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本氏烟钙调素类似蛋白Nbrgs-CaM抑制转录后基因沉默的机理研究

致谢第6-8页
摘要第8-10页
Abstract第10-11页
1 绪论第16-30页
    1.1 双生病毒的发生情况与危害程度第16页
    1.2 双生病毒的分类和基因组结构第16-20页
        1.2.1 菜豆金色花叶病毒属(Begomovirus)第18-19页
        1.2.2 玉米线条病毒属(Mastrevirus)第19页
        1.2.3 甜菜曲顶病毒属(Curtovirus)第19-20页
        1.2.4 番茄伪曲顶病毒属(Topocuvirus)第20页
        1.2.5 伊朗甜菜曲顶病毒属(Becurtovirus)第20页
        1.2.6 芜菁曲顶病毒属(Turncurtovirus)第20页
        1.2.7 弯叶画眉草条纹病毒属(Eragrovirus)第20页
    1.3 菜豆金色花叶病毒属病毒betasatellite的研究进展第20-21页
    1.4 双生病毒与RNA沉默第21-28页
        1.4.1 RNA沉默机制第21-22页
        1.4.2 RNA沉默途径中的抗病毒侵染的核心蛋白第22-23页
        1.4.3 双生病毒诱发的RNA沉默第23-24页
        1.4.4 双生病毒编码的RNA沉默抑制子第24-28页
    1.5 基因沉默抑制子SGS3的研究进展第28页
    1.6 钙调素类似蛋白Rgs-CaM的研究进展第28-29页
    1.7 本项目的研究目的和研究意义第29-30页
2 实验方法第30-49页
    2.1 常规DNA克隆技术第30-37页
        2.1.1 PCR技术第30-33页
        2.1.2 PCR产物的回收第33页
        2.1.3 加A反应第33-34页
        2.1.4 连接第34页
        2.1.5 感受态细胞的制备第34-35页
        2.1.6 转化第35页
        2.1.7 菌落PCR筛选第35-36页
        2.1.8 重组质粒的提取第36页
        2.1.9 重组质粒的酶切验证第36-37页
        2.1.10 重组克隆的测序鉴定第37页
    2.2 重组质粒导入根癌农杆菌及接种第37-38页
        2.2.1 根癌农杆菌感受态细胞的制备第37页
        2.2.2 重组质粒电击转化根癌农杆菌第37-38页
        2.2.3 农杆菌的浸润接种第38页
    2.3 植物总DNA提取以及Southern blot分析第38-43页
        2.3.1 CTAB法大量抽提植物DNA的方法第38-40页
        2.3.2 CTAB法小量抽提植物DNA的方法第40页
        2.3.3 Southern印迹分析第40-43页
    2.4 植物总RNA小量提取、RT-PCR、RT-qPCR、Northern杂交第43-46页
        2.4.1 植物总RNA的小量提取第43-44页
        2.4.2 反转录RT-PCR及RT-qPCR第44-45页
        2.4.3 Northern印迹杂交第45-46页
    2.5 植物总蛋白的提取、蛋白的SDS-PAGE及Western blot杂交第46-49页
        2.5.1 植物总蛋白的提取第46页
        2.5.2 蛋白的SDS-PAGE第46-47页
        2.5.3 Western blot分析技术第47-49页
3 Nbrgs-CaM与NbSGS3互作结构域及Nbrgs-CaM抑制子结构域鉴定第49-68页
    3.1 材料与方法第49-55页
        3.1.1 实验材料第49页
        3.1.2 载体的构建第49-51页
        3.1.3 农杆菌介导的浸润与接种第51页
        3.1.4 GFP荧光记录及样品采集第51-52页
        3.1.5 Western blot分析GFP蛋白的表达量第52页
        3.1.6 Northern blot分析第52-55页
    3.2 结果与分析第55-66页
        3.2.1 ZF和2CC结构域对NbSGS3亚细胞定位很重要第55-57页
        3.2.2 ZF和2CC结构域对于NbSGS3与Nbrgs-CaM的互作很重要第57-59页
        3.2.3 EFⅠ和EFⅡ是Nbrgs-CaM与NbSGS3的互作结构域第59-61页
        3.2.4 在野生型本氏烟中鉴定Nbrgs-CaM缺失突变体的抑制子活性第61-63页
        3.2.5 在16C本氏烟中鉴定Nbrgs-CaM缺失突变体的抑制子活性第63-65页
        3.2.6 Nbrgs-CaM蛋白介导NbSGS3蛋白的降解第65-66页
    3.3 讨论第66-68页
4 全文小结第68-69页
附文 TYLCCNB编码的pC1蛋白与NbPsbP的互作机理研究第69-90页
    1 绪论第69-71页
    2 材料与方法第71-75页
        2.1 实验材料第71页
        2.2 NbPsbP沉默载体的构建第71-72页
        2.3 常温包埋样品制备以及电镜观察细胞结构第72页
        2.4 双分子荧光互补实验(Bimolecular fluorescence complementation,BiFC)第72-73页
            2.4.1 重组质粒电击转化农杆菌第72页
            2.4.2 农杆菌接种第72-73页
            2.4.3 激光共聚焦显微镜观察互作结果第73页
        2.5 酵母双杂交实验第73-74页
            2.5.1 酵母双杂交验证两种已知蛋白的互作第73-74页
            2.5.2 酵母蛋白的提取第74页
        2.6 NbPsbP总蛋白的提取及Western blot第74页
        2.7 NbPsbP总RNA提取、RT-PCR、RT-qPCR及Northern blot第74-75页
    3 结果与分析第75-90页
        3.1 TYLCCNB编码的βC1蛋白可以引起本氏烟叶绿体变形第75-77页
        3.2 TYLCCNB编码的βC1蛋白与NbPsbP蛋白互作第77-81页
            3.2.1 BiFC验证βCl蛋白与NbPsbP蛋白的互作第77-79页
            3.2.2 酵母双杂交验证pC1蛋白与NbPsbP蛋白的互作第79-81页
        3.3 NbPsbP定位于叶绿体第81-83页
        3.4 双生病毒10Aβ的侵染显著上调NbPsbP mRNA的表达量第83-84页
        3.5 βC1转基因本氏烟中NbPsbP mRNA表达量上调第84-85页
        3.6 NbPsbP基因对10Aβ病毒致病性的影响第85-88页
            3.6.1 NbPsbP基因沉默表型和沉默水平第85-86页
            3.6.2 沉默NbPsbP基因会减轻10Aβ症状并减少病毒的积累量第86-88页
        3.7 讨论第88-90页
参考文献第90-97页
附录A:本论文所用缩写词及中英文对照第97-99页
附录B:本论文所用病毒缩写及中英文对照第99-100页
附录C:常用缓冲液及培养基配方第100-105页

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