基于锚点的多基因组序列比对算法
| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-7页 |
| 第一章 绪论 | 第7-13页 |
| ·引言 | 第7-8页 |
| ·基因组序列比对的背景及现状 | 第8-12页 |
| ·基因组序列比对的生物学背景 | 第8-10页 |
| ·基因组序列比对现状 | 第10-12页 |
| ·本文的工作 | 第12-13页 |
| 第二章 基因组序列比对研究现状 | 第13-19页 |
| ·基因组双序列比对算法 | 第13-15页 |
| ·多基因组序列比对算法 | 第15-17页 |
| ·本章小结 | 第17-19页 |
| 第三章 基于锚点的多基因组序列比对策略 | 第19-33页 |
| ·锚点定位算法 | 第19-23页 |
| ·计算锚点的线性不交叉序列 | 第23-29页 |
| ·构造锚点关系图 | 第24-26页 |
| ·计算锚点关系图的最大独立集 | 第26-29页 |
| ·比对锚点之间片段 | 第29-32页 |
| ·本章小结 | 第32-33页 |
| 第四章 多基因组序列比对算法设计 | 第33-45页 |
| ·计算基因组的MUM集合 | 第33-38页 |
| ·构造拼接序列的后缀数组 | 第33-35页 |
| ·计算LCP,PS,SO集合 | 第35-37页 |
| ·计算MUM区间 | 第37-38页 |
| ·构造MUM图 | 第38-39页 |
| ·计算LIS-MUMs | 第39-43页 |
| ·多基因组序列比对算法的整体结构 | 第43页 |
| ·本章小结 | 第43-45页 |
| 第五章 实验结果和性能分析 | 第45-51页 |
| ·参数设置 | 第45页 |
| ·实验结果 | 第45-48页 |
| ·性能分析 | 第48-50页 |
| ·本章小结 | 第50-51页 |
| 第六章 结束语 | 第51-53页 |
| 致谢 | 第53-55页 |
| 参考文献 | 第55-57页 |