| 致谢 | 第6-7页 |
| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-40页 |
| 1.1 内生真菌 | 第13-20页 |
| 1.1.1 真菌的生存策略 | 第13页 |
| 1.1.2 植物与真菌的共生体系 | 第13-14页 |
| 1.1.3 植物内生真菌的概念 | 第14页 |
| 1.1.4 植物内生真菌的分类 | 第14-16页 |
| 1.1.5 内生真菌的生物学功能 | 第16-17页 |
| 1.1.6 暗色有隔内生真菌 | 第17-19页 |
| 1.1.7 暗色有隔内生真菌Harpophora oryzae | 第19-20页 |
| 1.2 细胞自噬 | 第20-38页 |
| 1.2.1 细胞自噬概况 | 第20页 |
| 1.2.2 细胞自噬发现的历史 | 第20-21页 |
| 1.2.3 细胞自噬的类型 | 第21-23页 |
| 1.2.4 宏自噬的过程与特征 | 第23-24页 |
| 1.2.5 自噬体的形成 | 第24-25页 |
| 1.2.6 自噬体形成的分子机制 | 第25-34页 |
| 1.2.7 膜泡与液泡融合 | 第34页 |
| 1.2.8 细胞自噬的调控 | 第34-36页 |
| 1.2.9 细胞自噬的研究现状 | 第36-38页 |
| 1.3 本研究的目的及内容 | 第38-40页 |
| 第二章 丝状真菌中自噬相关基因的生物信息学分析 | 第40-67页 |
| 2.1 材料与方法 | 第40-41页 |
| 2.1.1 同源基因的比对 | 第40页 |
| 2.1.2 进化分析 | 第40-41页 |
| 2.2 结果与分析 | 第41-65页 |
| 2.2.1 15种真菌中自噬相关基因同源比对结果 | 第41-49页 |
| 2.2.2 H.oryzae中的自噬相关基因 | 第49-51页 |
| 2.2.3 17种真菌进化关系 | 第51-53页 |
| 2.2.4 17种真菌中自噬相关基因的进化关系分析 | 第53-65页 |
| 2.3 本章讨论 | 第65-67页 |
| 第三章 基因敲除体系的构建 | 第67-89页 |
| 3.1 材料与方法 | 第67-77页 |
| 3.1.1 实验菌株及培养条件 | 第67-69页 |
| 3.1.2 聚合酶链式反应(PCR) | 第69页 |
| 3.1.3 质粒提取 | 第69-70页 |
| 3.1.4 DNA操作 | 第70页 |
| 3.1.5 遗传转化 | 第70-72页 |
| 3.1.6 稻镰状瓶霉RNA及基因组DNA的提取 | 第72-74页 |
| 3.1.7 稻镰状瓶霉基因组DNA Southern杂交 | 第74-77页 |
| 3.2 结果与分析 | 第77-88页 |
| 3.2.1 农杆菌介导的遗传转化体系构建 | 第77-82页 |
| 3.2.2 目的基因的敲除 | 第82-88页 |
| 3.3 本章讨论 | 第88-89页 |
| 第四章 自噬相关基因的功能分析 | 第89-122页 |
| 4.1 材料与方法 | 第89-93页 |
| 4.1.1 试验菌株及培养条件 | 第89-90页 |
| 4.1.2 突变体表型分析 | 第90-91页 |
| 4.1.3 稻镰状瓶霉细胞结构观察 | 第91页 |
| 4.1.4 水稻根部与稻镰状瓶霉的共培养 | 第91-93页 |
| 4.2 结果与分析 | 第93-119页 |
| 4.2.1 H.oryzae细胞自噬基因的鉴定与敲除 | 第93-94页 |
| 4.2.2 基因同源性分析 | 第94-95页 |
| 4.2.3 基因缺失导致细胞自噬过程阻断 | 第95-102页 |
| 4.2.4 突变体菌落形态 | 第102页 |
| 4.2.5 突变体对饥饿敏感 | 第102-104页 |
| 4.2.6 突变体孢子形态、产孢量和孢子萌发率 | 第104-105页 |
| 4.2.7 基因缺失不影响对不同碳源的利用 | 第105-107页 |
| 4.2.8 突变体对H_2O_2的敏感性增强 | 第107-109页 |
| 4.2.9 突变体对不同pH的反应不明显 | 第109-110页 |
| 4.2.10 突变体对高渗离子的反应 | 第110-112页 |
| 4.2.11 突变体对不同浓度Ca~(2+)离子的敏感性 | 第112-113页 |
| 4.2.12 稻镰状瓶霉中自噬泛素系统蛋白互作验证 | 第113-115页 |
| 4.2.13 突变体对水稻生长的影响和在水稻根部的定殖情况 | 第115-119页 |
| 4.3 本章讨论 | 第119-122页 |
| 第五章 全文总结及展望 | 第122-125页 |
| 5.1 结论 | 第122-123页 |
| 5.2 后续研究工作 | 第123-125页 |
| 参考文献 | 第125-138页 |
| 附录 | 第138-141页 |
