| 致谢 | 第5-7页 |
| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 目录 | 第11-16页 |
| 第一章 文献综述 | 第16-32页 |
| 1.1 水稻黑条矮缩病毒 | 第17-19页 |
| 1.1.1 生物学特征 | 第17-18页 |
| 1.1.2 分子生物学特征 | 第18-19页 |
| 1.2 南方水稻黑条矮缩病毒 | 第19-22页 |
| 1.2.1 症状 | 第19页 |
| 1.2.2 传播特性及其寄主范围 | 第19页 |
| 1.2.3 分类地位 | 第19-20页 |
| 1.2.4 基因组结构和功能 | 第20-21页 |
| 1.2.5 发生特点及流行原因分析 | 第21-22页 |
| 1.3 水稻锯齿叶矮缩病毒 | 第22-25页 |
| 1.3.1 生物学特征 | 第22-24页 |
| 1.3.2 分子生物学特征 | 第24-25页 |
| 1.4 水稻病毒的检测方法及其比较 | 第25-28页 |
| 1.4.1 生物学检测法 | 第25-26页 |
| 1.4.2 电镜观察 | 第26页 |
| 1.4.3 血清学检测方法 | 第26页 |
| 1.4.4 分子生物学检测方法 | 第26-28页 |
| 1.5 水稻病害的防治对策分析 | 第28-29页 |
| 1.6 水稻RNA病毒的分子变异 | 第29-30页 |
| 1.7 研究的意义 | 第30-32页 |
| 第二章 三种水稻病毒的地理分布及发生流行调查 | 第32-48页 |
| 2.1 材料与方法 | 第32-36页 |
| 2.1.1 水稻病害的田间调查和样品采集 | 第32-34页 |
| 2.1.2 试剂 | 第34页 |
| 2.1.3 引物的设计 | 第34页 |
| 2.1.4 RT-PCR方法检测水稻植株中的病毒 | 第34-36页 |
| 2.1.5 dot-ELISA检测方法 | 第36页 |
| 2.2 结果与分析 | 第36-46页 |
| 2.2.1 三种水稻病毒的病害症状特点 | 第36-37页 |
| 2.2.2 RT-PCR和dot-ELISA两种方法检测水稻样品中的SRBSDV | 第37-39页 |
| 2.2.3 dot-ELISA检测白背飞虱体内的SRBSDV | 第39-40页 |
| 2.2.4 2011年RBSDV、SRBSDV、RRSV三种水稻病毒病的发生情况调查 | 第40-42页 |
| 2.2.5 2012年RBSDV、SRBSDV、RRSV三种水稻病毒病的发生情况调查 | 第42-45页 |
| 2.2.6 2011-2012年三种水稻病毒病发生情况比较 | 第45-46页 |
| 2.3 讨论 | 第46-48页 |
| 第三章 三种水稻病毒的CP基因变异研究 | 第48-79页 |
| 3.1 材料与方法 | 第48-56页 |
| 3.1.1 水稻病毒样品 | 第48-50页 |
| 3.1.2 菌株和载体 | 第50页 |
| 3.1.3 生化试剂 | 第50页 |
| 3.1.4 病毒CP基因的克隆与载体构建 | 第50-56页 |
| 3.1.4.1 病毒CP基因的引物设计 | 第50-51页 |
| 3.1.4.2 反转录聚合酶链式反应(RT-PCR) | 第51-52页 |
| 3.1.4.3 目的片段的回收与纯化 | 第52-53页 |
| 3.1.4.4 目的DNA的连接 | 第53页 |
| 3.1.4.5 大肠杆菌DH5α感受态细胞的制备 | 第53-54页 |
| 3.1.4.6 连接产物转化大肠杆菌DH5α | 第54页 |
| 3.1.4.7 菌落PCR | 第54-55页 |
| 3.1.4.8 质粒DNA的提取 | 第55页 |
| 3.1.4.9 重组质粒酶切鉴定 | 第55-56页 |
| 3.1.4.10 序列测定与分析 | 第56页 |
| 3.2 结果与分析 | 第56-77页 |
| 3.2.1 水稻黑条矮缩病毒CP基因变异分析 | 第56-65页 |
| 3.2.1.1 CP基因RT-PCR克隆 | 第56-57页 |
| 3.2.1.2 CP基因重组克隆载体的构建 | 第57-58页 |
| 3.2.1.3 CP基因的测序结果与分析 | 第58-59页 |
| 3.2.1.4 CP基因核苷酸变异特点 | 第59-60页 |
| 3.2.1.5 CP基因核苷酸序列比较分析 | 第60-62页 |
| 3.2.1.6 CP基因系统进化分析 | 第62-65页 |
| 3.2.2 南方水稻黑条矮缩病毒CP基因变异分析 | 第65-73页 |
| 3.2.2.1 CP基因克隆 | 第65-66页 |
| 3.2.2.2 CP基因的重组克隆载体构建 | 第66页 |
| 3.2.2.3 CP基因的测序结果与分析 | 第66-67页 |
| 3.2.2.4 CP基因核苷酸变异特点 | 第67-68页 |
| 3.2.2.5 CP基因核苷酸序列比较分析 | 第68-70页 |
| 3.2.2.6 CP基因全长系统进化分析 | 第70-73页 |
| 3.2.3 水稻锯齿叶矮缩病毒CP基因变异分析 | 第73-77页 |
| 3.2.3.1 CP基因RT-PCR克隆 | 第73页 |
| 3.2.3.2 CP基因的重组克隆载体的构建 | 第73-74页 |
| 3.2.3.3 CP基因的测序结果与分析 | 第74-75页 |
| 3.2.3.4 CP基因核苷酸变异特点 | 第75-76页 |
| 3.2.3.5 CP基因核苷酸序列同源性分析 | 第76页 |
| 3.2.3.6 CP基因全长系统进化分析 | 第76-77页 |
| 3.3 讨论 | 第77-79页 |
| 参考文献 | 第79-88页 |
| 附录A 常用缓冲液和培养基配方 | 第88-90页 |
| 附录B 常用生化及分子生物学试剂与仪器 | 第90页 |
