| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstact | 第8-9页 |
| 第一章 前言 | 第10-34页 |
| 1.1 系统地理学概述 | 第10-17页 |
| 1.1.1 系统地理学的产生和发展 | 第10-11页 |
| 1.1.2 分子系统地理学 | 第11-13页 |
| 1.1.3 啮齿动物分子系统地理学 | 第13-17页 |
| 1.2 线粒体基因与核基因在分子系统地理学上的应用 | 第17-20页 |
| 1.2.1 线粒体基因组的特征 | 第17-18页 |
| 1.2.2 核基因的局限性 | 第18-19页 |
| 1.2.3 线粒体与核基因的比较 | 第19-20页 |
| 1.3 冰川气候及对生物系统地理结构的影响 | 第20-23页 |
| 1.3.1 冰川气候对生物系统地理结构的影响 | 第20-22页 |
| 1.3.2 中国第四纪冰川气候 | 第22-23页 |
| 1.4 物种及隐藏种 | 第23-30页 |
| 1.4.1 物种及其概念 | 第23-26页 |
| 1.4.2 隐存种与隐存种复合体 | 第26-30页 |
| 1.5 小泡巨鼠简介 | 第30-33页 |
| 1.5.1 小泡巨鼠形态特征 | 第30页 |
| 1.5.2 小泡巨鼠生态特征 | 第30-31页 |
| 1.5.3 小泡巨鼠的分类现状 | 第31-33页 |
| 1.6 本研究的目的和意义 | 第33-34页 |
| 第二章 材料与方法 | 第34-44页 |
| 2.1 实验材料 | 第34-36页 |
| 2.1.1 样本采集 | 第34-35页 |
| 2.1.2 实验仪器与试剂 | 第35页 |
| 2.1.3 溶液配制 | 第35-36页 |
| 2.2 DNA分子数据的获得 | 第36-40页 |
| 2.2.1 DNA提取与检测 | 第36-37页 |
| 2.2.2 PCR扩增及产物胶回收纯化 | 第37-39页 |
| 2.2.3 克隆 | 第39-40页 |
| 2.2.4 测序 | 第40页 |
| 2.3 数据处理方法 | 第40-44页 |
| 2.3.1 序列特征和遗传多样性分析 | 第40-41页 |
| 2.3.2 系统发育关系分析 | 第41-42页 |
| 2.3.3 遗传距离 | 第42页 |
| 2.3.4 分歧时间估算 | 第42页 |
| 2.3.5 贝叶斯物种界定 | 第42页 |
| 2.3.6 种群遗传变异分析 | 第42-43页 |
| 2.3.7 种群历史动态分析 | 第43-44页 |
| 第三章 结果 | 第44-58页 |
| 3.1 序列特征分析 | 第44-45页 |
| 3.2 系统地理结构 | 第45-49页 |
| 3.2.1 系统发育树 | 第45-47页 |
| 3.2.2 系统发育关系网络图 | 第47-49页 |
| 3.3 遗传多样性与分化 | 第49-54页 |
| 3.3.1 遗传多样性 | 第49-50页 |
| 3.3.2 遗传距离 | 第50-53页 |
| 3.3.3 遗传分化 | 第53-54页 |
| 3.4 种群历史动态 | 第54-55页 |
| 3.5 分歧时间和贝叶斯物种界定 | 第55-58页 |
| 第四章 讨论 | 第58-67页 |
| 4.1 地理隔离与小泡巨鼠复合体遗传结构的关系 | 第58-60页 |
| 4.2 小泡巨鼠复合体的遗传多样性与遗传分化的特点及其成因 | 第60-63页 |
| 4.3 第四纪冰期气候对小泡巨鼠复合体种群动态的影响 | 第63-64页 |
| 4.4 小泡巨鼠复合体的物种隐存多样性 | 第64-66页 |
| 4.5 总结 | 第66-67页 |
| 附录 | 第67-69页 |
| 致谢 | 第69-71页 |
| 参考文献 | 第71-82页 |
| 附件 | 第82页 |
