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基于锚点的多基因组序列比对算法

摘要第1-4页
Abstract第4-7页
第一章 绪论第7-13页
   ·引言第7-8页
   ·基因组序列比对的背景及现状第8-12页
     ·基因组序列比对的生物学背景第8-10页
     ·基因组序列比对现状第10-12页
   ·本文的工作第12-13页
第二章 基因组序列比对研究现状第13-19页
   ·基因组双序列比对算法第13-15页
   ·多基因组序列比对算法第15-17页
   ·本章小结第17-19页
第三章 基于锚点的多基因组序列比对策略第19-33页
   ·锚点定位算法第19-23页
   ·计算锚点的线性不交叉序列第23-29页
     ·构造锚点关系图第24-26页
     ·计算锚点关系图的最大独立集第26-29页
   ·比对锚点之间片段第29-32页
   ·本章小结第32-33页
第四章 多基因组序列比对算法设计第33-45页
   ·计算基因组的MUM集合第33-38页
     ·构造拼接序列的后缀数组第33-35页
     ·计算LCP,PS,SO集合第35-37页
     ·计算MUM区间第37-38页
   ·构造MUM图第38-39页
   ·计算LIS-MUMs第39-43页
   ·多基因组序列比对算法的整体结构第43页
   ·本章小结第43-45页
第五章 实验结果和性能分析第45-51页
   ·参数设置第45页
   ·实验结果第45-48页
   ·性能分析第48-50页
   ·本章小结第50-51页
第六章 结束语第51-53页
致谢第53-55页
参考文献第55-57页

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