| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-13页 |
| 缩略语表 | 第14-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-37页 |
| 1.1 基因组水平物种生殖隔离研究进展 | 第15-22页 |
| 1.1.1 基因组水平的生殖隔离机制 | 第15-19页 |
| 1.1.1.1 生殖隔离的类型 | 第15-16页 |
| 1.1.1.2 基因组水平的生殖隔离类型 | 第16-18页 |
| 1.1.1.3 物种形成中生殖隔离的进化 | 第18-19页 |
| 1.1.2 基于偏分离的生殖隔离位点检测 | 第19-22页 |
| 1.2 棉花的起源、分化及种间杂交 | 第22-36页 |
| 1.2.1 棉属植物起源与分化 | 第26-27页 |
| 1.2.2 棉属二倍体种的分布、分类及多样性 | 第27-30页 |
| 1.2.3 异源四倍体棉种的起源、进化及驯化 | 第30-36页 |
| 1.2.3.1 异源四倍体棉种的起源、进化 | 第30-32页 |
| 1.2.3.2 异源四倍体棉花驯化 | 第32-35页 |
| 1.2.3.3 异源四倍体棉种间的基因交流 | 第35-36页 |
| 1.3 本研究的目的和意义 | 第36-37页 |
| 第二章 棉花偏分离染色体的遗传机理分析 | 第37-83页 |
| 2.1 前言 | 第37-38页 |
| 2.2 材料和方法 | 第38-41页 |
| 2.2.1 实验材料和群体构建 | 第38页 |
| 2.2.2 基因组DNA的提取 | 第38-40页 |
| 2.2.3 引物的挑选、PCR扩增及基因型分析 | 第40页 |
| 2.2.4 标记的偏分离检测 | 第40页 |
| 2.2.5 基因组偏分离位点 (SDL) 检测 | 第40页 |
| 2.2.6 SDL区域的基因鉴定和富集分析 | 第40-41页 |
| 2.3 结果与分析 | 第41-80页 |
| 2.3.1 棉花偏分离染色体2号染色体上偏分离模式分析 | 第41-53页 |
| 2.3.1.1 基于回交群体分析配子选择对2号染色体偏分离的影响 | 第41-45页 |
| 2.3.1.2 基于正反交F_2群体分析合子选择对2号染色体偏分离的影响 | 第45-48页 |
| 2.3.1.3 群体比较分析配子选择和合子选择对2号染色体偏分离的影响 | 第48-49页 |
| 2.3.1.4 棉花2号染色体上偏分离位点检测 | 第49-52页 |
| 2.3.1.5 棉花2号染色体SDL区域的基因鉴定和功能注释 | 第52-53页 |
| 2.3.2 棉花偏分离染色体16号染色体上偏分离模式分析 | 第53-68页 |
| 2.3.2.1 基于回交群体分析配子选择对16号染色体偏分离的影响 | 第53-58页 |
| 2.3.2.2 基于正反交F_2群体分析合子选择对16号染色体偏分离的影响 | 第58-63页 |
| 2.3.2.3 群体比较分析配子选择和合子选择对16号染色体偏分离的影响 | 第63页 |
| 2.3.2.4 16号染色体上偏分离位点检测 | 第63-67页 |
| 2.3.2.5 棉花16号染色体SDL区域的基因鉴定和功能注释 | 第67-68页 |
| 2.3.3 棉花偏分离染色体18号染色体上偏分离模式分析 | 第68-80页 |
| 2.3.3.1 基于回交群体分析配子选择对18号染色体偏分离的影响 | 第68-72页 |
| 2.3.3.2 基于正反交F_2群体分析合子选择对18号染色体偏分离的影响 | 第72-75页 |
| 2.3.3.3 群体比较分析配子选择和合子选择对18号染色体偏分离的影响 | 第75-76页 |
| 2.3.3.4 棉花18号染色体上偏分离位点检测 | 第76-79页 |
| 2.3.3.5 棉花18号染色体SDL区域的基因鉴定和功能注释 | 第79-80页 |
| 2.4 讨论 | 第80-83页 |
| 2.4.1 海陆种间杂交偏分离的普遍性与特殊性 | 第80-81页 |
| 2.4.2 配子选择和合子选择与偏分离 | 第81-82页 |
| 2.4.3 SDL区域基因鉴定及富集分析 | 第82-83页 |
| 第三章 棉花偏分离染色体上陆海杂种重要农艺性状QTL定位 | 第83-108页 |
| 3.1 前言 | 第83-84页 |
| 3.2 材料和方法 | 第84-85页 |
| 3.2.1 实验材料和田间种植 | 第84页 |
| 3.2.2 农艺性状调查 | 第84页 |
| 3.2.3 数据分析 | 第84-85页 |
| 3.3 结果与分析 | 第85-105页 |
| 3.3.1 亲本及BC_1F_2群体的产量性状和早熟性状的表现 | 第85-96页 |
| 3.3.2 棉花早熟性、产量和纤维品质性状的相关分析 | 第96-97页 |
| 3.3.3 棉花早熟性、产量和纤维品质性状的QTL定位 | 第97-105页 |
| 3.3.3.1 纤维品质性状的QTL定位 | 第97-102页 |
| 3.3.3.2 产量性状的QTL定位 | 第102页 |
| 3.3.3.3 早熟性状的QTL定位 | 第102-105页 |
| 3.4 讨论 | 第105-108页 |
| 3.4.1 作图群体选择 | 第105-106页 |
| 3.4.2 群体间QTL比较分析 | 第106-108页 |
| 第四章 棉花海陆种间杂种衰败与基因组杂合度的关系研究 | 第108-122页 |
| 4.1 前言 | 第108-109页 |
| 4.2 材料与方法 | 第109-111页 |
| 4.2.1 植物材料 | 第109-110页 |
| 4.2.2 针对种间杂种衰败的营养性状和繁殖性状调查 | 第110页 |
| 4.2.3 群体的基因型分析 | 第110页 |
| 4.2.4 连锁不平衡分析 | 第110-111页 |
| 4.2.5 基因组杂合度的计算 | 第111页 |
| 4.2.6 基因杂合度对杂种个体的表型效应分析 | 第111页 |
| 4.3 结果与分析 | 第111-119页 |
| 4.3.1 种间F_2群体的杂种衰败 | 第111-114页 |
| 4.3.2 标记间独立性的连锁不平衡检验 | 第114-115页 |
| 4.3.3 种间群体的个体基因组杂合度分布 | 第115-116页 |
| 4.3.4 基因组杂合度与杂种衰败的关系分析 | 第116-119页 |
| 4.4 讨论 | 第119-122页 |
| 4.4.1 基因组杂合度计算方法的优化 | 第119-120页 |
| 4.4.2 棉花种间杂种衰败的遗传机理 | 第120页 |
| 4.4.3 基因组杂合度与杂种衰败的关系 | 第120-122页 |
| 参考文献 | 第122-142页 |
| 附录 1 SDL检测的SAS代码 | 第142-143页 |
| 附录 2 SDL区域临近区域基因的位置及其功能注释 | 第143-145页 |
| 附录3 海陆种间F_2群体基因组杂合度计算所用SSR标记 | 第145-146页 |
| 附录4 评估基因组杂合度 (MHI) 计算程序 | 第146-147页 |
| 作者简介 | 第147-148页 |
| 致谢 | 第148-149页 |
