,克隆及序列拼接、确认及提交第41-42页
        2.4.5 不同 PnVY 分离物的基因组序列分析第42页
        2.4.6 不同 TYLCCNV 和 TYLCCNB 分离物的基因组序列分析第42-43页
3 结果与分析第43-78页
    3.1 侵染三七的病毒种类的鉴定第43-53页
        3.1.1 可能引起三七病毒病的其他病毒 RT-PCR 检测结果第43-44页
        3.1.2 TYLCCNV 及 TYLCCNB 对三七的侵染第44-49页
        3.1.3 dsRNA 电泳检测第49-50页
        3.1.4 cDNA 文库构建第50页
        3.1.5 电镜观察第50-51页
        3.1.6 SDS-PAGE 电泳及蛋白质质谱分析第51-52页
        3.1.7 SbDV 的 RT-PCR 检测第52-53页
    3.2 PnVY 寄主范围测试第53-55页
        3.2.1 三七病样 dsRNA 提取产物和提纯病毒的 RT-PCR 检测结果第53-54页
        3.2.2 供试寄主的症状类型及 RT-PCR 检测结果第54-55页
    3.3 三七病毒病田间调查及 PnVY 和 TYLCCNV 分子检测第55-60页
        3.3.1 田间三七病毒病症状类型第55页
        3.3.2 田间三七病毒病的发生特点第55-56页
        3.3.3 双重 RT-PCR 检测体系的初步建立第56-58页
        3.3.4 田间三七病样的 PnVY 和 TYLCCNV 分子检测统计第58-60页
    3.4 侵染三七的 PnVY 及 TYLCCNV 不同分离物的分子变异第60-78页
        3.4.1 不同 PnVY 分离物的基因组全序列分析第60-71页
        3.4.2 不同 TYLCCNV 分离物的基因组全序列比较分析第71-78页
4 讨论第78-83页
    4.1 三七病毒病可能的其他病原第78-80页
        4.1.1 dsRNA 分析技术第78-79页
        4.1.2 ToMV、CMV 及 SbDV 等三七上可能存在的病毒病原第79页
        4.1.3 TYLCCNV 和 TYLCCNB 对三七的致病性及危害第79-80页
        4.1.4 PnVY 寄主范围的测试第80页
    4.2 双重 RT-PCR 检测 PnVY 与 TYLCCNV 体系的建立第80页
    4.3 三七病毒病的田间调查及症状类型与病毒病原的相关性第80-82页
    4.4 不同 PnVY 分离物编 P1 的氨基酸变异第82-83页
5 结论第83-84页
参考文献第84-90页
附录第90-95页
致谢第95-96页
个人简介第96页
发表的文章及授权专利第96页

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