| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 前言 | 第11-25页 |
| 1.1 ~(13)C代谢通量分析(~(13)C-MFA) | 第11-18页 |
| 1.1.1 ~(13)C代谢通量分析原理 | 第11-12页 |
| 1.1.2 ~(13)C标记实验方法 | 第12-14页 |
| 1.1.3 通量模拟算法 | 第14-18页 |
| 1.2 代谢通量分析在链霉菌(Streptomyces)中的应用 | 第18-19页 |
| 1.2.1 链霉菌~(13)C代谢通量分析 | 第18-19页 |
| 1.2.2 基于基因组尺度代谢模型的链霉菌代谢通量分析 | 第19页 |
| 1.3 链霉菌中心碳代谢的研究进展 | 第19-23页 |
| 1.3.1 糖酵解途径 | 第21页 |
| 1.3.2 戊糖磷酸途径 | 第21-22页 |
| 1.3.3 TCA循环 | 第22页 |
| 1.3.4 糖异生途径和回补途径 | 第22-23页 |
| 1.3.5 ED途径 | 第23页 |
| 1.4 龟裂链霉菌(S.rimosus)合成培养基 | 第23-24页 |
| 1.5 课题研究目的、意义和研究内容 | 第24-25页 |
| 第二章 实验材料与方法 | 第25-34页 |
| 2.1 实验材料 | 第25-26页 |
| 2.1.1 菌种 | 第25页 |
| 2.1.2 主要仪器 | 第25页 |
| 2.1.3 主要试剂 | 第25-26页 |
| 2.2 培养基配方 | 第26页 |
| 2.3 培养方法 | 第26-27页 |
| 2.3.1 甘油保种和活化 | 第26页 |
| 2.3.2 孢子悬浮液制备 | 第26页 |
| 2.3.3 合成培养基发酵 | 第26页 |
| 2.3.4 天然发酵培养基发酵 | 第26-27页 |
| 2.3.5 微型传感反应器培养 | 第27页 |
| 2.4 分析方法 | 第27-34页 |
| 2.4.1 细胞干重的测定 | 第27页 |
| 2.4.2 葡萄糖含量的测定 | 第27页 |
| 2.4.3 土霉素浓度的测定 | 第27-28页 |
| 2.4.4 有机酸含量的测定 | 第28页 |
| 2.4.5 氨基酸含量的测定 | 第28-29页 |
| 2.4.6 菌体元素组成分析 | 第29页 |
| 2.4.7 发酵过程生理参数计算 | 第29-30页 |
| 2.4.8 菌体蛋白氨基酸标记信息的测定 | 第30-31页 |
| 2.4.9 氨基酸特征片段质量同位素分布矢量MDV的计算 | 第31-33页 |
| 2.4.10 代谢物片段的同位素标记丰度SFL和CNL值的计算方法 | 第33-34页 |
| 第三章 适合龟裂链霉菌~(13)C-MFA的合成培养基筛选和优化 | 第34-44页 |
| 3.1 无机氮源的筛选 | 第34-35页 |
| 3.2 无机氮源的进一步确定 | 第35-37页 |
| 3.3 利用响应面方法优化无机氮源合成培养基 | 第37-43页 |
| 3.3.1 Plackett-Burman设计及试验因素考察 | 第37-39页 |
| 3.3.2 最陡爬坡实验 | 第39页 |
| 3.3.3 中心组合试验设计进一步优化 | 第39-43页 |
| 3.3.4 验证性实验 | 第43页 |
| 3.4 本章小结 | 第43-44页 |
| 第四章 龟裂链霉菌~(13)C代谢通量分析技术的建立 | 第44-59页 |
| 4.1 龟裂链霉菌代谢网络模型的构建 | 第44-49页 |
| 4.1.1 龟裂链霉菌的糖酵解途径 | 第44-45页 |
| 4.1.2 龟裂链霉菌的戊糖磷酸途径 | 第45页 |
| 4.1.3 龟裂链霉菌的TCA循环途径 | 第45-46页 |
| 4.1.4 龟裂链霉菌的回补途径和乙醛酸循环 | 第46页 |
| 4.1.5 龟裂链霉菌生物量合成前体的组成 | 第46-49页 |
| 4.2 龟裂链霉菌~(13)C代谢通量分析方法的建立 | 第49-55页 |
| 4.2.1 龟裂链霉菌~(13)C标记实验方法的优化 | 第49-52页 |
| 4.2.2 氨基酸有效片段的选择 | 第52-53页 |
| 4.2.3 中心碳代谢途径中代谢物标记信息的计算 | 第53-55页 |
| 4.3 龟裂链霉菌M4018代谢网络模型的分析和修正 | 第55-58页 |
| 4.3.1 龟裂链霉菌M4018代谢网络部分途径的修正 | 第55-56页 |
| 4.3.2 龟裂链霉菌ED途径的分析 | 第56-57页 |
| 4.3.3 龟裂链霉菌的代谢网络模型 | 第57-58页 |
| 4.4 本章小结 | 第58-59页 |
| 第五章 龟裂链霉菌初级代谢和次级代谢关系的初步研究 | 第59-71页 |
| 5.1 zwf1基因增强与阻断对龟裂链霉菌形态及中心碳代谢的影响 | 第59-65页 |
| 5.1.1 zwf1~+、Δzwf1和M4018在菌落形态上的变化 | 第59-60页 |
| 5.1.2 zwf1~+、Δzwf1和M4018在天然培养基上生理参数的对比 | 第60页 |
| 5.1.3 zwfl~+、Δzwf1和M4018在S-4培养基上生理参数的对比 | 第60-61页 |
| 5.1.4 zwf1系列突变株的~(13)C-代谢通量分析 | 第61-65页 |
| 5.2 oxyABC基因对龟裂链霉菌形态及中心碳代谢的影响 | 第65-69页 |
| 5.2.1 MR69和M4018在S-4培养基上生理参数的对比 | 第65-66页 |
| 5.2.2 oxyABC突变株的~(13)C-代谢通量分析 | 第66-69页 |
| 5.3 龟裂链霉菌代谢通量分布计算结果 | 第69-70页 |
| 5.4 本章小结 | 第70-71页 |
| 第六章 结论与展望 | 第71-73页 |
| 6.1 结论 | 第71页 |
| 6.2 展望 | 第71-73页 |
| 参考文献 | 第73-78页 |
| 致谢 | 第78-79页 |
| 攻读硕士期间发表的论文及专利 | 第79-80页 |
| 附录 | 第80-84页 |
