| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 缩略语表 | 第11-12页 |
| 第一章 前言 | 第12-21页 |
| 1 研究问题的由来 | 第12-13页 |
| 2 国内外研究综述 | 第13-20页 |
| 2.1 低氧对鱼类的影响 | 第13-14页 |
| 2.2 鱼类低氧相关基因研究进展 | 第14-17页 |
| 2.2.1 低氧应答的信号通路 | 第14-15页 |
| 2.2.2 低氧诱导因子HIF-1α | 第15-16页 |
| 2.2.3 脯氨酸羟基化酶Phd | 第16页 |
| 2.2.4 低氧诱导因子HIF-1α 抑制因子Fih | 第16-17页 |
| 2.3 SNP及其在水产动物育种中的应用 | 第17-20页 |
| 2.3.1 构建高密度遗传连锁图谱 | 第18-19页 |
| 2.3.2 性状关联分析 | 第19页 |
| 2.3.3 种群进化及亲缘关系研究 | 第19-20页 |
| 3 研究的目的及意义 | 第20-21页 |
| 第二章 团头鲂fih-1 基因的克隆表达及其与低氧性状的关联分析 | 第21-51页 |
| 第一节 团头鲂fih-1 基因的克隆和表达 | 第21-41页 |
| 1 材料与方法 | 第22-31页 |
| 1.1 样品的采集 | 第22-23页 |
| 1.1.1 实验鱼 | 第22页 |
| 1.1.2 低氧处理实验及样品采集 | 第22页 |
| 1.1.3 胚胎及胚后发育期样品的采集 | 第22-23页 |
| 1.2 主要的仪器设备及试剂 | 第23-24页 |
| 1.2.1 主要的仪器设备 | 第23页 |
| 1.2.2 主要的试剂 | 第23-24页 |
| 1.3 引物设计 | 第24-25页 |
| 1.4 总RNA的提取及反转录 | 第25-26页 |
| 1.4.1 总RNA的提取 | 第25-26页 |
| 1.4.2 总RNA的反转录 | 第26页 |
| 1.5 CDNA和启动子的扩增及序列分析 | 第26-28页 |
| 1.5.1 cDNA和启动子的扩增 | 第26-27页 |
| 1.5.2 序列分析 | 第27-28页 |
| 1.6 启动子序列分析与HRE的验证 | 第28-29页 |
| 1.6.1 PGL-3basic重组载体的构建 | 第28页 |
| 1.6.2 HEK293细胞培养及转染 | 第28-29页 |
| 1.7 荧光定量PCR | 第29-30页 |
| 1.7.1 目的片段的扩增验证 | 第29-30页 |
| 1.7.2 qRT-PCR | 第30页 |
| 1.8 数据分析 | 第30-31页 |
| 2 实验结果 | 第31-38页 |
| 2.1 团头鲂总RNA的提取 | 第31页 |
| 2.2 团头鲂fih-1 基因的克隆及序列分析 | 第31-34页 |
| 2.3 团头鲂fih-1 启动子HRE的验证 | 第34-35页 |
| 2.4 团头鲂fih-1 在胚胎发育不同时期的表达 | 第35-36页 |
| 2.5 团头鲂fih-1 在组织中的表达 | 第36-37页 |
| 2.6 团头鲂fih-1 在低氧处理过程中的表达变化 | 第37-38页 |
| 3 讨论 | 第38-41页 |
| 3.1 团头鲂fih-1 基因的结构特征分析 | 第38-39页 |
| 3.2 团头鲂fih-1 在生长发育中的重要作用 | 第39-40页 |
| 3.3 低氧处理对团头鲂fih-1 基因表达的影响 | 第40-41页 |
| 第二节 团头鲂fih-1 基因SNPs位点的筛选、鉴定及与低氧性状的关联性分析 | 第41-51页 |
| 1 前言 | 第41页 |
| 2 材料与方法 | 第41-46页 |
| 2.1 实验材料 | 第41-42页 |
| 2.2 主要仪器设备及试剂 | 第42页 |
| 2.3 酚-氯仿法提取基因组DNA | 第42-43页 |
| 2.4 总RNA的提取和反转录 | 第43页 |
| 2.5 基因SNPS位点的检测 | 第43-44页 |
| 2.6 PCR-RFLP和PCR-HRM法进行SNP分型 | 第44-46页 |
| 2.7 团头鲂fih-1 基因SNP多态性与低氧性状的关联分析 | 第46页 |
| 3 结果与分析 | 第46-50页 |
| 3.1 DNA提取结果 | 第46页 |
| 3.2 团头鲂fih-1 基因SNP的检测结果 | 第46-47页 |
| 3.3 PCR-RFLP和PCR-HRM法进行SNP分型结果 | 第47-48页 |
| 3.4 fih-1 基因SNPs与低氧性状的关联分析 | 第48-50页 |
| 4 讨论 | 第50-51页 |
| 参考文献 | 第51-63页 |
| 致谢 | 第63-64页 |
| 附录 | 第64页 |
