| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 1 文献综述 | 第10-19页 |
| 1.1 MHC 结构和功能 | 第10页 |
| 1.2 MHC 基因表达的调节 | 第10-11页 |
| 1.2.1 MHC 基因的选择作用 | 第11页 |
| 1.2.2 跨物种多态性 | 第11页 |
| 1.3 MHC 多态性的原因 | 第11-12页 |
| 1.4 为什么研究 MHC 基因 | 第12页 |
| 1.5 MHC 基因与保护遗传学 | 第12-13页 |
| 1.6 非模式动物 MHC 多态性研究方法 | 第13-19页 |
| 1.6.1 RFLP –基于 DNA 序列的非 PCR 分型方法 | 第14页 |
| 1.6.2 基于 PCR 的方法 | 第14-15页 |
| 1.6.3 基于已知变异的分型方法 | 第15页 |
| 1.6.4 基于构象的突变检测方法 | 第15-17页 |
| 1.6.5 涉及 DNA 测序的技术 | 第17页 |
| 1.6.6 各种方法的比较和基因分型的建议策略 | 第17-19页 |
| 2 材料和方法 | 第19-21页 |
| 2.1 实验材料 | 第19页 |
| 2.2 主要实验试剂 | 第19-20页 |
| 2.3 试验流程 | 第20-21页 |
| 3 实验结果与分析 | 第21-44页 |
| 3.1 DRB1 启动子多态性分析 | 第21页 |
| 3.2 DQA1 启动子多态性分析 | 第21页 |
| 3.3 DQB1 启动子多态性分析 | 第21-24页 |
| 3.4 DQA1 等位基因多态性分析 | 第24-30页 |
| 3.4.1 DQA1 等位基因的频率和分布 | 第24页 |
| 3.4.2 碱基组成 | 第24页 |
| 3.4.3 多态位点变异及多样性分析 | 第24-25页 |
| 3.4.4 氨基酸变异分析 | 第25-26页 |
| 3.4.5 DLA-DQA1 基因外显子 2 密码子使用率的偏倚性 | 第26-27页 |
| 3.4.6 同义替换和非同义替换 | 第27-28页 |
| 3.4.7 种群遗传距离计算 | 第28-29页 |
| 3.4.8 DQA1 等位基因的系统发生分析 | 第29-30页 |
| 3.5 DRB1 等位基因多态性分析 | 第30-37页 |
| 3.5.1 DRB1 等位基因分布及频率 | 第30页 |
| 3.5.2 碱基组成 | 第30页 |
| 3.5.3 多态位点变异及多样性分析 | 第30-31页 |
| 3.5.4 氨基酸变异分析 | 第31-33页 |
| 3.5.5 DRB1 基因外显子 2 密码子使用的偏倚性 | 第33页 |
| 3.5.6 同义替换和非同义替换 | 第33-35页 |
| 3.5.7 种群遗传距离计算 | 第35-36页 |
| 3.5.8 DRB1 等位基因的系统发生分析 | 第36-37页 |
| 3.6 DQB1 等位基因分析 | 第37-44页 |
| 3.6.1 DQB1 等位基因频率和分布 | 第37页 |
| 3.6.2 碱基组成 | 第37页 |
| 3.6.3 多态位点变异及多样性分析 | 第37-39页 |
| 3.6.4 氨基酸变异分析 | 第39页 |
| 3.6.5 DQB1 基因外显子 2 密码子使用率的偏倚性 | 第39-41页 |
| 3.6.6 同义替换和非同义替换 | 第41页 |
| 3.6.7 种群遗传距离计算 | 第41-42页 |
| 3.6.8 DQB1 等位基因的系统发生分析 | 第42-44页 |
| 4 分析与讨论 | 第44-48页 |
| 4.1 MHC 启动子变异 | 第44页 |
| 4.2 MHC 等位基因多态性水平 | 第44-45页 |
| 4.3 MHC 基因碱基组成和密码子使用频率 | 第45-46页 |
| 4.4 MHC 基因的正选择和平衡选择 | 第46-47页 |
| 4.5 MHC 基因的跨物种多态性和平衡选择 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-62页 |
| 致谢 | 第62页 |
