| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 目录 | 第8-10页 |
| 插图索引 | 第10-11页 |
| 附表索引 | 第11-12页 |
| 第1章 绪论 | 第12-17页 |
| 1.1 研究背景和意义 | 第12-13页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第13-15页 |
| 1.3 本文的主要研究内容 | 第15-16页 |
| 1.4 本文的结构安排 | 第16-17页 |
| 第2章 关键蛋白质识别的相关研究 | 第17-25页 |
| 2.1 引言 | 第17页 |
| 2.2 基于序列信息的关键蛋白质识别 | 第17-18页 |
| 2.3 基于 PPI 网络拓扑的关键蛋白质识别 | 第18-22页 |
| 2.3.1 PPI 网络的图表示 | 第18-19页 |
| 2.3.2 基于节点拓扑中心性测度的方法 | 第19-21页 |
| 2.3.3 基于网络模块或边的方法 | 第21-22页 |
| 2.4 基于多特征融合的关键蛋白质识别 | 第22-23页 |
| 2.5 小结 | 第23-25页 |
| 第3章 基于基因本体加权 PPI 网络识别关键蛋白质 | 第25-38页 |
| 3.1 引言 | 第25-26页 |
| 3.2 基于基因本体构建 PPI 加权网络 | 第26-29页 |
| 3.2.1 基因本体介绍 | 第26-27页 |
| 3.2.2 计算 GO 语义相似性 | 第27-28页 |
| 3.2.3 基于 GO 语义相似性构建 PPI 加权网络 | 第28-29页 |
| 3.3 关键蛋白质识别算法—GO_ELAC | 第29-31页 |
| 3.4 数据集 | 第31-32页 |
| 3.4.1 基因本体数据集 | 第31页 |
| 3.4.2 关键蛋白质数据集 | 第31-32页 |
| 3.4.3 PPI 数据集 | 第32页 |
| 3.5 实验结果及分析 | 第32-37页 |
| 3.5.1 不同比例关键蛋白质预测准确率比较 | 第32-33页 |
| 3.5.2 统计指标分析 | 第33-35页 |
| 3.5.3 Jackknife 方法验证 | 第35-36页 |
| 3.5.4 识别关键蛋白质差异性分析 | 第36-37页 |
| 3.6 小结 | 第37-38页 |
| 第4章 基于双权重 PPI 网络识别关键蛋白质 | 第38-51页 |
| 4.1 引言 | 第38-39页 |
| 4.2 基因表达数据介绍 | 第39-40页 |
| 4.3 基于基因表达数据的 PPI 相似性度量 | 第40页 |
| 4.4 关键蛋白质识别算法—PeGO | 第40-42页 |
| 4.5 实验数据 | 第42-43页 |
| 4.6 实验结果及分析 | 第43-50页 |
| 4.6.1 不同比例关键蛋白质预测准确率比较 | 第43-45页 |
| 4.6.2 统计指标分析 | 第45-46页 |
| 4.6.3 Jackknife 方法验证 | 第46-49页 |
| 4.6.4 识别关键蛋白质差异性分析 | 第49-50页 |
| 4.7 小结 | 第50-51页 |
| 结论 | 第51-54页 |
| 参考文献 | 第54-61页 |
| 附录A 攻读硕士学位期间所发表的学术论文 | 第61-62页 |
| 附录B 攻读硕士学位期间参与的科研项目 | 第62-63页 |
| 致谢 | 第63页 |