| 摘要 | 第3-5页 |
| ABSTRACT | 第5-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-21页 |
| 1.1 引言 | 第10-11页 |
| 1.2 蛋白质小泛素化和琥珀酰化 | 第11-13页 |
| 1.2.1 蛋白质小泛素化 | 第12-13页 |
| 1.2.2 蛋白质琥珀酰化 | 第13页 |
| 1.3 计算识别蛋白质修饰位点 | 第13-16页 |
| 1.3.1 蛋白修饰位点预测的计算机语言基础 | 第15页 |
| 1.3.2 蛋白修饰位点预测网络服务构建 | 第15-16页 |
| 1.4 实验研究的主要内容 | 第16-17页 |
| 参考文献 | 第17-21页 |
| 第二章 系统分析遗传变异对蛋白质小泛素化及相关疾病的影响 | 第21-37页 |
| 2.1 引言 | 第21-22页 |
| 2.2 结果和讨论 | 第22-33页 |
| 2.2.1 构建小泛素化修饰预测模型 | 第22-23页 |
| 2.2.2 模型的比较和评估 | 第23-24页 |
| 2.2.3 识别与小泛素化相关的氨基酸变异（SUMOAMVR） | 第24-26页 |
| 2.2.4 类型一SUMOAMVR的分析 | 第26-30页 |
| 2.2.5 类型二SUMOAMVR的分析 | 第30-31页 |
| 2.2.6 类型三SUMOAMVR的分析 | 第31-32页 |
| 2.2.7 统计分析不同类型SUMOAMVR | 第32-33页 |
| 2.2.8 在线预测网络平台 | 第33页 |
| 2.3 结论 | 第33页 |
| 参考文献 | 第33-37页 |
| 第三章 SuccFind:一种新型基于特征放大策略的琥珀酰化预测工具 | 第37-43页 |
| 3.1 引言 | 第37页 |
| 3.2 材料与方法 | 第37-39页 |
| 3.2.1 数据收集及预处理 | 第37-38页 |
| 3.2.2 蛋白质序列特征 | 第38页 |
| 3.2.3 蛋白质进化特征 | 第38页 |
| 3.2.4 基于支持向量机的多重特征选择方法 | 第38-39页 |
| 3.3 结果和讨论 | 第39-42页 |
| 参考文献 | 第42-43页 |
| 第四章 蛋白组范畴内探究功能性相关的赖氨酸原位共修饰 | 第43-58页 |
| 4.1 引言 | 第43-45页 |
| 4.2 材料与方法 | 第45-46页 |
| 4.2.1 数据收集及预处理 | 第45页 |
| 4.2.2 功能富集分析 | 第45-46页 |
| 4.2.3 短期的进化分析 | 第46页 |
| 4.2.4 SuccFind和SumoPred的网站 | 第46页 |
| 4.3 结果和讨论 | 第46-54页 |
| 4.3.1 琥珀酰化更易与乙酰化发生原位共修饰 | 第46-49页 |
| 4.3.2 赖氨酸原位共修饰蛋白-蛋白相互作用网络分析 | 第49-50页 |
| 4.3.3 生化环境和亚细胞定位倾向分析 | 第50-51页 |
| 4.3.4 短期进化分析赖氨酸共修饰 | 第51-54页 |
| 4.4 结论和展望 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-58页 |
| 致谢 | 第58-59页 |
| 附录 | 第59-82页 |
| 攻读硕士学位期间的研究成果 | 第82页 |
